南非出现了一个极端危险的新冠病毒新变种

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CleverBeaver
如果是真的,这个证明应该只给高危人群接种,大面积接种会推动危害整个人群的新变种,包括打了疫苗的。甚至针对打了疫苗的。
Jxnc 发表于 2021-11-26 02:23

特别是最新出了一个美帝监狱的囚犯的报告 打没打完全不影响传播
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CleverBeaver
回复 182楼CleverBeaver的帖子
抗药性肯定会有,大面积使用是有可能造成selection pressure. 应该只给重症使用。
Jxnc 发表于 2021-11-26 02:16

嗯 和抗生素滥用是一个结果
t
tk_2020
感谢楼主科普
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francesjj
别人脑子好不好不知道,你的教养真的很差。
Viviennedd 发表于 2021-11-26 02:25

一个大过节诅咒别人免疫力让别人去看医生的居然说路过不平回两句的教养差。。。你这样的就直接怼回去。
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Viviennedd
一个大过节诅咒别人免疫力让别人去看医生的居然说路过不平回两句的教养差。。。你这样的就直接怼回去。
francesjj 发表于 2021-11-26 02:28

哈哈,这种教养,你觉得怼到我了?不好意思,你不配。
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CleverBeaver
但是楼主大谈是艾滋病人造成的变种,而不提到疫苗可能推动抗免疫,就有很大的误导之嫌。其实就是欺负大部分人不懂。
Jxnc 发表于 2021-11-26 02:14

手动点赞
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ellaowen
如果是真的,这个证明应该只给高危人群接种,大面积接种会推动危害整个人群的新变种,包括打了疫苗的。甚至针对打了疫苗的。
Jxnc 发表于 2021-11-26 02:23

这我觉得逻辑上有个很大的跳跃吧。。如果只有一小撮人打,变异出有类似传染能力和致死率的可能性会变低还是变高还是一样?如果没有A/B test证明会变低的话,那不是nu 也有其他的非antigenic seletion的变种可以导致很多人感染甚至死亡不是吗。。如何得出只让一小撮人打最后新冠感染率致死率一定会变小的呢? 这个感觉也没法做AB test吧。。不过至少很多毒变种都是南非变异出来 而南非的vaccination rate远低于其他没变出毒变种的国家 我这非常粗略的AB test观察觉得这结论似乎不成立啊。。
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wacxg
再说一遍,你大过节的前面让俩ID去看医生,我就是随便回两句,你这样的没资格评价我素质,恶心。
francesjj 发表于 2021-11-26 02:36

她转法轮的,素质也就那样了。不用理她。
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wacxg
怪不得,原来是法轮大法好的。很少来灌这种帖子了,谢谢提醒。
francesjj 发表于 2021-11-26 02:39

帖里还有资深五毛。和大法联合起来反疫苗,魔幻吧?
C
CleverBeaver
回复 208楼的帖子
这事和滥用抗生素的本质很类似
谷歌是这么说的
antibiotics create drug resistance? Antibiotic resistance occurs naturally, but misuse of antibiotics in humans and animals is accelerating the process. A growing number of infections – such as pneumonia, tuberculosis, gonorrhoea, and salmonellosis – are becoming harder to treat as the antibiotics used to treat them become less effective.Jul 31, 2020
最后原本很普通的病也很难治 医疗系统挤兑就更严重了
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francesjj
帖里还有资深五毛。和大法联合起来反疫苗,魔幻吧?
wacxg 发表于 2021-11-26 02:41

真魔幻。好好一个科普贴。以后lzmm科普贴选择就看楼主就好了。
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Jxnc
这我觉得逻辑上有个很大的跳跃吧。。如果只有一小撮人打,变异出有类似传染能力和致死率的可能性会变低还是变高还是一样?如果没有A/B test证明会变低的话,那不是nu 也有其他的非antigenic seletion的变种可以导致很多人感染甚至死亡不是吗。。如何得出只让一小撮人打最后新冠感染率致死率一定会变小的呢? 这个感觉也没法做AB test吧。。不过至少很多毒变种都是南非变异出来 而南非的vaccination rate远低于其他没变出毒变种的国家 我这非常粗略的AB test观察觉得这结论似乎不成立啊。。
ellaowen 发表于 2021-11-26 02:38

现在的核心问题是为什么在打疫苗低的人群里会有完整的antigenic 的 mutations. 这个是解释不通的。这个是science 不是统计。
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wahhhaha
国内也注意到这个变异了
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umizumi
所以艾滋病人养出来的蛊,但是自己都不死吗??那普通人感染了反而会死?
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lehehe123
所以艾滋病人养出来的蛊,但是自己都不死吗??那普通人感染了反而会死?
umizumi 发表于 2021-11-26 02:53

我也有同样的疑问。这是什么原理?这个Nu的致死率和delta相比如何?
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newbeginner
唉,本来我打算买口红,默默地改成买口罩了
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CleverBeaver
所以艾滋病人养出来的蛊,但是自己都不死吗??那普通人感染了反而会死?
umizumi 发表于 2021-11-26 02:53

很多非常低概率的事突然一起发生 才会这样
但为啥alpha已经是这样来的了 科学家和元首们都可以完全忽略 任由事态继续呢
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Viviennedd

