中国各地人口基因差异

d
daigaku
楼主 (未名空间)

ChinaMAP发布最大规模中国人群高深度全基因组测序和表型研究成果丨Cell Research
2020年4月30日,ChinaMAP联盟携全国29家研究机构和医院,在中科院上海生命科学研
究院主办的Cell Research杂志发表了长文章“The ChinaMAP analytics of deep
whole genome sequences in10,588 individuals”,首次报道了ChinaMAP一期研究对
覆盖全国27个省份和直辖市,8个民族,超过1万人的高深度(40X)全基因组测序数据
和表型的系统性分析。上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家代谢性疾病临床医学研究中心的宁光院士,王卫庆教授和毕宇芳教授是论文的共同通讯作者,曹亚南研究员、李林研究员和徐敏研究员等为共同第一作者。
ChinaMAP一期研究覆盖中国七大地理区域,包括了人口排名前十的汉族、壮族、回族、满族、苗族、彝族、藏族和蒙古族,显示了中华民族跨地理区域人群遗传背景的多样性和复杂性。研究团队将汉族分为七个部分:北方汉族(北京、天津、河南、河北、山东、辽宁、吉林、黑龙江、山西),西北汉族(甘肃、陕西),东部汉族(江苏、浙江、上海、安徽),中部汉族(湖北),南方汉族(贵州、四川、重庆、湖南、云南、江西),东南汉族(福建)和岭南汉族(广东、广西)。少数民族中,藏族、彝族、蒙古族、苗族和壮族都有着独特的人群聚类,而满族和北方汉族相近,回族和西北、北方汉族相近。
不同地域人群的变异特征也与中国历史上的人口迁徙和变迁相关,例如河西走廊是丝绸之路中不同民族迁徙的交通要道,历史上包括粟特人等许多民族曾在此经商生活。
ChinaMAP研究揭示,现代河西走廊地区的人们具有的基因多态性位点数量更多更复杂。与全世界其他人群相比,中国人的遗传特征与欧洲、非洲、南亚和拉丁美洲人群之间存在着巨大差异,与非洲人群差距最大,而与东亚人群非常相似。研究者在成分分析中发现,日本人群与中国北方汉族人群聚类完全重叠。

n
nobarking

dnsl 这臭老九又要振作起来了
K
Karcas2

尼玛,西藏鹤立鸡群
T
TheMatrix

K2,K5,K7分布比较均匀。

【 在 daigaku (2913121329) 的大作中提到: 】
: ChinaMAP发布最大规模中国人群高深度全基因组测序和表型研究成果丨Cell
Research
: 2020年4月30日,ChinaMAP联盟携全国29家研究机构和医院,在中科院上海生命科学研
: 究院主办的Cell Research杂志发表了长文章“The ChinaMAP analytics of deep
: whole genome sequences in10,588 individuals”,首次报道了ChinaMAP一期研究对
: 覆盖全国27个省份和直辖市,8个民族,超过1万人的高深度(40X)全基因组测序数据
: 和表型的系统性分析。上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家代谢性疾病临床医学研
: 究中心的宁光院士,王卫庆教授和毕宇芳教授是论文的共同通讯作者,曹亚南研究员、
: 李林研究员和徐敏研究员等为共同第一作者。
: ChinaMAP一期研究覆盖中国七大地理区域,包括了人口排名前十的汉族、壮族、回族、
: 满族、苗族、彝族、藏族和蒙古族,显示了中华民族跨地理区域人群遗传背景的多样性
: ...................

d
daigaku

基本上
K1 苗
K3 蒙古
K4 彝
K6 壮
K8 藏

涵盖了新疆之外几大少数民族成分

【 在 TheMatrix (TheMatrix) 的大作中提到: 】
: K2,K5,K7分布比较均匀。
: Research

T
TheMatrix

K6的比例很高啊,在岭南汉,壮,南方汉,等类别里都是占比很大。但是在北方汉等类别里很小。在地域上就是南方很多,到北方越来越少直到几乎没有。这个有点意思。

【 在 daigaku (2913121329) 的大作中提到: 】
: 基本上
: K1 苗
: K3 蒙古
: K4 彝
: K6 壮
: K8 藏
: 涵盖了新疆之外几大少数民族成分

h
huarenElite

岭南汉,闽汉吗

【 在 TheMatrix (TheMatrix) 的大作中提到: 】
: K6的比例很高啊,在岭南汉,壮,南方汉,等类别里都是占比很大。但是在北方汉等类
: 别里很小。在地域上就是南方很多,到北方越来越少直到几乎没有。这个有点意思。

s
soric

除了广西、广东、湖南、内蒙、西藏,其他都差不多?

