美国疫情发展趋势简报(#8)4/27/2020

L
LingYuan
楼主 (文学峸)

1. 美国疫情发展小结

     美国疫情的发展基本可以总结为:

       西海岸由亚洲/中国输入,疫情发生较早于1月下旬,初始中心为加州与华州 。由于对中国通航的限制与这两个州疫情控制措施得当的原因,疫情很快得到控制。这一阶段的疫情在如下的日增图中表现为拐点A(3/28)。

      东海岸疫情由欧洲输入,约发生在三月中旬,初始疫情中心为入口岸城市纽约。继而爆发并主导全国疫情的进展情况。之后,由此陆续蔓延至周围各州,随着疫情在地域上的蔓延传播,新的疫情中心相继出现,致使在日增图上有多个拐点发生(B,C,D,E)至今。疫情中心相继移动传播所用的时间约为1周。目前最近的拐点E出现于4/24。我们期望这是最后的一个拐点。

     疫情在拐点B与E之间的横向移动,归根结底是“拉平曲线”这一错误指导方针下所产生的后果。这一期间耗时大约4周。此间每天平均日增量为3万,目前所累计的感染总数绝大部分是在此间形成的。拉平曲线的最大错误是忽视了病例呈几何级数增长这一基本事实。用拖延时间来解决医疗物资的短缺显然是不可行的误国之策。正确的做法应该是隔离感染源与隔断感染渠道。这样在源头上控制疫情才是正确之道。

                                                                                                            图一 美国疫情确诊人数日新增趋势图

 

2. 目前发展趋势与展望

       如图一所示,在拐点E之后,持续三天呈现下降趋势,无论从情感上或实际情况来看,我们都希望在E点之后不会再有新的拐点出现(注:这是一个重要的假设,也是一个纯粹的假设,没有绝对的理由保证新的拐点不会出现)。根据疫情相对拐点对称的原理,此后的衰减期大致为三周(衰减至日增相对较小的范围),因此疫情在五月中旬有望基本减退。

   这一 结论也可从日增比变化图得出。如图二为日增比变化图。当日(4/27)的日增比为1.025. 目前日增比下降速度约为每周下降0.01. 以此速度,三周之后应该下降至小于1.001。(日增比=1为零增)。其结论基本与图一中日新增趋势所得出的结论吻合。

                                                                               图二: 日增比趋势图(截至4/27/2020)

 

               从统计学角度来看,测试可以看作是对总体的一种抽样调查。测试中的阳性率从某种角度反映总体感染的变化趋势。图三为美国测试阳性率的变化趋势。高峰出现于4/2/2020. 之后随拐点出现而有所震荡起伏,但总体呈下降趋势。图中虚线为对实际数据拟所作的拟合而得到的一个表示趋势的二次曲线(R^2=0.8)。

                                                                           图三:美国阳性率趋势图(截至4/27/2020)    

 

3. 目前疫情出现的一些新的现象

 

              目前,在疫情发展中有两个值得注意的现象,一个是症状的多样化。其症状不再是单一的发热,咳嗽,与呼吸困难的症状,感染器官也不单单是肺部。另外就是在世界范围内出现了大量的无症状感染者。我们认为这些都是病毒变异的结果。

           如果认为12/1/2019为首例日的话,新冠病毒至今已经历经了37代的演化(传染周期为4天)。在此期间,据各种分析结果,病毒在其RNA序列上已经出现了140几个突变点。病毒的突变虽然在个体上具体随机性,但在其总体趋势上却呈现有统计规律:即与宿主的趋同性和病毒本身种类上的多样化。

           世间万物在发展变化上都具有与其所处的环境的趋同性(ADAPTATION)。例如若您将一滴墨水滴入一玻璃水杯之后,这滴墨水会逐渐溶合于它所处于的水中,这是我们日常生活中一个趋同的小例子。病毒置于人体之内,也同样具有与我们人体的趋同性。这种与宿主的趋同会导致病毒毒性的下降。例如,在美国的累计确诊住院率当初约为20%-30%,到目前已经下降为10% ,反映了在感染人群中,随着病毒毒性的下降,重症的比例在逐步下降而轻症的比例在逐步上升。

       为理解无症状者,我们可以把所有的感染者按症状的轻重作一个排序,而所谓的无症状者实际上处于这一排序中的最轻的一端。是感染得病与无感染之间的一种临界状态。而在人体内,是病毒的毒性与自身免疫力处于互相平衡的一种临界状态。大量无症状者的出现,也是病毒毒性减轻的一个结果。

      病毒的另一个变异方向是其多样化。多样化的结果导致了病毒不同变种的出现。不同的变种会导致不同的得病症状与感染器官的多样化。

 

4. 复工的必要性

 

      众所周知,疫情不但损害人体的健康,同时也危及经济与社会的健康。目前美国基本处于一种停摆的状态。持续下去,会有经济垮台的可能,从而会导致社会动荡。因此复工是必要的,同时基于疫情的衰弱与趋同变异,谨慎地有序地复工也是可行的。

