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7日凌晨，华南农业大学（简称“华农”）发布新型冠状病毒感染的肺炎疫情研究攻关成果，称在穿山甲身上发现的一种β冠状病毒与人类感染的新型冠状病毒的相似度达99%，表明穿山甲可能是新型冠状病毒的潜在中间宿主。早前报道<<
从穿山甲组织中提取的新型冠状病毒电镜照片。华农供图
穿山甲是如何被科学家们“锁定”的？找到中间宿主对疫情防控有什么作用？南方日报、南方+记者独家对话了三位科学家：华农兽医学院研究员、博士生导师沈永义，华农特聘教授肖立华，华农兽医学院教授、博士生导师冯耀宇。
沈永义
带毒穿山甲来自哪里？
样本并非来自广东
南方日报、南方+：成果中提到的“宏基因组”是什么？
沈永义：我们几位科学家都是科技部重点领域创新团队成员，我的其中一个课题是“华南地区主要野生动物携带病毒谱调查研究”。我们花了4年多时间，逐步建立了一个野生动物的宏基因组库，目前收集了1000多个野生动物个体的宏基因组。
所谓宏基因组，就是某个生物个体身上带有的核酸片段的集合，这些核酸片段可能来自野生动物本身，也可能来自野生动物身上带有的细菌、病毒等。
南方日报、南方+：当初为什么要建这个数据库？
沈永义：SARS时期，寻找中间宿主果子狸花了很长的时间，教训很深刻。我们因此建立了这个宏基因组数据库，便于病原的溯源。
这个野生动物携带病毒谱的数据库是开放的，科学家们可以共享数据，也可以往里面填充数据，有助我们更有针对性地寻找病源。
正因为有这个数据库，我们才能这么快找到穿山甲这个潜在中间宿主。
南方日报、南方+：科学家们是如何逐步“锁定”穿山甲的？
沈永义：我们从国家发布的信息中获得了新型冠状病毒的基因组序列，把序列拿到宏基因组库中比对，最终在穿山甲个体的宏基因组中比对出与新型冠状病毒高度相似的基因片段。
由此，我们把目光锁定在穿山甲身上，后面通过分子生物学检验的手段进一步确认。
南方日报、南方+：接受分子生物学检验的这批穿山甲样本，来自哪里？
沈永义：我们要说明一点，这批穿山甲不是来自广东，也不是来自某个特定种群。
这些穿山甲样本是我们从某些特定机构获取的，数量不多。我们对样本开展分子生物学检测，有70%呈β冠状病毒阳性，但这个70%的数字只能起参考作用，不代表自然界中的穿山甲有七成带病。
实际上，在国内常见的中华穿山甲的宏基因组中，我们并没有检测出与病毒基因组高度匹配的序列，公众不必过分担心。
南方日报、南方+：从穿山甲中发现的病毒与新型冠状病毒有99%相似，意味着什么？
肖立华：从生物信息学的角度看，差异的1%可能不是十分重要，也可能影响很大，我们可以分析病毒的演化过程，继续寻找规律，推测这些病毒的来源，找到它们之间的差异和关联。
肖立华
为什么中间宿主如此重要？
蝙蝠直接感染人的可能性很小
南方日报、南方+：此前也有其他研究团队提出水貂、蛇等其他可能的中间宿主。
沈永义：学界普遍认同，新型冠状病毒的源头宿主是蝙蝠，但中间宿主还未有公论。人是怎么接触这些中间宿主的，目前还未明晰。
中间宿主不一定只有一种。比如SARS的中间宿主，除了大家都知道的果子狸以外，还包括好几种小型食肉动物，只是公众对果子狸认知度更高。
我们没有排除其他野生动物是中间宿主的可能性，接下来还要进行更多分析。
南方日报、南方+：找到中间宿主，对疫情防控有何意义？
沈永义：冠状病毒要通过中间宿主才能感染人。SARS的源头宿主是蝙蝠，但要通过中间宿主果子狸才能传染人；MERS的源头宿主也是蝙蝠，中间宿主是骆驼。中间宿主在病源和人类之间起到了桥梁作用。
这次的新型冠状病毒肺炎疫情暴发在冬季，我们知道蝙蝠在冬季处于冬眠状态，集中在山洞里面，直接感染人的可能性不大。
因此，中间宿主可能是病毒的传染源。如果传染源没有控制住，即便中间的隔离防护做得再好，疫情也很难被控制，容易出现反复。
南方日报、南方+：检测出病毒序列的穿山甲，本身发病吗？会不会传染人类？
冯耀宇：这批穿山甲是一个特殊的群体，是有病症的。能否传染人，我们目前还不明确，需要相关部门的进一步研究验证。
冯耀宇
为什么成果早于论文发表？
抗疫需要大家共享信息
南方日报、南方+：成果已经发表在期刊上了吗？
沈永义：我们的实验数据大部分已经完成，从我们已有数据可以得出穿山甲可能为新型冠状病毒潜在中间宿主的结论。