这个楼主应该意在科普疫情发展吧。不好意思,顶了好多层废话。 猜测MRNA疫苗副作用之一,扰乱人体免疫,目前没有数据或者任何相关文章证明。希望看到有关内容。科学没必要回避这些正面或者负面的因素,信息透明化才能增加可信度。统计学基本的原理要有吧,出现免疫相关的疾病比往年同期的变化,疫情都快两年了,纵向比较不可能不能做。利弊都要统计,针对变种有效性的统计,对重症的统计,也要有副作用的统计分析。科学研究不能和媒体宣传一样,要有科学精神,没有否定就没有肯定。
C
CleverBeaver
But the variant’s apparent sharp rise in South Africa’s Gauteng province — home to Johannesburg — is also setting off alarm bells. Cases increased rapidly in the province in November, particularly in schools and among young people, according to Lessells. Genome sequencing and other genetic analysis from de Oliveria’s team found that the B.1.1.529 variant was responsible for all of 77 of the virus samples they analysed from Gauteng, collected between 12 and 20 November. Analysis of hundreds more samples are in the works.
感觉近期周围和huaren上阳性的例子也是上升趋势 一部分可能是seasonality 希望美帝还没有nu 哎。。。
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mRNA
现在的核心问题是为什么在打疫苗低的人群里会有完整的antigenic 的 mutations. 这个是解释不通的。这个是science 不是统计。
Jxnc 发表于 2021-11-26 02:45

那个人打过疫苗吗?
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Beau
这是香港,非常严格隔离,CCTV监控,不能走出房间。21天隔离6次核算检测。
anwenfish 发表于 2021-11-25 21:52

记得前几天还有人抱怨国内隔离过度检测?事实证明,国内抗疫成功不是没有道理的。
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shantian
艾滋病人就是标准的免疫受损啊,动不动就各种病,免疫系统基本怠工,当然干不掉病毒了
hnlaser 发表于 2021-11-25 23:50

你理解错了。层主的意思是这个病毒居然杀不死免疫受损的艾滋病人
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CleverBeaver
记得前几天还有人抱怨国内隔离过度检测?事实证明,国内抗疫成功不是没有道理的。
Beau 发表于 2021-11-26 03:11

我其实同意跑来跑去频繁的人需要频繁的测
保护大家了
反过来 打了不降低传染率的疫苗就不用测 有段时间还说打了疫苗就不用戴口罩 不是帮助推广病毒吗
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ostrakon
For the AIDS patients infected with this variant - is there a higher fatality rate?
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CleverBeaver
你理解错了。层主的意思是这个病毒居然杀不死免疫受损的艾滋病人
shantian 发表于 2021-11-26 03:13

其实楼里有同学说这变种到底怎么来的还不一定 先不用污名化hiv携带者 也很有道理的
比如纽约下水道里就测出很多奇奇怪怪的新冠变异
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.07.26.21261142v1

Tracking Cryptic SARS-CoV-2 Lineages Detected in NYC Wastewater
Tracking SARS-CoV-2 genetic diversity is strongly indicated because diversifying selection may lead to the emergence of novel variants resistant to naturally acquired or vaccine-induced immunity. To monitor New York City (NYC) for the presence of novel variants, we amplified regions of the SARS-CoV-2 Spike protein gene from RNA acquired from all 14 NYC wastewater treatment plants (WWTPs) and ascertained the diversity of lineages from these samples using high throughput sequencing. Here we report the detection and increasing frequencies of novel SARS-CoV-2 lineages not recognized in GISAID’s EpiCoV database. These lineages contain mutations rarely observed in clinical samples, including Q493K, Q498Y, H519N and T572N. Many of these mutations were found to expand the tropism of SARS-CoV-2 pseudoviruses by allowing infection of cells expressing the human, mouse, or rat ACE2 receptor. In addition, pseudoviruses containing the Spike amino acid sequence of these lineages were found to be resistant to many different classes of receptor binding domain (RBD) binding neutralizing monoclonal antibodies. We offer several hypotheses for the anomalous presence of these mutations, including the possibility of a non-human animal reservoir. Although wastewater sampling cannot provide direct inference of SARS-CoV-2 clinical sequences, our research revealed several lineages that could be relevant to public health and they would not have been discovered if not for wastewater surveillance.



s
shantian
相比这个变种的来源,我更想知道这个变种的毒性而非传染性。重症率和致死率相比delta更高还是更低。如果传染性高而毒性低低话,我个人认为真没什么好怕的
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Viviennedd
刚查了主楼引用的推,传染性超过delta,似乎已经证明了,英国四万+德国五万+的新变种病例,拦估计是拦不住了。重病率目前没有数据结论。南非在求经济援助,不知道欧美会不会帮,都是自顾不暇。
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mylittle9
唉,本来我打算买口红,默默地改成买口罩了
newbeginner 发表于 2021-11-26 02:58

我总以为快要摘口罩了,所以买了一堆口红。
都要过期了还没开始用。
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CleverBeaver
我总以为快要摘口罩了,所以买了一堆口红。
都要过期了还没开始用。
mylittle9 发表于 2021-11-26 03:39

