文摘个科学回顾:蝙蝠和SARS

Huangchong
楼主 (未名空间)

原文在这里https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6356540/

这个是2019年1月发表的一个回顾文章,里面提到了几个比较有意思的事情,我大致摘
要一下

1 到目前为止,有(7)种感染人的冠状病毒,其中能导致死亡的只有SARS,MERS(和
这次的水产市场新病毒,当然一年前的文章里不可能把它预测出来)。其余4种一般情
况下都只导致普通感冒,就是“回家,多喝热水” 那种。

2 SARS在2002-2003年的事件里一共流行了8个月,8098人确诊,774人死亡(9.5%)。

3 MERS 在2012年出现,然后一直零星传染到现在,到写文章的时候有2260例,死了803人(35%),所以实际是杀人最厉害的。

4 SARS也是水产市场发现的。至于最初是不是真的由郭子狸之类的野味传给人,其实到现在都没搞清楚。现在怀疑存在从中华马蹄蝠直接传给人的可能,而子狸可能是个旁观受害者——但是说不准。

5 实际上后来在香港的调查发现,其实一些人早在2001年身体里就存在SARS近亲病毒感染(可能是存的血液样品里分析来的,我猜)。所以看起来在2002年SARS爆发前就有
SARS相近病毒从动物传人的情况,只是没被注意到。

6 中东的MERS冠状病毒,主要传播途径是骆驼直接传给人,估计55%的MERS感染都是骆驼传给人。人之间持续互相传染的几率比较低(持续。。意思大概是20%连乘几次就是1%,这样)。所以,MERS就是“不怎么人传人”的冠状病毒。
(wikipedia):On 13 February 2013, the World Health Organization stated "
the risk of sustained person-to-person transmission appears to be very low."

7 中东-北非的单峰驼里MERS病毒相当的流行,各地统计的结果,大概70-100%的骆驼
是血清阳性的。所以不光是野味危险,其实家味也不是那么安全。
除了传给人MERS,骆驼似乎也是把温和的,只导致普通感冒的,229E病毒,传给人的直接责任者(蝙蝠-骆驼-人)

我突然想起来回国的时候看到的铺天盖地的骆驼奶,骆驼初乳片,骆驼肉。。。不过我们的骆驼是双峰的

8 有不少在禽畜里流行的动物冠状病毒,鸡猪等等。其中一些造成的经济损失比较大。这就解释了拖把套上次的问题,为啥有人去研究它们 (除了蝙蝠的情况)

9 蝙蝠是冠状病毒的大繁殖基地,目前知道200多种蝙蝠冠状病毒。所有的人冠状病毒
都可以在蝙蝠冠状病毒里找到根。在蝙蝠里,各种不同的冠状病毒可以发生大量的重组,不断产生新的品种。而且spike蛋白似乎是重组事件发生的热点(我解释一下:spike蛋白是病毒表面用来粘宿主细胞的工具,所以受的选择压力最大,要一直一直逃避宿主的免疫系统,所以这个现象是合理的 )

10 蝙蝠为啥对冠状病毒这么友好(这是我去搜这个文章的原动力):不知道。文章里
罗列了几个研究,但是我觉得这几个研究都不大说明问题,也没有哪个真的企图去回答这个问题。其实蝙蝠对其他好几个病毒也很友好。而且综述的作者在文章尾也说了,你觉得蝙蝠厉害,那是你不知道老鼠们多厉害!SARS之后,人类拿个放大镜在蝙蝠上反复看反复看,很种族歧视啊。

我查了一下,蝙蝠别看都长一个样,居然占了所有哺乳动物物种的20%,那就是说有
1000多种。毕竟人家是老鼠里的空姐啊(老鼠们占哺乳类总物种数的40%)。

s
shychild

所以郭德纲说要吃整个骆驼的汉堡包还是有风险的。

Huangchong

哈哈 刚好有人问MERS怎么没传开

====
发信人: vuse (vuse), 信区: Military
标 题: 有次中东冠状病毒袭击了韩国,
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jan 24 15:41:12 2020, 美东)

为什么没有影响到东亚其他国家。

那个说是骆驼是病毒源头, 和现在的这个近亲
ne5234

教训就是没事不要去惹暗黑界的动物。

【 在 Huangchong (净坛使者) 的大作中提到: 】
: 原文在这里
: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6356540/
: 这个是2019年1月发表的一个回顾文章,里面提到了几个比较有意思的事情,我大致摘
: 要一下
: 1 到目前为止,有(7)种感染人的冠状病毒,其中能导致死亡的只有SARS,MERS(和
: 这次的水产市场新病毒,当然一年前的文章里不可能把它预测出来)。其余4种一般情
: 况下都只导致普通感冒,就是“回家,多喝热水” 那种。
: 2 SARS在2002-2003年的事件里一共流行了8个月,8098人确诊,774人死亡(9.5%)。
: 3 MERS 在2012年出现,然后一直零星传染到现在,到写文章的时候有2260例,死了
803
: 人(35%),所以实际是杀人最厉害的。
: ...................