      很多时候,个体的利益往往和社会的利益是矛盾的。在目前情况下,一提到复工,很多人势必会有顾虑和担心。在此问题上,我们应该在注重保护好自己的同时,也应该考虑到经济与社会的需要,权衡各方面的因素,在保护好我们自己健康的同时,也要保护我们赖以生存的经济体的健康和社会整体的健康。

 

b
bedrock29
就是说看确诊人数没多少意义,不知有多少无症状在那儿。看住院人数更能说明问题。
b
bedrock29
就是说看确诊人数没多少意义,不知有多少无症状在那儿。看住院人数更能说明问题。



L
LingYuan
确诊人数还是能准确反映感染情况的。仍然有其实际意义。

虽然有人认为无症状者能传染,但其传染能力相对有症状者是很有限的。

又馨
前几天的数据可能不可靠:因为有national的检测中心出错,数据出不来,延误几天后才出来。
L
LingYuan
谢谢信息,您说的很对。为简化行文,这个因素未讨论,因为不会影响结论。
g
greennew
冰岛做了大量测试,有个decode genetics实验室做了不少研究,不知对你是否有用。

https://www.decode.com/

https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2006100

我是看不懂。

e
ephd
现在每日检测数量有多少?
甜酒甜
看起来
甜酒甜
看起来
甜酒甜
看起来

要到五月

鬓微霜又何妨
说得好
L
LingYuan
昨天(4/27)测了约190k
L
LingYuan
谢谢!
p
pickshell
谢谢,但愿疫情不会再出新顶点。
甜酒甜
长期不复工,生产链供给链一断,到时

无论是WFH的,还是拿着救援金的,及所有人,估计都得面对一个实际问题,-----拿着"纸票子"买不到基本生活用品

L
LingYuan
谢谢信息,读了摘要。

"The haplotypes of the sequenced SARS-CoV-2 viruses were diverse and changed over time. "

 

上面有关。其它部分或无关或条件不同不适用我们讨论的主题。

L
LingYuan
谢谢关注! 共同防疫。希望疫情尽快结束。
L
LingYuan
说得对,说得好,没吃吗没喝也是一种危机
p
pickshell
对。现在等于在“吃老本” 用库存呢。
甜酒甜
我们州,昨天一个很大的肉类生产厂关门了. 那个厂所在县,昨天检测1400多人,有400多个阳性

占了我们州昨天阳性确诊数字的一半

那个县总共才3万多人,已经有1000多个确诊阳性

-
--Z--
谢谢!终于又等到你的论文了。。。
i
indexguy
解封后,可能会有几波反弹。
L
LingYuan
小文,希望有点用@
L
LingYuan
肯定会有 但肯定是小波浪。
e
ephd
检测数量和阳性病人的数量好像并不一定成比例

例如4月4号,检测数量是228,797,而测试呈阳性的病人为33518. 阳性率是15%

而4月5号的检测数量是119,659,阳性病人为25,966,阳性率高达22%。

根据一亩三分地的数据来看,检测量最高的几天反而是阳性率最低几天。 可能和检测地区有一定的关系。、

4月22号以来,检测的阳性率好像总体在呈现一定的下降趋势

 

g
greennew
再请教一下,这个演化了37代和冰岛的研究中提到的291 mutations是一回事吗?

演化一代的时间是否基本是固定的?

Currently, 291 mutations of the virus have been found in the country that have not been identified elsewhere, according to decode.com.

https://icelandmonitor.mbl.is/news/news/2020/04/15/article_on_covid_19_in_iceland_in_new_england_journ/

f
fourwaves
美国出错不算隐瞒造假,中国出错就是隐瞒造假

f
fourwaves
那些用抗体得到的数据,你的意见?

l
learner_2
三天的下降不足以说明趋势,因为每次都是周末下降。一周下降的话才显示趋势。阳性率下降反应了疫情的缓解。平台期一部分原因是因为测试放
s
swj2000
是。像加州,新增数字经常zigzag.
A
AG33912
东岸3/3前己登陆(律师在车上感染好多下后住院确症)
L
LingYuan
说的对,一周到2周的持续下降才是真正的下降。3天连接下降带来希望。所以说是个假定。
L
LingYuan
是的。大量的还是欧洲的返回
L
LingYuan
多谢!也有这种可能。

如果检测条件一样,连续两天的阳性率应该是基本一致的。因为阳性率基本和群体中感染率紧密相关(正相关,虽然不一定线性相关). 如果在某一天的测试条件变了,比如测试手段变了,或初选条件变了,会影响阳性率。此外,也不排除数据出错的原因。有时候统计上报的原因,可能把某一天的若干数据算在下一天去(4/4与4/5正好是周末)。

以上都是范范地谈,这两天到底什么原因,没有深究,但不符合常理,我觉得不能用这个现象作一般结论:)。

L
LingYuan
统计上,传染周期是4天。基本不变。从一个人传染到下一个人算一代(像生育一样)

冰岛的应该是整个变异后的变种的其中一部分。现在好像一共发现4400个MUTATIONS