可惜说服他们太难,按我的方法(已经传给他),100个检验员,30台实时PCR机器一天可检3万。
我明白他们拘泥于安全等级检测,怕污染。
管事的人不懂行,懂行的不管事。2万多的疑是病人降不下来。
两天可以变成两小时,确诊武汉肺炎的检测无需高级生物实验室
作者:杨别青
武汉封城已进入第四天, 综合前期的新闻和自媒体报道,武汉人肺炎爆发后面临看病难,住院难,确诊难。
1. 看病难
截至2020年1月25日24时,中国国家卫健委收到30个省(区、市)累计报告确诊病例1975例,现有重症病例324例。累计死亡病例56例,累计治愈出院病例49例。现有疑似病例2684例。
解读中国国家卫健委这些数字,确诊病例应该是指临床表现(咳嗽,呼吸困难或发热),血检血氧饱和度低,影像检查提示肺炎(胸片或CT),病毒核酸检测阳性。疑似病例应该是与病人有接触或到过高危区,有临床表现和影像结果提示肺炎,但尚未做核酸检测或病毒核酸阴性。
让武汉广大医护人员疲于奔命的应该是大量的就诊人数,这个人数没有公布,但应该是疑似病例的10至100倍。
解决看病难的关键在于简化就诊过程,患者分流和分检,增加医护人员。
随着全国各地支援的医护人员的到达,医护人员紧缺的状况得到缓解。封城后,武汉的出租车被组织起来运送大医院的就诊人员到空余的医院, 患者分流已经做了。
分检就是将非新型冠装病毒感染(普通发热感冒等)与新型冠装病毒感染病人分开。这个还需要改进,主要靠快速拍胸片(CT)和取样做病毒核酸检测。
简化就诊过程就是减少患者等待时间,减少病人诊疗过程中在狭小空间互相传染的机会, 这个也需要改进。
2. 住院难
作为1000人口的大城市,武汉市至少有5所三级甲等医院, 61家医院合起来具有收住10万以上病人的能力, 但各医院能接收新型冠装病毒感染病人相应科室为呼吸科,床位有限。传染病医院只有两家,等待确诊的疑似病患和确诊的病人占用隔离病床,总数有近5000人,造成武汉医院人满为患。
新华社武汉1月25日报道"武汉在早期两家定点医院和61家发热门诊的基础上,第一批、第二批、第三批分别征用7家、3家、14家综合医院,参照感染性疾病防治机构的基本要求,临时改造成为发热病人收治医院。目前收治疑似和确诊病例的床位达4000余张,另6000余张床位将于本月底前提供使用"。
所以本月底住院难的情况会有所改善。
3. 确诊难
确诊的关键在于应用针对新型冠状病毒研发的检测试剂盒。是不是试剂盒来不及供应呢?非也。据报道,
"三家生物科技企业上海辉睿生物、上海捷诺生物、上海伯杰医疗已被国家卫健委确定为武汉新型冠状肺炎病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒的供应商. 目前上海辉睿生物已向各地供应了五六万人份的2019-nCoV检测试剂盒,目前工厂每天可生产2万人份了;上海捷诺生物截至1月16日已生产1500盒共7.5万人份,发出1000盒,能检测5万人份,目前产能达到每日生产三批,共约5万人份。"
武汉市卫生健康委员会官方网站在 1 月 23 日发布了《武汉市卫生健康委关于市民关心的几个问题的答复》,其中提及了确诊难这个关键问题。"武汉卫健委回答了个中原因受限于具备相应防护级别的生物安全实验室的数量,检测速度慢,每天只能检测样本 200 多份。经专家组会诊后确认疑似病例并采样,由辖区疾控中心将样本转运到市疾控中心,市疾控中心转运到省疾控中心进行核酸检测,每天可检测样本 200 多份。(1 月 16 日之前湖北省没有试剂盒,还需要送到国家指定的检测机构进行病毒分离和核酸检测),预计从采样开始到结果返回,当前约需要 2 天左右的时间(1 月 16 日之前,样本需送到北京国家指定的检测机构,结果返回约需要 3 5 天)。" 武汉卫健委表示,"从 1 月 22 日开始,武汉市已指定各定点救治医院、发热定点诊疗医院的对口帮扶医院以及市疾控中心等具备相应防护级别的生物安全实验室开展相关样本的病原核酸检测工作(第一批共 10 家机构),预计全部运行起来每天可检测样本近 2000 份。为此,武汉市计划紧急调运 3 万人份试剂盒发放到指定检测机构,目前已下发 6000 人份。"