【 在 daigaku (๑۩۞۩๑) 的大作中提到: 】
: ChinaMAP发布最大规模中国人群高深度全基因组测序和表型研究成果丨Cell
Research
: 2020年4月30日,ChinaMAP联盟携全国29家研究机构和医院,在中科院上海生命科学研
: 究院主办的Cell Research杂志发表了长文章“The ChinaMAP analytics of deep
: whole genome sequences in10,588 individuals”,首次报道了ChinaMAP一期研究对
: 覆盖全国27个省份和直辖市,8个民族,超过1万人的高深度(40X)全基因组测序数据
: 和表型的系统性分析。上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家代谢性疾病临床医学研
: 究中心的宁光院士,王卫庆教授和毕宇芳教授是论文的共同通讯作者,曹亚南研究员、
: 李林研究员和徐敏研究员等为共同第一作者。
: ChinaMAP一期研究覆盖中国七大地理区域,包括了人口排名前十的汉族、壮族、回族、
: 满族、苗族、彝族、藏族和蒙古族,显示了中华民族跨地理区域人群遗传背景的多样性
: ...................

n
niuheliang

岭南汉的K6比壮还高典型。

K5是啥?

【 在 daigaku (๑۩۞۩๑) 的大作中提到: 】
: 基本上
: K1 苗
: K3 蒙古
: K4 彝
: K6 壮
: K8 藏
: 涵盖了新疆之外几大少数民族成分

d
daigaku

各成分最平均的是四川和云南。
【 在 soric (soric) 的大作中提到: 】
: 除了广西、广东、湖南、内蒙、西藏,其他都差不多?
: Research

j
jdfl

谁来讲讲这 K1 .。。。。 K8 是啥意思?

【 在 daigaku (๑۩۞۩๑) 的大作中提到: 】
: ChinaMAP发布最大规模中国人群高深度全基因组测序和表型研究成果丨Cell
Research
: 2020年4月30日,ChinaMAP联盟携全国29家研究机构和医院,在中科院上海生命科学研
: 究院主办的Cell Research杂志发表了长文章“The ChinaMAP analytics of deep
: whole genome sequences in10,588 individuals”,首次报道了ChinaMAP一期研究对
: 覆盖全国27个省份和直辖市,8个民族,超过1万人的高深度(40X)全基因组测序数据
: 和表型的系统性分析。上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家代谢性疾病临床医学研
: 究中心的宁光院士,王卫庆教授和毕宇芳教授是论文的共同通讯作者,曹亚南研究员、
: 李林研究员和徐敏研究员等为共同第一作者。
: ChinaMAP一期研究覆盖中国七大地理区域,包括了人口排名前十的汉族、壮族、回族、
: 满族、苗族、彝族、藏族和蒙古族,显示了中华民族跨地理区域人群遗传背景的多样性
: ...................

j
jdfl

“日本人群与中国北方汉族人群聚类完全重叠” -- 啥原因?

按理, 日本不该有游牧的成份。

【 在 daigaku (๑۩۞۩๑) 的大作中提到: 】
: ChinaMAP发布最大规模中国人群高深度全基因组测序和表型研究成果丨Cell
Research
: 2020年4月30日,ChinaMAP联盟携全国29家研究机构和医院,在中科院上海生命科学研
: 究院主办的Cell Research杂志发表了长文章“The ChinaMAP analytics of deep
: whole genome sequences in10,588 individuals”,首次报道了ChinaMAP一期研究对
: 覆盖全国27个省份和直辖市,8个民族,超过1万人的高深度(40X)全基因组测序数据
: 和表型的系统性分析。上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家代谢性疾病临床医学研
: 究中心的宁光院士,王卫庆教授和毕宇芳教授是论文的共同通讯作者,曹亚南研究员、
: 李林研究员和徐敏研究员等为共同第一作者。
: ChinaMAP一期研究覆盖中国七大地理区域,包括了人口排名前十的汉族、壮族、回族、
: 满族、苗族、彝族、藏族和蒙古族,显示了中华民族跨地理区域人群遗传背景的多样性
: ...................

d
daigaku

我估计就是聚类的时候cluster数取8
然后各个数据点到各Cluster中心的距离可以换算成权重

【 在 jdfl (忆红) 的大作中提到: 】
: 谁来讲讲这 K1 .。。。。 K8 是啥意思?
: Research

j
jdfl

这种文章就是个狗屁

【 在 daigaku (๑۩۞۩๑) 的大作中提到: 】
: 我估计就是聚类的时候cluster数取8
: 然后各个数据点到各Cluster中心的距离可以换算成权重

w
wangyangming


看不懂什么意思
N
Notalandlord

+1

[在 jdfl (忆红) 的大作中提到:]
:这种文章就是个狗屁