我总以为快回去上班了 不敢搬家离开公司太远 谁知回去上班总是越推越迟
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anwenfish
刚查了主楼引用的推,传染性超过delta,似乎已经证明了,英国四万+德国五万+的新变种病例,拦估计是拦不住了。重病率目前没有数据结论。南非在求经济援助,不知道欧美会不会帮,都是自顾不暇。
Viviennedd 发表于 2021-11-26 03:37

非常困惑,我看到有新闻说英国还没有这种变种。全球才几十例。但楼主又说这个新变种挤掉delta变成南非一个省的主要case。到底哪个是正确的?这个新变种已经传染开了还是没有传染开?
如如
刚查了主楼引用的推,传染性超过delta,似乎已经证明了,英国四万+德国五万+的新变种病例,拦估计是拦不住了。重病率目前没有数据结论。南非在求经济援助,不知道欧美会不会帮,都是自顾不暇。
Viviennedd 发表于 2021-11-26 03:37

现在确认的只有80几个case吧
V
Viviennedd
楼里的内容源自南非director of CERI Tulio De Oliveira的推。英德的数据可能不对,那个跟帖不是专业人士。
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littleshew
怎么还不赶紧禁航班。
F
FLYBABY
想问一下MM, 我3月完成了2针疫苗, 9月无症状感染, 现在是否需要booster? 谢谢
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jy22
要,没看见新的变种都出来了吗?没看见两针快不算了吗?
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mRNA
非常困惑,我看到有新闻说英国还没有这种变种。全球才几十例。但楼主又说这个新变种挤掉delta变成南非一个省的主要case。到底哪个是正确的?这个新变种已经传染开了还是没有传染开?
anwenfish 发表于 2021-11-26 03:41

南非那个省本来case不多,现在增多了!希望国际范围还没有传的太开。这图还显示,南非各省本来case数都在蹭蹭降低,你们说疫苗率低。。。只有20%???🧐

j
jy22
我其实同意跑来跑去频繁的人需要频繁的测
保护大家了
反过来 打了不降低传染率的疫苗就不用测 有段时间还说打了疫苗就不用戴口罩 不是帮助推广病毒吗
CleverBeaver 发表于 2021-11-26 03:17

所以国内只测阴阳性,不查疫苗证明。
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wun
C
CleverBeaver
南非那个省本来case不多,现在增多了!希望国际范围还没有传的太开。这图还显示,南非各省本来case数都在蹭蹭降低,你们说疫苗率低。。。只有20%???🧐


mRNA 发表于 2021-11-26 04:10

据说南非感染率很高了 自然免疫也不比疫苗差
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qingcongsuiyue
回复 1楼little_racoon的帖子
我可以告诉你个一手信息:我现在香港隔离酒店,就是香港2例B1.1.529 case的酒店。第一个病例是从南非来的,11号入住,14号发现,他感染了斜对门的加拿大回来的住客,仅仅是平时拿饭或者外卖东西的时候打开门。监控发现他有时候不带口罩打开门。对门被感染的住客10号就入住了,20号发现。两人overlap就是11-14.对门住客应该是带口罩打开门的。病毒序列几乎一样。不过,隔离酒店走廊的通风不好,空气几乎静止,也许这个也是重要传染因素。两人在机场检测都是阴性,才能入住酒店。
这个传染能力也是很厉害的。
anwenfish 发表于 2021-11-25 21:18

天啊太可怕了,开门拿饭就是几秒钟的时间啊,而且两人也不会同时开门拿饭。。。这酒店其他楼层有感染吗?sars的时候好像香港一个楼感染就是通过内部排风系统。。。会不是是通过酒店内部的通风系统传染的而不是开门拿饭那点时间?
d
dllzf
能说说日本变种出的那个会自杀的病毒吗? 这个会不会也会自杀?然后就传不下去了?
somuch 发表于 2021-11-25 21:09

啥?日本还有自杀病毒 连他们的衍生病毒都爱自杀?????
公用马甲48
要,没看见新的变种都出来了吗?没看见两针快不算了吗?
jy22 发表于 2021-11-26 04:09

Fauci Moves The Goal Posts AGAIN; ”We Don’t Know How Long The Booster Effect Is Going To Last” https://patriotfetch.com/2021/11/watch-fauci-moves-the-goal-posts-again-we-dont-know-how-long-the-booster-effect-is-going-to-last/?utm_source=Papa
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meraviglia
非常困惑,我看到有新闻说英国还没有这种变种。全球才几十例。但楼主又说这个新变种挤掉delta变成南非一个省的主要case。到底哪个是正确的?这个新变种已经传染开了还是没有传染开?
anwenfish 发表于 2021-11-26 03:41