分析以上三难中的关键因素,脖子卡在每天病毒核酸检测的数量和等待时间,其中生物安全实验室的数量最为重要, 也是目前亟待改进的地方。1月16日以后武汉市每天可检测样本数近200份. 从采样到结果需要2天的时间,这样造成不是所有待检患者都得到检测以及疑似病例积累过多。每天200份相当于一个技术员8小时的工作量,效率实在太低了。一个高安全等级的实验室也至少可以配置5 个技术员,这样每天至少检测1000份样品。
4. 怎么改进
病毒核酸检测试剂研发难不难?不难。"在国家疾控得到武汉新型冠状肺炎病毒基因序列后,多家企业随即响应要求进行病毒核酸检测试剂的开发,并大多在24小时之内就完成了开发任务"。
过程繁不繁?不繁。"检测目前从患者样本提取病毒核酸大概需要半小时,试剂检测大多在一个半小时以内(RT-PCR),算下来一般一个样本检测可在两小时内完成"。
检测准不准?准。"各地疾控反馈数据显示,目前几个2019-nCoV病毒核酸检测试剂盒在临床实际的准确率均为100%,没有出现漏检与假阳性"。
那么2小时的检测为何需要等待两天? 高等级防护级别生物安全实验室限制了我们的检测能力和想象力。
从防护归类看,中国国家卫生健康委员会周一发出2020年第1号公告,将新型冠状病毒感染的肺炎纳入法定传染病乙类管理,并采取甲类传染病的预防、控制措施,说明检测不需要高等级防护级别生物安全实验室.
从新型冠装病毒的生物属性看, 56度处理30分钟或70%酒精处理就能灭活,所以样品检测不需要防护级别生物安全实验室, 只需普通生物实验室加上样品检测后灭活病毒。
在我看来,一个普通生物实验室,一个检验员和一台PCR仪器,大概一天可以处理200个血样,100个检验员就是20000个。 如果由有经验的科研人员或医疗人员把关训练半天,医学院学生或生物学本科或研究生都可以成为这样的检验员。
如果武汉政府能够采纳这个建议,可以大大加快确诊的过程,也能促进武汉早日解封。
1-26-2020
参考:https://www.jiemian.com/article/3900083.html
按说有positive 和 negative control,再加上multiplex,RT PCR应该是能保证质量的。会不会假阴性原因是病毒浓度不够高?要不要想办法提高一下病毒浓度?假阴性是蔓延的最大威胁。这些人还能出去接触和感染人。
影响因素包括
1.刮的位置和手法
2.运输过程降解
3. 病毒感染在下呼吸道
标准是CT以下阳性
有病治病,无病预防。可全民使用,一周解决问题。
虽然麻烦一点,但实际上提高效率,一次就解决问题,不用两三次才能确诊。
当然我早已建议做作为补充,原因在于血液不是病毒最易感的细胞,虽然肺的血供很丰富。
那不是用血测更好吗?不知道你有没有办法联系一下美国有病毒的医院,和他们合作,至少让他们研究一下取样不同的结果。最好找两个或以上的Lab看看结果是否一至。他们这边有时间做得可能会细致些。
另外,想起李医生的例子。他开始检测是阴性,应该是病毒浓度不够。浓度高了变阳性。阳性后治疗,转假阴性,以为没事了。病毒反弹不可控制。我这肯定是瞎猜了。
这个病有可能自愈,那么做为医者,就应该想方设法去促进人体的自愈本能,激发病人的自身免疫机制。
如果真正找到了特效药,譬如瑞德西韦特效了,再用它挽救危重病人,再使用对抗疗法。
我是做植物病毒检测和脱毒的,多数病毒都是系统性感染。有些植物病毒会导致过敏性坏死,病毒才局现于坏死区域。动物有各种体液,到形成症状,不知有多少病毒被复制出来,通过各种循环系统,应该要比植物病毒好检测的多。而且我植物病毒检测取样要比咽试子少得多,在莖尖分生组织培养的早期就取样。