Huangchong

骆驼是拉伯人的爱侣,这个实在是没法子

【 在 ne5234 (Nessun Dorma) 的大作中提到: 】
: 教训就是没事不要去惹暗黑界的动物。
: 803

S
SLE

果子狸来源说是谁提出的,有什么依据?
Huangchong

不知道谁提出的,得查paper。不过回顾里提了,果子狸里确实检出了sars病毒。

蝙蝠理论是sars停了以后一段时间才提出来的,这之前并没有考虑蝙蝠里的病毒(我记得是武大医学院的人提出的蝙蝠论,发了个science,可能就是石正丽?)。而且实际
上最后确定是直接从蝙蝠来的,要等到2017年,真的从中国某洞穴的大马蹄蝠里分离到跟SARS极其相关的病毒。

所以一开始只知道果子狸可以检出病毒,所以当时还是挺合理的一个判断。

【 在 SLE (嗯,就这样定了。) 的大作中提到: 】
: 果子狸来源说是谁提出的,有什么依据?

Huangchong

下面仨paper就是确定蝙蝠的关键论文,两个2005年和一个2017年

2005年science一作是动物所李文东 二作是武汉病毒所石正丽,通讯作者是石正丽,动物所张树义,澳大利亚王林发
2005年pnas是港大袁国永组 Kwok-Yung Yuen
2017年的是石正丽作为通讯作者发的

2005:https://science.sciencemag.org/content/310/5748/676.long
https://www.pnas.org/content/102/39/14040

2017https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.
1006698

下面这个nature的评论文章,说2005年的一个问题是sars的一个关键基因在当时锁定的蝙蝠里没找到,然后2017年找到了https://www.nature.com/articles/d41586-017-07766-9

文章里还有个很有趣的图,是石正丽他们去云南探蝙蝠洞穿的防护服——我也没想
到其实这个工作这么危险


【 在 Huangchong (净坛使者) 的大作中提到: 】
: 不知道谁提出的,得查paper。不过回顾里提了,果子狸里确实检出了sars病毒。
: 蝙蝠理论是sars停了以后一段时间才提出来的,这之前并没有考虑蝙蝠里的病毒(我记
: 得是武大医学院的人提出的蝙蝠论,发了个science,可能就是石正丽?)。而且实际
: 上最后确定是直接从蝙蝠来的,要等到2017年,真的从中国某洞穴的大马蹄蝠里分离到
: 跟SARS极其相关的病毒。
: 所以一开始只知道果子狸可以检出病毒,所以当时还是挺合理的一个判断。

Huangchong

这个是2004年世卫说果子狸是源头,里面提到一开始香港的研究机构在子狸里发现了
SARS
(我猜还是顺着当时已经有的理论说。这帮洋人其实也很好糊弄。这几天就看出来了,一会跟着上海的烂paper说跟sars离得远,一会儿跟着北大的烂paper说是蛇传的。。他们自己也没数据,只能从现有的paper里抄。)
http://www.cidrap.umn.edu/news-perspective/2004/01/who-sees-more-evidence-civet-role-sars

Dr. Robert Breiman of WHO said the SARS coronavirus was found in samples
from civet cages in a restaurant where a young woman who has suspected SARS worked, according to Associated Press (AP) and Reuters reports today.

"Tests revealed on each cage the SARS coronavirus," an AP report quoted
Breiman as telling reporters in Guangzhou, capital of Guangdong. He said it's clear that at some point the cages contained "civet cats that were
carrying the SARS coronavirus."

【 在 SLE (嗯,就这样定了。) 的大作中提到: 】
: 果子狸来源说是谁提出的,有什么依据?

Huangchong

现在想起来,2003年和2020年有个极其巨大的不同,2003年,人基因组刚刚测出来,测序还是既慢又贵。

2020年,一伸手就可以测个基因组

After the idea was picked up in 1984 by the US government when the planning started, the project formally launched in 1990 and was declared complete on April 14, 2003.[3]
Huangchong

所以华大到现在还没有跳出来,现在想想挺意外的

深度测序其实可以在检测和治疗都起重大作用

【 在 Huangchong (净坛使者) 的大作中提到: 】
: 现在想起来,2003年和2020年有个极其巨大的不同,2003年,人基因组刚刚测出来,测
: 序还是既慢又贵。
: 2020年,一伸手就可以测个基因组
: After the idea was picked up in 1984 by the US government when the
planning
: started, the project formally launched in 1990 and was declared complete on
: April 14, 2003.[3]

Huangchong


【 在 Huangchong (净坛使者) 的大作中提到: 】
: 下面仨paper就是确定蝙蝠的关键论文,两个2005年和一个2017年
: 2005年science一作是动物所李文东 二作是武汉病毒所石正丽,通讯作者是石正丽,动
: 物所张树义,澳大利亚王林发
: 2005年pnas是港大袁国永组 Kwok-Yung Yuen
: 2017年的是石正丽作为通讯作者发的
: 2005:
: https://science.sciencemag.org/content/310/5748/676.long
: https://www.pnas.org/content/102/39/14040
: 2017
: https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.
: ...................