重大：新冠病毒的非武汉起源学说

@polyhedron
我有了個重大發現：所有本次新冠病毒的共祖可能早在12月之前的數月；在武漢的爆發也許與一個蛋白突變有關。

大概說一下：還是這個网站 O网页链接 ，收集了幾十條新冠病毒的全序。网站把武漢
最大的一個星簇作爲最左，同時一般也以爲這個是時閒最早。但以我對Y染色體和線粒
體的經驗，最大的擴張處未必是最早的節點。這個其實是棵無根樹。尤其因爲病毒的演化速率會不符合分子鐘假設，而無根樹最早分化的節點（如“Y染色體亞當”和“線粒
體夏娃”）需要通過outgroup來定根。現代人的Y染色體和線粒體可以用黑猩猩或尼安
德特人來定根，而新冠病毒我自然想到用和其最接近的雲南蝙蝠冠狀病毒RaTG13來定。

結果，我發現最大的那個餅並不是樹根！眞正的樹根其實是在圖1和圖2的位置。有三個突變，C8782T（圖3），T28144C（圖4），C24034T（圖5），RaTG13都是和圖2偏右的樣本一致。說明整個新冠肺炎的始祖是在紅叉處（但截至目前並沒有測到過序列全同的樣本，最少的也是差一步）。而ORF8（某個被轉錄的蛋白）上的T>C突變造成了一個絲氨
酸到亮氨酸（Ser > Leu）的殘基改變，有可能是病毒毒力增強的重要位點。同時還說
明，武漢有可能不是病毒的原發地，12月之前該病毒在人閒已經傳播數月，只是在武漢因毒力增強爆發纔爲人所知。最接近樹形眞正根部的這些樣本也許能提供病毒最初來源的更多線索。

順道說一下，中南大學的黃石敎授，爲什麼說人類的共祖不

这个也可以解释牛河梁之问：

为什么存在大量的无症状患者

图呢？

【 在 Caravel (克拉维尔) 的大作中提到: 】
: @polyhedron
: 我有了個重大發現：所有本次新冠病毒的共祖可能早在12月之前的數月；在武漢的爆發
: 也許與一個蛋白突變有關。

广东报告其病毒株和标准型之间差了4个碱基。总共好像是2万多还是3万多。感觉区别
挺大变异很快了。

【 在 Caravel (克拉维尔) 的大作中提到: 】
: 这个也可以解释牛河梁之问：
: 为什么存在大量的无症状患者

polyhedron应该是复旦一个人，人类分子学方面的， 不是那个李辉。

他说的，是他自己基于人类Y-DNA/mtDMA分类的经验，判断武汉病毒（RNA序列）是支系。

去看他的微博把https://www.weibo.com/ychromosome

【 在 niuheliang (别问我是谁) 的大作中提到: 】
: 图呢？

我没有微博账号。

不过致病病毒之前有不那么有毒的前体是常识。

不然亿万年它们怎么幸存下来的。

突然出现30000个碱基致命病毒排列组合的概率和0没啥区别。

【 在 Caravel (克拉维尔) 的大作中提到: 】
: 去看他的微博把
: https://www.weibo.com/ychromosome

他说的，应该不是老祖宗，而是上一代或上2代变异的， 顺藤摸上去，可以查源。

【 在 niuheliang (别问我是谁) 的大作中提到: 】
: 我没有微博账号。
: 不过致病病毒之前有不那么有毒的前体是常识。
: 不然亿万年它们怎么幸存下来的。
: 突然出现30000个碱基致命病毒排列组合的概率和0没啥区别。

Wuhan is a scapegoat

Polyhedron是研究分子人类学的吧。
记得他本科是清华的，博士是德国微生物，后来去复旦做博后主要搞分子人类学那些东西。
他一些拟构古汉语发音的视频挺有意思，YouTube有不少。

那只能说明广东报告的病毒株不是武汉肺炎的病原体

【 在 niuheliang (别问我是谁) 的大作中提到: 】
: 广东报告其病毒株和标准型之间差了4个碱基。总共好像是2万多还是3万多。感觉区别
: 挺大变异很快了。

weibo 点开就看
我也没有账号可以看到

【 在 niuheliang (别问我是谁) 的大作中提到: 】
: 我没有微博账号。
: 不过致病病毒之前有不那么有毒的前体是常识。
: 不然亿万年它们怎么幸存下来的。
: 突然出现30000个碱基致命病毒排列组合的概率和0没啥区别。

对，所以人家搞基因溯源是专业，

【 在 daigaku (๑۩۞۩๑) 的大作中提到: 】
: Polyhedron是研究分子人类学的吧。
: 记得他本科是清华的，博士是德国微生物，后来去复旦做博后主要搞分子人类学那些东
: 西。
: 他一些拟构古汉语发音的视频挺有意思，YouTube有不少。

要重新审视武汉起源学说了，