考虑到数据补充和论文写作需要一定的时间，鉴于疫情蔓延的严重性，我们选择将得到的结论第一时间公布，就是为了响应国家的号召，将研究结果写在疫情防控的第一线。我们也希望，这些及时公开的成果可以为更多的科学家提供借鉴与共享，助力疫情防控。
南方日报、南方+：第一时间公布科研成果，有没有什么担忧？
沈永义：实话实说，担忧是有的。
对科学家而言，最合理的成果发布形式是发表论文，有审稿人、编辑把关，不太容易出问题。这样第一时间公布成果，对我们而言压力非常大，但为了人民的生命健康，我们决定发出来。
冯耀宇：对于潜在中间宿主，我们希望通过发布科研成果，提醒大家注意，推动相关管控措施的完善。
南方日报、南方+：后续还将如何开展研究？大家特别关心的是，还有没有其他中间宿主？
冯耀宇：大家关注的问题也是科学家关注的话题。希望有更多的样本、数据可以共享，进一步开展研究，包括还有没有其他中间宿主、各中间宿主在疫病暴发中的作用、病毒是如何从中间宿主传播到人的等问题。
【记者】吴少敏 钟哲
【摄影】李细华
【通讯员】杨志群 郭灼 刘毅新 陈芃辰
就在阴谋论和实验室泄漏论还甚嚣尘上的时候，广东的一些科研人员宣布，他们找到了新冠病毒的潜在中间宿主-穿山甲，从其体内找到的一种贝塔冠状病毒与新冠病毒的相似度达到99％。尽管他们还没有发表详细的结果，但从网上的一些资料，可以看到有关研究的大致轮廓。
首先是广东动物保护和资源利用重点实验室的Ping Liu等人，于2019年10月在MDPI旗下的病毒学刊物Viruses上发表了一篇文章（1），披露了他们对一些被截获的走私马来穿山甲的病毒宏基因组学研究，其中包括了冠状病毒，并发布了宏基因组数据（2）。
2019年11月底到12月初，一种新的病毒肺炎在武汉暴发。早期患者多数与华南海鲜市场有关联。1月初确定这种肺炎是由一种新型的冠状病毒2019-nCoV引起。
1月20日武汉病毒研究所石正丽的团队发表文章，发现云南蝙蝠的一种冠状病毒RaTG13与新冠状病毒2019-nCoV的基因在总体上有96％相似，证明蝙蝠冠状病毒是新冠状病毒的源头。但是蝙蝠冠状病毒一般不能直接感染人，很可能还存在一种或几种中间宿主。
1月30日，有个叫Matthew Wong的人在网上发表了一个帖子（实际上像是文章雏形）（3），称其通过对上述宏基因组数据的分析，发现穿山甲冠状病毒的S1受体结合部分与新冠状病毒高度相似（97％），而这个部分恰恰是新冠状病毒2019-nCoV与蝙蝠冠状病毒RaTG13最不吻合的区域。因此推测是某种蝙蝠冠状病毒感染了穿山甲，与穿山甲本身的冠状病毒发生了基因重组。
2月7日华南农业大学举行新闻发布会，宣布发现穿山甲是新冠病毒潜在中间宿主（4）。从新闻看，穿山甲中β冠状病毒的阳性率为70%，因此可能并不局限于上述马来穿山甲。
（1）https://www.mdpi.com/1999-4915/11/11/979 （2）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA573298/ （3）http://virological.org/t/ncov-2019-spike-protein-receptor-binding-domain-shares-high-amino-acid-identity-with-a-coronavirus-recovered-from-a-pangolin-viral-metagenomic-dataset/362 （4）https://news.sina.com.cn/c/2020-02-07/doc-iimxxste9557742.shtml
也许野生穿山甲可以因此得到一些保护
一种可能：
那个与武汉病毒96%一致的蝙蝠病毒跑到穿山甲身上并与其原来的冠状病毒重组，产生武汉病毒的前体。
那个带有99%一致的病毒的穿山甲的地理分布情况至关重要。
"我们是从科研的角度发现，中间宿主并不意味着这个中间宿主是来源于华南海鲜市场。我们是基于网上一个数据库里的宏基因组学分析。然后从宏基因组当中寻找哪一种有可能和我们现在发现的病毒的相似度很高，从而发现了穿山甲。随后，我们在回溯以前的样品时发现里面有很像的，基于这一种，我们并不是从华南海鲜市场获得的样品。"