你引用的层主说的不对。
目前欧洲包括英国和德国流行的是 Delta plus, 下一波可能会是新的南非变种 Nu 。
l
lshmmsy
不好意思thanksgiving带来的是这么不好的消息。。。南非出现了一个非常危险的新变种B1.1.529,接下来很快会被WHO命名为nu变种,这个变种很可能是目前已经知道的最厉害的vaccine escape variant。南非这个地方疫苗覆盖率很低,艾滋病人又很多,这个变种不是慢慢演化出来的,而是突然间积累了大量危险的突变,很可能是在一个免疫受抑制的艾滋病人身上通过一次长期感染演化出来的。
我会在这个帖子里面不断更新关于nu变种的研究进展。这个有可能有更强毒力和传染性的新变种是全人类的巨大威胁,不管你是支持还是反对疫苗,恳请大家理智讨论,想撕的到别的地方去撕,想讨论政治/阴谋论的去别处讨论,恕不奉陪。
先上一张图,数数看这个nu变种有多少突变,有多少发生在RBD和NTD上面。RBD是病毒和ACE2受体结合的地方,NTD有大量中和抗体的结合位点,这两个地方的突变一般都很不好。另外值得注意的是nu变种有两个在furin酶切位点上的突变,其中有一个已经知道明显增强了delta的毒力,另外一个的效应还不清楚。所以基本上可以肯定这个毒株的毒力会大于去年的出现变种之前的wild type。RBM上面有这么多密密麻麻的突变,让我甚至都有一些怀疑这个变种是不是出现了结合其他受体的能力,如果是的话在传染性和毒力方面不确定性会更多,更加危险。

这个变种突然间引起大家关注是因为它在南非Gauteng省迅速占据了主导地位,把不可一世的delta给挤走了,看下面的图。当然南非这个地方测序很少,发现这个nu变种以后才集中开始在这个地方测序,所以这个图有一定测序方面的bias。另外南非的delta wave刚刚过去,大批人前几个月感染了delta,现在疫情正在低谷,新变种如果有一定逃逸能力的话很容易在数量上占优势。所以不能乱下结论说nu变种是不是真的相对于delta有着这么大的进化优势。


这个突变对疫苗的影响有多大呢?如果你是火坑专业出身的话,推荐自己去读一下Jesse Bloom的这个twitter thread https://twitter.com/jbloom_lab/status/1464005708257513474

如果不是生物专业出身的话看下面的图,纵轴是escape的潜力。这个nu变种身上有4个逃逸能力非常强的突变,还有4个逃逸能力中等的突变,现在已知这些突变能够影响到中和能力最强的全部三类抗体。目前还没有体外中和的数据,但是可以肯定这个nu变种对疫苗的有效率和单抗药物都会带来很严重的影响。
那么,疫苗是不是就彻底没用了呢?我认为不是。从突变位置来看,可以肯定疫苗诱导的体液免疫会受到影响,只是个严重程度的问题,Jesse Bloom在twitter里面认为这个变种要完全逃脱疫苗诱导的体液免疫是仍然很困难的。体液免疫之外还有识别能力更强的细胞免疫,这个nu变种仍旧很难逃脱T细胞的识别。细胞免疫肯定是不能防止传染的,但是只要T细胞能够很快识别病毒开始”训练“B细胞和杀死被感染的细胞,发展到重症的可能性就会大幅降低。最后,打过三针疫苗的人或者自然感染后再打疫苗的人抗体亲和力很高,这种高亲和力的抗体可以在一定程度上抵消突变带来的影响。一个佐证是在下面这篇文章里面,人们把最厉害的20个突变全部做到spike protein上面,然后发现这样的病毒可以几乎完全逃脱自然感染或者接种疫苗后的血清,但是仍然逃不过自然感染后再接种疫苗的人的血清。
https://www.nature.com/articles/s41586-021-04005-0
我觉得我们最需要关注的其实是这个毒株的传染能力,之前免疫逃逸很厉害的毒株其实是有过好几个的,比如beta毒株,mu毒株,还有A.30什么的,但是在传染性超强的delta面前,这些毒株纷纷都灭绝了。现在流行的delta厉害的地方在传染性,逃逸能力还算是manageable的,一个两年前武汉毒株做的疫苗第三针一打马上就能恢复90%+的有效率。从目前非常有限的信息来看,这些突变和ACE2受体的结合能力似乎没有非常显著的增强,但是传染能力到底怎么样,主要还是要看现实世界的流行病学调查,在这之前,各国现在最应该做的是第一时间切断和南非及其邻国之间的所有国际旅行。
little_racoon 发表于 2021-11-25 21:02

已经批的单抗可能都逃不掉,还要还有两个in clinical trial的广谱单抗应该还能抵抗这个变种,Vir的和Adagio的
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Rxy51
回复 1楼little_racoon的帖子
我可以告诉你个一手信息:我现在香港隔离酒店,就是香港2例B1.1.529 case的酒店。第一个病例是从南非来的,11号入住,14号发现,他感染了斜对门的加拿大回来的住客,仅仅是平时拿饭或者外卖东西的时候打开门。监控发现他有时候不带口罩打开门。对门被感染的住客10号就入住了,20号发现。两人overlap就是11-14.对门住客应该是带口罩打开门的。病毒序列几乎一样。不过,隔离酒店走廊的通风不好,空气几乎静止,也许这个也是重要传染因素。两人在机场检测都是阴性,才能入住酒店。
这个传染能力也是很厉害的。
anwenfish 发表于 2021-11-25 21:18

感染症状是什么
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meraviglia
默克的 covid pill 三期结果公布,有效率只有30% (中期是50%), 这还是对 Delta 的数据,所以在实战中对付新变种有效率只会更差,基本没什么用。
现在就看辉瑞的 Covid pill 了,希望辉瑞别再有弄虚作假或夸大其词。
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claireliu
感染症状是什么
Rxy51 发表于 2021-11-26 07:41