可惜说服他们太难,按我的方法(已经传给他),100个检验员,30台实时PCR机器一天可检3万。
我明白他们拘泥于安全等级检测,怕污染。
管事的人不懂行,懂行的不管事。2万多的疑是病人降不下来。
两天可以变成两小时,确诊武汉肺炎的检测无需高级生物实验室
作者:杨别青
武汉封城已进入第四天, 综合前期的新闻和自媒体报道,武汉人肺炎爆发后面临看病难,住院难,确诊难。
1. 看病难
截至2020年1月25日24时,中国国家卫健委收到30个省(区、市)累计报告确诊病例1975例,现有重症病例324例。累计死亡病例56例,累计治愈出院病例49例。现有疑似病例2684例。
解读中国国家卫健委这些数字,确诊病例应该是指临床表现(咳嗽,呼吸困难或发热),血检血氧饱和度低,影像检查提示肺炎(胸片或CT),病毒核酸检测阳性。疑似病例应该是与病人有接触或到过高危区,有临床表现和影像结果提示肺炎,但尚未做核酸检测或病毒核酸阴性。
让武汉广大医护人员疲于奔命的应该是大量的就诊人数,这个人数没有公布,但应该是疑似病例的10至100倍。
解决看病难的关键在于简化就诊过程,患者分流和分检,增加医护人员。
随着全国各地支援的医护人员的到达,医护人员紧缺的状况得到缓解。封城后,武汉的出租车被组织起来运送大医院的就诊人员到空余的医院, 患者分流已经做了。
分检就是将非新型冠装病毒感染(普通发热感冒等)与新型冠装病毒感染病人分开。这个还需要改进,主要靠快速拍胸片(CT)和取样做病毒核酸检测。
简化就诊过程就是减少患者等待时间,减少病人诊疗过程中在狭小空间互相传染的机会, 这个也需要改进。
2. 住院难
作为1000人口的大城市,武汉市至少有5所三级甲等医院, 61家医院合起来具有收住10万以上病人的能力, 但各医院能接收新型冠装病毒感染病人相应科室为呼吸科,床位有限。传染病医院只有两家,等待确诊的疑似病患和确诊的病人占用隔离病床,总数有近5000人,造成武汉医院人满为患。
新华社武汉1月25日报道"武汉在早期两家定点医院和61家发热门诊的基础上,第一批、第二批、第三批分别征用7家、3家、14家综合医院,参照感染性疾病防治机构的基本要求,临时改造成为发热病人收治医院。目前收治疑似和确诊病例的床位达4000余张,另6000余张床位将于本月底前提供使用"。
所以本月底住院难的情况会有所改善。
3. 确诊难
确诊的关键在于应用针对新型冠状病毒研发的检测试剂盒。是不是试剂盒来不及供应呢?非也。据报道,
"三家生物科技企业上海辉睿生物、上海捷诺生物、上海伯杰医疗已被国家卫健委确定为武汉新型冠状肺炎病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒的供应商. 目前上海辉睿生物已向各地供应了五六万人份的2019-nCoV检测试剂盒,目前工厂每天可生产2万人份了;上海捷诺生物截至1月16日已生产1500盒共7.5万人份,发出1000盒,能检测5万人份,目前产能达到每日生产三批,共约5万人份。"
武汉市卫生健康委员会官方网站在 1 月 23 日发布了《武汉市卫生健康委关于市民关心的几个问题的答复》,其中提及了确诊难这个关键问题。"武汉卫健委回答了个中原因受限于具备相应防护级别的生物安全实验室的数量,检测速度慢,每天只能检测样本 200 多份。经专家组会诊后确认疑似病例并采样,由辖区疾控中心将样本转运到市疾控中心,市疾控中心转运到省疾控中心进行核酸检测,每天可检测样本 200 多份。(1 月 16 日之前湖北省没有试剂盒,还需要送到国家指定的检测机构进行病毒分离和核酸检测),预计从采样开始到结果返回,当前约需要 2 天左右的时间(1 月 16 日之前,样本需送到北京国家指定的检测机构,结果返回约需要 3 5 天)。"