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02-07 20207日凌晨，华南农业大学（简称“华农”）发布新型冠状病毒感染的肺炎疫情研究攻关成果，称在穿山甲身上发现的一种β冠状病毒与人类感染的新型冠状病毒的相似度达99%，表明穿山甲可能是新型冠状病毒的潜在中间宿主。早前报道<<
穿山甲是如何被科学家们“锁定”的？找到中间宿主对疫情防控有什么作用？南方日报、南方+记者独家对话了三位科学家：华农兽医学院研究员、博士生导师沈永义，华农特聘教授肖立华，华农兽医学院教授、博士生导师冯耀宇。
带毒穿山甲来自哪里？
样本并非来自广东
南方日报、南方+：成果中提到的“宏基因组”是什么？
沈永义：我们几位科学家都是科技部重点领域创新团队成员，我的其中一个课题是“华南地区主要野生动物携带病毒谱调查研究”。我们花了4年多时间，逐步建立了一个野生动物的宏基因组库，目前收集了1000多个野生动物个体的宏基因组。
所谓宏基因组，就是某个生物个体身上带有的核酸片段的集合，这些核酸片段可能来自野生动物本身，也可能来自野生动物身上带有的细菌、病毒等。
南方日报、南方+：当初为什么要建这个数据库？
沈永义：SARS时期，寻找中间宿主果子狸花了很长的时间，教训很深刻。我们因此建立了这个宏基因组数据库，便于病原的溯源。
这个野生动物携带病毒谱的数据库是开放的，科学家们可以共享数据，也可以往里面填充数据，有助我们更有针对性地寻找病源。
正因为有这个数据库，我们才能这么快找到穿山甲这个潜在中间宿主。
南方日报、南方+：科学家们是如何逐步“锁定”穿山甲的？
沈永义：我们从国家发布的信息中获得了新型冠状病毒的基因组序列，把序列拿到宏基因组库中比对，最终在穿山甲个体的宏基因组中比对出与新型冠状病毒高度相似的基因片段。
由此，我们把目光锁定在穿山甲身上，后面通过分子生物学检验的手段进一步确认。
南方日报、南方+：接受分子生物学检验的这批穿山甲样本，来自哪里？
沈永义：我们要说明一点，这批穿山甲不是来自广东，也不是来自某个特定种群。
这些穿山甲样本是我们从某些特定机构获取的，数量不多。我们对样本开展分子生物学检测，有70%呈β冠状病毒阳性，但这个70%的数字只能起参考作用，不代表自然界中的穿山甲有七成带病。
实际上，在国内常见的中华穿山甲的宏基因组中，我们并没有检测出与病毒基因组高度匹配的序列，公众不必过分担心。
南方日报、南方+：从穿山甲中发现的病毒与新型冠状病毒有99%相似，意味着什么？
肖立华：从生物信息学的角度看，差异的1%可能不是十分重要，也可能影响很大，我们可以分析病毒的演化过程，继续寻找规律，推测这些病毒的来源，找到它们之间的差异和关联。
为什么中间宿主如此重要？
蝙蝠直接感染人的可能性很小
南方日报、南方+：此前也有其他研究团队提出水貂、蛇等其他可能的中间宿主。
沈永义：学界普遍认同，新型冠状病毒的源头宿主是蝙蝠，但中间宿主还未有公论。人是怎么接触这些中间宿主的，目前还未明晰。
中间宿主不一定只有一种。比如SARS的中间宿主，除了大家都知道的果子狸以外，还包括好几种小型食肉动物，只是公众对果子狸认知度更高。
我们没有排除其他野生动物是中间宿主的可能性，接下来还要进行更多分析。
南方日报、南方+：找到中间宿主，对疫情防控有何意义？
沈永义：冠状病毒要通过中间宿主才能感染人。SARS的源头宿主是蝙蝠，但要通过中间宿主果子狸才能传染人；MERS的源头宿主也是蝙蝠，中间宿主是骆驼。中间宿主在病源和人类之间起到了桥梁作用。
这次的新型冠状病毒肺炎疫情暴发在冬季，我们知道蝙蝠在冬季处于冬眠状态，集中在山洞里面，直接感染人的可能性不大。
因此，中间宿主可能是病毒的传染源。如果传染源没有控制住，即便中间的隔离防护做得再好，疫情也很难被控制，容易出现反复。
南方日报、南方+：检测出病毒序列的穿山甲，本身发病吗？会不会传染人类？
冯耀宇：这批穿山甲是一个特殊的群体，是有病症的。能否传染人，我们目前还不明确，需要相关部门的进一步研究验证。
为什么成果早于论文发表？
抗疫需要大家共享信息
南方日报、南方+：成果已经发表在期刊上了吗？
沈永义：我们的实验数据大部分已经完成，从我们已有数据可以得出穿山甲可能为新型冠状病毒潜在中间宿主的结论。
考虑到数据补充和论文写作需要一定的时间，鉴于疫情蔓延的严重性，我们选择将得到的结论第一时间公布，就是为了响应国家的号召，将研究结果写在疫情防控的第一线。我们也希望，这些及时公开的成果可以为更多的科学家提供借鉴与共享，助力疫情防控。