没啥症状,不用太担心,刚查了一下香港现在总共病历40多,没有严重的,就是每天三个五个输入来的。另外隔离酒店房间内都是负压的,一般不会交叉感染,只有走廊是没有负压。最开始测出来那人在酒店跑步机跑步,出门拿饭没带口罩,据说运动后病毒量大一些。
不过这波估计光谱,灭活更好使。
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nj_guy
但是楼主大谈是艾滋病人造成的变种,而不提到疫苗可能推动抗免疫,就有很大的误导之嫌。其实就是欺负大部分人不懂。
Jxnc 发表于 2021-11-26 02:14

如果抗免疫变异是疫苗造成的,那变异是不是应该首先发生在疫苗接种率高的国家?南非的疫苗接种率大约为25%,不到欧美国家的三分之一。
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babeann
哎, 真是没完了 现在大家holiday travel都正常了,估计还有一大波感染要来了
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little_racoon
默克的 covid pill 三期结果公布,有效率只有30% (中期是50%), 这还是对 Delta 的数据,所以在实战中对付新变种有效率只会更差,基本没什么用。
现在就看辉瑞的 Covid pill 了,希望辉瑞别再有弄虚作假或夸大其词。
meraviglia 发表于 2021-11-26 08:24

核苷类似物不太怕新变种
这个药的主要问题在别的方面,我记得以前发过一个帖子
R
Rxy51
所以,疫苗专家要预测第四针了么?管不管用,就是一直打下去!看副作用和病毒哪个先限制人类增员。
Viviennedd 发表于 2021-11-25 22:07

嗯 估计也就这样下去了。 没别的办法唉
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little_racoon
不明白楼主没什么不提到,其实bloom认为antigenic selection might play substantial role. Trevor的那个chronic disease的解释不能解释为什么这么多的antigenic mutations. 也就是说,疫苗很有可能起了大的推动作用。是不是有fake news之嫌。
“selection on variants so far may be dominated more by transmissibility than antigenic selection (https://twitter.com/trvrb/status/1462816217794695170…). But I''m not as sanguine that antigenic selection isn''t also playing substantial role...“
Jxnc 发表于 2021-11-26 00:12

南非的疫苗覆盖率只有可怜的20%多,同时刚刚经历了一波大的delta wave,自然感染率已经非常高了,所以这个选择压力很明显是来自delta而不是疫苗。如果选择压力来自疫苗的话这个变种应该首先出现在欧洲才对。
为什么连续两个疫苗逃逸特别厉害的变种(nu和beta)都出现在南非这个小国,他们还有个C1.2看起来也不是善茬,是有原因的
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little_racoon
11月26日更新。今天欧洲各国纷纷严格限制来自南非的航班。美国这边的反应是什么呢?Fauci说we must study data before deciding travel ban。。。 又让我想起了去年二月CDC天天念叨的"the risk is very very low“。看看RBD上面有多少突变就知道,在最坏的情况下,这个变种完全可以让过去一年半以来的pandemic重新走一遍,哪有时间让你去study data?!
https://www.bloomberg.com/news/articles/2021-11-26/u-s-needs-data-on-variant-before-limiting-flights-fauci-says
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jessiepooh
是啊。这病毒真是没完没了了……什么时候是个头啊
J
Janaina
看得心里哇凉哇凉的,什么时候才能恢复正常啊。。。。
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miavita
11月26日更新。今天欧洲各国纷纷严格限制来自南非的航班。美国这边的反应是什么呢?Fauci说we must study data before deciding travel ban。。。 又让我想起了去年二月CDC天天念叨的"the risk is very very low“。看看RBD上面有多少突变就知道,在最坏的情况下,这个变种完全可以让过去一年半以来的pandemic重新走一遍,哪有时间让你去study data?!
https://www.bloomberg.com/news/articles/2021-11-26/u-s-needs-data-on-variant-before-limiting-flights-fauci-says
little_racoon 发表于 2021-11-26 08:48

Sigh, 美国这些官僚把 absence of evidence 当作 evidence of absence真是无语了。 我是100%的川黑, 但是不得不说他去年果断断了中国的travel是总统生涯的一个highlight
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dukenyc125
Sigh, 美国这些官僚把 absence of evidence 当作 evidence of absence真是无语了。 我是100%的川黑, 但是不得不说他去年果断断了中国的travel是总统生涯的一个highlight
miavita 发表于 2021-11-26 08:51

没用啊,没断欧洲,应该全断
六合彩
哎, 真是没完了 现在大家holiday travel都正常了,估计还有一大波感染要来了
babeann 发表于 2021-11-26 08:34

觉得是的,等一月新年后估计数字会上升
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dukenyc125
不好意思thanksgiving带来的是这么不好的消息。。。南非出现了一个非常危险的新变种B1.1.529,接下来很快会被WHO命名为nu变种,这个变种很可能是目前已经知道的最厉害的vaccine escape variant。南非这个地方疫苗覆盖率很低,艾滋病人又很多,这个变种不是慢慢演化出来的,而是突然间积累了大量危险的突变,很可能是在一个免疫受抑制的艾滋病人身上通过一次长期感染演化出来的。
我会在这个帖子里面不断更新关于nu变种的研究进展。这个有可能有更强毒力和传染性的新变种是全人类的巨大威胁,不管你是支持还是反对疫苗,恳请大家理智讨论,想撕的到别的地方去撕,想讨论政治/阴谋论的去别处讨论,恕不奉陪。
先上一张图,数数看这个nu变种有多少突变,有多少发生在RBD和NTD上面。RBD是病毒和ACE2受体结合的地方,NTD有大量中和抗体的结合位点,这两个地方的突变一般都很不好。另外值得注意的是nu变种有两个在furin酶切位点上的突变,其中有一个已经知道明显增强了delta的毒力,另外一个的效应还不清楚。所以基本上可以肯定这个毒株的毒力会大于去年的出现变种之前的wild type。RBM上面有这么多密密麻麻的突变,让我甚至都有一些怀疑这个变种是不是出现了结合其他受体的能力,如果是的话在传染性和毒力方面不确定性会更多,更加危险。