武汉卫健委表示,"从 1 月 22 日开始,武汉市已指定各定点救治医院、发热定点诊疗医院的对口帮扶医院以及市疾控中心等具备相应防护级别的生物安全实验室开展相关样本的病原核酸检测工作(第一批共 10 家机构),预计全部运行起来每天可检测样本近 2000 份。为此,武汉市计划紧急调运 3 万人份试剂盒发放到指定检测机构,目前已下发 6000 人份。"
分析以上三难中的关键因素,脖子卡在每天病毒核酸检测的数量和等待时间,其中生物安全实验室的数量最为重要, 也是目前亟待改进的地方。1月16日以后武汉市每天可检测样本数近200份. 从采样到结果需要2天的时间,这样造成不是所有待检患者都得到检测以及疑似病例积累过多。每天200份相当于一个技术员8小时的工作量,效率实在太低了。一个高安全等级的实验室也至少可以配置5 个技术员,这样每天至少检测1000份样品。
4. 怎么改进
病毒核酸检测试剂研发难不难?不难。"在国家疾控得到武汉新型冠状肺炎病毒基因序列后,多家企业随即响应要求进行病毒核酸检测试剂的开发,并大多在24小时之内就完成了开发任务"。
过程繁不繁?不繁。"检测目前从患者样本提取病毒核酸大概需要半小时,试剂检测大多在一个半小时以内(RT-PCR),算下来一般一个样本检测可在两小时内完成"。
检测准不准?准。"各地疾控反馈数据显示,目前几个2019-nCoV病毒核酸检测试剂盒在临床实际的准确率均为100%,没有出现漏检与假阳性"。
那么2小时的检测为何需要等待两天? 高等级防护级别生物安全实验室限制了我们的检测能力和想象力。
从防护归类看,中国国家卫生健康委员会周一发出2020年第1号公告,将新型冠状病毒感染的肺炎纳入法定传染病乙类管理,并采取甲类传染病的预防、控制措施,说明检测不需要高等级防护级别生物安全实验室.
从新型冠装病毒的生物属性看, 56度处理30分钟或70%酒精处理就能灭活,所以样品检测不需要防护级别生物安全实验室, 只需普通生物实验室加上样品检测后灭活病毒。
在我看来,一个普通生物实验室,一个检验员和一台PCR仪器,大概一天可以处理200个血样,100个检验员就是20000个。 如果由有经验的科研人员或医疗人员把关训练半天,医学院学生或生物学本科或研究生都可以成为这样的检验员。
如果武汉政府能够采纳这个建议,可以大大加快确诊的过程,也能促进武汉早日解封。
1-26-2020
参考:https://www.jiemian.com/article/3900083.html
按说有positive 和 negative control,再加上multiplex,RT PCR应该是能保证质量的。会不会假阴性原因是病毒浓度不够高?要不要想办法提高一下病毒浓度?假阴性是蔓延的最大威胁。这些人还能出去接触和感染人。
影响因素包括
1.刮的位置和手法
2.运输过程降解
3. 病毒感染在下呼吸道
标准是CT以下阳性
有病治病,无病预防。可全民使用,一周解决问题。
虽然麻烦一点,但实际上提高效率,一次就解决问题,不用两三次才能确诊。
当然我早已建议做作为补充,原因在于血液不是病毒最易感的细胞,虽然肺的血供很丰富。
那不是用血测更好吗?不知道你有没有办法联系一下美国有病毒的医院,和他们合作,至少让他们研究一下取样不同的结果。最好找两个或以上的Lab看看结果是否一至。他们这边有时间做得可能会细致些。
另外,想起李医生的例子。他开始检测是阴性,应该是病毒浓度不够。浓度高了变阳性。阳性后治疗,转假阴性,以为没事了。病毒反弹不可控制。我这肯定是瞎猜了。
这个病有可能自愈,那么做为医者,就应该想方设法去促进人体的自愈本能,激发病人的自身免疫机制。
如果真正找到了特效药,譬如瑞德西韦特效了,再用它挽救危重病人,再使用对抗疗法。
我是做植物病毒检测和脱毒的,多数病毒都是系统性感染。有些植物病毒会导致过敏性坏死,病毒才局现于坏死区域。动物有各种体液,到形成症状,不知有多少病毒被复制出来,通过各种循环系统,应该要比植物病毒好检测的多。而且我植物病毒检测取样要比咽试子少得多,在莖尖分生组织培养的早期就取样。