南方日报、南方+：第一时间公布科研成果，有没有什么担忧？
沈永义：实话实说，担忧是有的。
对科学家而言，最合理的成果发布形式是发表论文，有审稿人、编辑把关，不太容易出问题。这样第一时间公布成果，对我们而言压力非常大，但为了人民的生命健康，我们决定发出来。
冯耀宇：对于潜在中间宿主，我们希望通过发布科研成果，提醒大家注意，推动相关管控措施的完善。
南方日报、南方+：后续还将如何开展研究？大家特别关心的是，还有没有其他中间宿主？
冯耀宇：大家关注的问题也是科学家关注的话题。希望有更多的样本、数据可以共享，进一步开展研究，包括还有没有其他中间宿主、各中间宿主在疫病暴发中的作用、病毒是如何从中间宿主传播到人的等问题。
【记者】吴少敏 钟哲
【摄影】李细华
【通讯员】杨志群 郭灼 刘毅新 陈芃辰
新冠病毒来源的探索曙光初现 来源: 红米2015 于 2020-02-07 07:13:59 [档案] [博客] [旧帖] [给我悄悄话] 本文已被阅读： 1365 次 (3011 bytes) 字体：调大/重置/调小 | 加入书签 | 打印 | 所有跟帖 | 加跟贴 | 当前最热讨论主题
就在阴谋论和实验室泄漏论还甚嚣尘上的时候，广东的一些科研人员宣布，他们找到了新冠病毒的潜在中间宿主-穿山甲，从其体内找到的一种贝塔冠状病毒与新冠病毒的相似度达到99％。尽管他们还没有发表详细的结果，但从网上的一些资料，可以看到有关研究的大致轮廓。
首先是广东动物保护和资源利用重点实验室的Ping Liu等人，于2019年10月在MDPI旗下的病毒学刊物Viruses上发表了一篇文章（1），披露了他们对一些被截获的走私马来穿山甲的病毒宏基因组学研究，其中包括了冠状病毒，并发布了宏基因组数据（2）。
2019年11月底到12月初，一种新的病毒肺炎在武汉暴发。早期患者多数与华南海鲜市场有关联。1月初确定这种肺炎是由一种新型的冠状病毒2019-nCoV引起。
1月20日武汉病毒研究所石正丽的团队发表文章，发现云南蝙蝠的一种冠状病毒RaTG13与新冠状病毒2019-nCoV的基因在总体上有96％相似，证明蝙蝠冠状病毒是新冠状病毒的源头。但是蝙蝠冠状病毒一般不能直接感染人，很可能还存在一种或几种中间宿主。
1月30日，有个叫Matthew Wong的人在网上发表了一个帖子（实际上像是文章雏形）（3），称其通过对上述宏基因组数据的分析，发现穿山甲冠状病毒的S1受体结合部分与新冠状病毒高度相似（97％），而这个部分恰恰是新冠状病毒2019-nCoV与蝙蝠冠状病毒RaTG13最不吻合的区域。因此推测是某种蝙蝠冠状病毒感染了穿山甲，与穿山甲本身的冠状病毒发生了基因重组。
2月7日华南农业大学举行新闻发布会，宣布发现穿山甲是新冠病毒潜在中间宿主（4）。从新闻看，穿山甲中β冠状病毒的阳性率为70%，因此可能并不局限于上述马来穿山甲。
（1）https://www.mdpi.com/1999-4915/11/11/979
（2）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA573298/
（3）http://virological.org/t/ncov-2019-spike-protein-receptor-binding-domain-shares-high-amino-acid-identity-with-a-coronavirus-recovered-from-a-pangolin-viral-metagenomic-dataset/362
（4）https://news.sina.com.cn/c/2020-02-07/doc-iimxxste9557742.shtml
也许野生穿山甲可以因此得到一些保护
一种可能：
那个与武汉病毒96%一致的蝙蝠病毒跑到穿山甲身上并与其原来的冠状病毒重组，产生武汉病毒的前体。
那个带有99%一致的病毒的穿山甲的地理分布情况至关重要。
"我们是从科研的角度发现，中间宿主并不意味着这个中间宿主是来源于华南海鲜市场。我们是基于网上一个数据库里的宏基因组学分析。然后从宏基因组当中寻找哪一种有可能和我们现在发现的病毒的相似度很高，从而发现了穿山甲。随后，我们在回溯以前的样品时发现里面有很像的，基于这一种，我们并不是从华南海鲜市场获得的样品。"