这个变种突然间引起大家关注是因为它在南非Gauteng省迅速占据了主导地位,把不可一世的delta给挤走了,看下面的图。当然南非这个地方测序很少,发现这个nu变种以后才集中开始在这个地方测序,所以这个图有一定测序方面的bias。另外南非的delta wave刚刚过去,大批人前几个月感染了delta,现在疫情正在低谷,新变种如果有一定逃逸能力的话很容易在数量上占优势。所以不能乱下结论说nu变种是不是真的相对于delta有着这么大的进化优势。


这个突变对疫苗的影响有多大呢?如果你是火坑专业出身的话,推荐自己去读一下Jesse Bloom的这个twitter thread https://twitter.com/jbloom_lab/status/1464005708257513474

如果不是生物专业出身的话看下面的图,纵轴是escape的潜力。这个nu变种身上有4个逃逸能力非常强的突变,还有4个逃逸能力中等的突变,现在已知这些突变能够影响到中和能力最强的全部三类抗体。目前还没有体外中和的数据,但是可以肯定这个nu变种对疫苗的有效率和单抗药物都会带来很严重的影响。
那么,疫苗是不是就彻底没用了呢?我认为不是。从突变位置来看,可以肯定疫苗诱导的体液免疫会受到影响,只是个严重程度的问题,Jesse Bloom在twitter里面认为这个变种要完全逃脱疫苗诱导的体液免疫是仍然很困难的。体液免疫之外还有识别能力更强的细胞免疫,这个nu变种仍旧很难逃脱T细胞的识别。细胞免疫肯定是不能防止传染的,但是只要T细胞能够很快识别病毒开始”训练“B细胞和杀死被感染的细胞,发展到重症的可能性就会大幅降低。最后,打过三针疫苗的人或者自然感染后再打疫苗的人抗体亲和力很高,这种高亲和力的抗体可以在一定程度上抵消突变带来的影响。一个佐证是在下面这篇文章里面,人们把最厉害的20个突变全部做到spike protein上面,然后发现这样的病毒可以几乎完全逃脱自然感染或者接种疫苗后的血清,但是仍然逃不过自然感染后再接种疫苗的人的血清。
https://www.nature.com/articles/s41586-021-04005-0
我觉得我们最需要关注的其实是这个毒株的传染能力,之前免疫逃逸很厉害的毒株其实是有过好几个的,比如beta毒株,mu毒株,还有A.30什么的,但是在传染性超强的delta面前,这些毒株纷纷都灭绝了。现在流行的delta厉害的地方在传染性,逃逸能力还算是manageable的,一个两年前武汉毒株做的疫苗第三针一打马上就能恢复90%+的有效率。从目前非常有限的信息来看,这些突变和ACE2受体的结合能力似乎没有非常显著的增强,但是传染能力到底怎么样,主要还是要看现实世界的流行病学调查,在这之前,各国现在最应该做的是第一时间切断和南非及其邻国之间的所有国际旅行。
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11月26日更新。今天欧洲各国纷纷严格限制来自南非的航班。美国这边的反应是什么呢?Fauci说we must study data before deciding travel ban。。。 又让我想起了去年二月CDC天天念叨的"the risk is very very low“。看看RBD上面有多少突变就知道,在最坏的情况下,这个变种完全可以让过去一年半以来的pandemic重新走一遍,哪有时间让你去study data?!
https://www.bloomberg.com/news/articles/2021-11-26/u-s-needs-data-on-variant-before-limiting-flights-fauci-says


little_racoon 发表于 2021-11-25 21:02

断航没用的,当时也断了印度,还不是传遍了
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commander
谢谢小浣熊妹妹发帖。昨天看新闻这个nu很可怕
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jakon
断航没用的,当时也断了印度,还不是传遍了
dukenyc125 发表于 2021-11-26 08:55

断航可以有准备时间,在更了解病毒的情况下做准备,而不是2020年那样以为一切正常然后突然疯狂死人
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coalpilerd
断航没用的,当时也断了印度,还不是传遍了
dukenyc125 发表于 2021-11-26 08:55

因为断晚了。断航之前印度那边已经闹得很凶了,飞美国的航班全都满员。
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brokencliche
还要等几周才会有更多数据和结论。
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cloverain
欧洲都在禁飞,拜登啥都没动静?无语了,欧洲疫情最严重的时候要取消对欧洲的限制,现在nu 来了,也不知道第一时间保护国民。我简直不知道为啥那么多人会觉得白等比川普能抗疫,明显就是都差不多嘛!川普至少顶住压力第一时间把中国给禁飞了,拜登跟着欧洲做都做不来。
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LauritaBB
非洲又是艾滋又是伊波拉病毒,跟新冠都挤一个宿主身上长期共存, 不定能造出啥超强病毒啥都不好使
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Ruth
欧洲都在禁飞,拜登啥都没动静?无语了,欧洲疫情最严重的时候要取消对欧洲的限制,现在nu 来了,也不知道第一时间保护国民。我简直不知道为啥那么多人会觉得白等比川普能抗疫,明显就是都差不多嘛!川普至少顶住压力第一时间把中国给禁飞了,拜登跟着欧洲做都做不来。
cloverain 发表于 2021-11-26 09:13

几个国家限制几个国家不限,白搭啊。
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lshmmsy
想问一下MM, 我3月完成了2针疫苗, 9月无症状感染, 现在是否需要booster? 谢谢
FLYBABY 发表于 2021-11-26 04:02

可以等几个月以后再打,比如6个月
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Melaniejj9991
唉,这日子没法过了!
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chicagooooo
回复 256楼cloverain的帖子
这有什么解释不了的,你就想想如果疫情好转了,美国经济会怎么样。美国的特权阶级现在就是要疫情持续下去,才有合理理由印钱,托股市,钱最后不也回流到特权阶级手里吗?真的,坏透了。这个和tax没有本质区别,中产买单,不顾穷人死后,富人得利。
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shanexiaohuang
记得前几天还有人抱怨国内隔离过度检测?事实证明,国内抗疫成功不是没有道理的。
Beau 发表于 2021-11-26 03:11

国内是只要不是新冠死,管你怎么死。完全不计其他代价
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star1991
疫苗对新变种有用吗?感觉对delta都没很大用的样子
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msqs
欧洲都在禁飞,拜登啥都没动静?无语了,欧洲疫情最严重的时候要取消对欧洲的限制,现在nu 来了,也不知道第一时间保护国民。我简直不知道为啥那么多人会觉得白等比川普能抗疫,明显就是都差不多嘛!川普至少顶住压力第一时间把中国给禁飞了,拜登跟着欧洲做都做不来。
cloverain 发表于 2021-11-26 09:13

殊途同归,现在都觉得it’s just a flu
小妖精
断航没用的,当时也断了印度,还不是传遍了
dukenyc125 发表于 2021-11-26 08:55

那是拖了很久之后才禁的,太晚了。难道这波还要再重复一次老路?这届政府不是说要积极抗疫的吗?!难道只是选举口号?
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msqs
那是拖了很久之后才禁的,太晚了。难道这波还要再重复一次老路?这届政府不是说要积极抗疫的吗?!难道只是选举口号?
小妖精 发表于 2021-11-26 09:40

抗什么抗,我们这里已经宣布胜利了,因为疫苗的出色效应和超高接种率,由pandemic阶段正式进入endemic阶段,口罩、隔离、测试都不用了,两党终于达成了共识😂
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annaide
那是拖了很久之后才禁的,太晚了。难道这波还要再重复一次老路?这届政府不是说要积极抗疫的吗?!难道只是选举口号?
小妖精 发表于 2021-11-26 09:40

不然你以为呢,今年美国新冠死亡人数已经超过去年了,媒体集体封口就好了
https://www.wsj.com/amp/articles/bidens-covid-death-milestone-biden-administration-trump-11637708781
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roxyfoxy
病毒在不打疫苗的人身上不断的进化,疫苗的努力就白费了 打不打疫苗逐渐变为不可调和,你死我活的阶级斗争,lol
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Creekrhino
所以艾滋病人养出来的蛊,但是自己都不死吗??那普通人感染了反而会死?
umizumi 发表于 2021-11-26 02:53

是的。因为艾滋病毒会通过CCR5入侵免疫系统。CCR5是导致新冠病人免疫风暴死亡的主因。因为CCR5被HIV占了,就不容易产生免疫风暴,所以艾滋病人得了新冠不容易死的,进而成了最好的蛊。印度的delta也可能是艾滋病人蛊出来的。
心想事成2021
速度在cvs预约booster
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star1991
那是拖了很久之后才禁的,太晚了。难道这波还要再重复一次老路?这届政府不是说要积极抗疫的吗?!难道只是选举口号?
小妖精 发表于 2021-11-26 09:40

记得就是拖了好一阵,印度已经很厉害了,我老公还去拜登的什么网站留言叫禁航,后来禁航令出来,还不是立即执行,还拖了几天。
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jakon
病毒在不打疫苗的人身上不断的进化,疫苗的努力就白费了 打不打疫苗逐渐变为不可调和,你死我活的阶级斗争,lol
roxyfoxy 发表于 2021-11-26 09:47

把打了疫苗产生不了抗体的都干掉?
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crowncaprice
回复 265楼小妖精的帖子
民主党从来就是口号喊得山响, 要解决各种宏大的问题,从社会不公到气候变暖, 但他们无法保证边境安全,无法解决港口的低效, 无法收缴黑帮毒贩手里的枪支。 长期被民主党全面把持的地区 (行政到立法都是长期绝对优势那种, 所以别说其他人使坏), 大部分是啥样大家都清楚。 他们解决问题的方案其实一直以来没太大变化,韭菜们要多交税好让我解决经济问题, 韭菜们不要拥枪了好让我解决治安问题,韭菜们再谦让一下上学,工作升职的机会我就能解决社会公平的问题, 我不知道你们信不信, 我反正信了
共和党耍嘴炮的也很多, 尤其在联邦这一层, 但地方上干实事的还是比较多。
s
sunsun1437
没完没了了。。。。。
ripples23 发表于 2021-11-25 21:30


这要多谢强过
J
Jxnc
回复 244楼little_racoon的帖子
看看进化树,这个variant和delta关系很远。
群体免疫和疫苗免疫选择的变异,都可能。但是这个影响有可能是间接的通过种群环境。这更说明用疫苗和COVID赛跑注定要失败的,而且疫苗的作用在进化上看很可能是负面的。


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pevcmao
测六次核酸是真的, 什么CCTV 监控, 不能走出房间, 呵呵,只能说真能编啊。香港现在根本没有隔离, 只是核酸检测。
p.s. 家人这个月初刚回香港。
无聊也是聊 发表于 2021-11-25 22:16

香港是有隔离的,内地去的可能没有,海外的都有
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yaoyao_yuanyuan
为什么变种总是从南非开始?这个国家在过来方面就好像失控了一样。
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xiayitong
马克 谢谢小浣熊每次的科普 看完马上取消了圣诞出游计划…
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cannie
病毒在不打疫苗的人身上不断的进化,疫苗的努力就白费了 打不打疫苗逐渐变为不可调和,你死我活的阶级斗争,lol
roxyfoxy 发表于 2021-11-26 09:47

你说错了, 疫苗不能阻止传染就相当于加速生产能够逃逸的病毒
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kingboo
回复 1楼little_racoon的帖子
我可以告诉你个一手信息:我现在香港隔离酒店,就是香港2例B1.1.529 case的酒店。第一个病例是从南非来的,11号入住,14号发现,他感染了斜对门的加拿大回来的住客,仅仅是平时拿饭或者外卖东西的时候打开门。监控发现他有时候不带口罩打开门。对门被感染的住客10号就入住了,20号发现。两人overlap就是11-14.对门住客应该是带口罩打开门的。病毒序列几乎一样。不过,隔离酒店走廊的通风不好,空气几乎静止,也许这个也是重要传染因素。两人在机场检测都是阴性,才能入住酒店。
这个传染能力也是很厉害的。
anwenfish 发表于 2021-11-25 21:18

如果空气一直流动,会不会更多人传染呢?
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vitd120
Fauci Moves The Goal Posts AGAIN; ”We Don’t Know How Long The Booster Effect Is Going To Last” https://patriotfetch.com/2021/11/watch-fauci-moves-the-goal-posts-again-we-dont-know-how-long-the-booster-effect-is-going-to-last/?utm_source=Papa

公用马甲48 发表于 2021-11-26 07:02

In fauci we trust

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CleverBeaver
如果抗免疫变异是疫苗造成的,那变异是不是应该首先发生在疫苗接种率高的国家?南非的疫苗接种率大约为25%,不到欧美国家的三分之一。
nj_guy 发表于 2021-11-26 08:34

那些国家测的厉害 我们不测就没有呗
C
CleverBeaver
回复 244楼little_racoon的帖子
看看进化树,这个variant和delta关系很远。
群体免疫和疫苗免疫选择的变异,都可能。但是这个影响有可能是间接的通过种群环境。这更说明用疫苗和COVID赛跑注定要失败的,而且疫苗的作用在进化上看很可能是负面的。



Jxnc 发表于 2021-11-26 10:30

delta和nu感觉根本不相干… 怎么会是delta促使了nu
lz也太外行了

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vitd120
抗什么抗,我们这里已经宣布胜利了,因为疫苗的出色效应和超高接种率,由pandemic阶段正式进入endemic阶段,口罩、隔离、测试都不用了,两党终于达成了共识😂
msqs 发表于 2021-11-26 09:43

七月不就已经胜利了吗?
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kingboo
是的,美国这么多确诊,艾滋也不少,没听说美国有啥变种
果小小 发表于 2021-11-25 21:53

全世界没有哪个国家像美国这样买了这么多疫苗了,当年疫苗还没出来的时候,Trump政府每个牌子都预定了巨量
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cannie
delta和nu感觉根本不相干… 怎么会是delta促使了nu
lz也太外行了


CleverBeaver 发表于 2021-11-26 10:49

是的, 这个nu跟不同的病毒差不多了
c
cannie
七月不就已经胜利了吗?
vitd120 发表于 2021-11-26 10:50

对啊, 不是宣布马上疫情over了吗
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loveccc
打所谓的疫苗不会形成记忆T细胞和记忆B细胞 只有自然感染的才有
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nj_guy
那些国家测的厉害 我们不测就没有呗
CleverBeaver 发表于 2021-11-26 10:47

所以你的意思是:
南非疫苗打的少测的多,所以才发现变异?而欧美国家疫苗打的很多,其实有很多很多疫苗引起的变异,但欧美国家不测所以没有发现?
你真的这样认为吗?我是佩服你们这些反疫苗人士的清奇思路。
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crowncaprice
回复 286楼kingboo的帖子
这个算是给疫苗研发风险兜底