蛋白组组学研究还是转录组学研究

现在有两个项目可以做，一个是用LC-MS做蛋白组组学，研究药物与蛋白的相互作用，
用的是thermal proteome profilling方法。还有一个项目是转录组学项目，关于RNA-
seq，找可能的致病原因。从找工作的角度来看，哪个项目更好一点？

谢谢了。

再加一点信息，蛋白组学做的是细胞实验和动物实验。转录组学用的是临床病人的样本，临床找不到诊断结果，所以送来做研究。

可以两个都做吗？ 这样就没有你说的问题了：）

你的问题有点宽泛。找工作的话，回答你的问题之前可能得需要了解你的职业规划。不过我猜你应该还是学生。从数据处理的角度来看，两者的预处理会不一样，但下游的分析手段，统计概念和数据解释差不太多。如果你认真学都能以点带面进入数据处理这一行。所以能都做可以都做，不能都做，看项目前景和持续性。个人对第二个更感兴趣点，但是也看样本和实验设计。

【 在 wrs1024 () 的大作中提到: 】
: 现在有两个项目可以做，一个是用LC-MS做蛋白组组学，研究药物与蛋白的相互作用，
: 用的是thermal proteome profilling方法。还有一个项目是转录组学项目，关于RNA-
: seq，找可能的致病原因。从找工作的角度来看，哪个项目更好一点？
: 谢谢了。

谢谢您的回复呢。因为是两个实验室，所以不能全部都做呢。目前的规划是毕业之后去药企工作，所以想找个方向相对好进药企，以及有发展的。请问这两个项目做下去，哪个方向的研究的工作机会更多呢？

谢谢了

当然前者好,从基础研究到下游应用开发,从学校到公司都能用上,路宽多了,
后者路相对窄多了,学校也好公司也罢,就那么几个

【 在 wrs1024() 的大作中提到: 】

: 谢谢您的回复呢。因为是两个实验室，所以不能全部都做呢。目前的规划是毕业之后去

: 药企工作，所以想找个方向相对好进药企，以及有发展的。请问这两个项目做下去，哪

: 个方向的研究的工作机会更多呢？

: 谢谢了

去公司的话 proteomics 好一些。不管哪个，会独立分析这些组学数据最重要，至少会基本的pipeline。不要成为只会干活的tech。
如果以后打算做faculty的话，二者不做到mechanism的话，都很难。

谢谢您的回复呢，不过蛋白组学的蛋白来源是细胞实验和动物实验，RNA-seq的来源是
临床病人样本，是不是做临床疾病相关的课题会更有优势一点，药企会更喜欢？

【 在 yufengluo (yufeng) 的大作中提到: 】
: 当然前者好,从基础研究到下游应用开发,从学校到公司都能用上,路宽多了,
: 后者路相对窄多了,学校也好公司也罢,就那么几个
:
: 谢谢您的回复呢。因为是两个实验室，所以不能全部都做呢。目前的规划是毕业
: 之后去
:
: 药企工作，所以想找个方向相对好进药企，以及有发展的。请问这两个项目做下
: 去，哪
:
: 个方向的研究的工作机会更多呢？
:
: 谢谢了
:

标本来源不代表什么,你应该刚入行吧,呵呵

【 在 wrs1024() 的大作中提到: 】
<br>: 谢谢您的回复呢，不过蛋白组学的蛋白来源是细胞实验和动物实验，RNA-seq的
来源是
<br>: 临床病人样本，是不是做临床疾病相关的课题会更有优势一点，药企会更喜欢？
<br>

嗯嗯，刚在领域里做呢，在选项目，请您多多指教。

谢谢您的回复。

【 在 yufengluo (yufeng) 的大作中提到: 】
: 标本来源不代表什么,你应该刚入行吧,呵呵
:
: 谢谢您的回复呢，不过蛋白组学的蛋白来源是细胞实验和动物实验，RNA-
: seq的
: 来源是
:
: 临床病人样本，是不是做临床疾病相关的课题会更有优势一点，药企会更
: 喜欢？
:

Transciptomics for sure if you will also bo doing the computational analysis
.

请问可以分析下原因吗？蛋白组学还是转录组学，想着工业界工作机会多点的。

【 在 merrimac (不告诉你) 的大作中提到: 】
: Transciptomics for sure if you will also bo doing the computational
analysis
: .

蛋白，直觉，觉得这技术 有用的地方多！

【在 wrs1024()的大作中提到：】
：现在有两个项目可以做，一个是用LC-MS做蛋白组组学，研究药物与蛋白的相互作用，
：用的是thermal proteome profilling方法。还有一个项目是转录组学项目，关于RNA-

工业界的话 必须质谱仪 做的越分析化学越好找工作 进组的话天天蹲着仪器玩，会修
会保养 你毕业就会有工作。

single-cell RNA-seq 那一票一票的CNS 我觉得这泡沫越早破越好 数数细胞就发CNS让我太不开心了 和 羡慕嫉妒了

你想得有点简单。

我就学蛋白质组，会修仪器会保养仪器。找工作也是吃尽苦头，入职后一堆堆政治问题。老板的口号就是，我们这个技术非常容易，要把我们每一个人都变成可取代的。不断调整职责范围。并且我们招新人的时候，只要合组长胃口的，不要技术好的。整我都快吐血了。当然了，我只在一个小CRO 做事。心里一万头CNM经过。

【 在 higness (higness) 的大作中提到: 】
: 工业界的话 必须质谱仪 做的越分析化学越好找工作 进组的话天天蹲着仪器玩，会修
: 会保养 你毕业就会有工作。
: single-cell RNA-seq 那一票一票的CNS 我觉得这泡沫越早破越好 数数细胞就发CNS让
: 我太不开心了 和 羡慕嫉妒了

您好，谢谢您的回复。

您当时找工作是市面上工作机会不多吗？

【 在 skovsgaard (asdfasdf) 的大作中提到: 】
: 你想得有点简单。
: 我就学蛋白质组，会修仪器会保养仪器。找工作也是吃尽苦头，入职后一堆堆政治问题
: 。老板的口号就是，我们这个技术非常容易，要把我们每一个人都变成可取代的。不断
: 调整职责范围。并且我们招新人的时候，只要合组长胃口的，不要技术好的。整我都快
: 吐血了。当然了，我只在一个小CRO 做事。心里一万头CNM经过。

做proteomics的说两句：
1. generally，我个人感觉proteomics现在market还不错。
2. genenrally，如果有一些上下游的skill就不错，比如sample prep，到数据分析
3. 但是，学校里做的东西，绝大多数throughput都比较低，在公司里基本没什么用
4. thermal profiling这几年做了一大堆，我们自己in-house也develop了一个，
specifically在这个技术上我不觉得会非常hot。

5. RNA seq我不懂，不评论
【 在 wrs1024 () 的大作中提到: 】
: 现在有两个项目可以做，一个是用LC-MS做蛋白组组学，研究药物与蛋白的相互作用，
: 用的是thermal proteome profilling方法。还有一个项目是转录组学项目，关于RNA-
: seq，找可能的致病原因。从找工作的角度来看，哪个项目更好一点？
: 谢谢了。

会这个不能说屁用没有，但也没什么用。
【 在 higness (higness) 的大作中提到: 】
: 工业界的话 必须质谱仪 做的越分析化学越好找工作 进组的话天天蹲着仪器玩，会修
: 会保养 你毕业就会有工作。

您好，谢谢您的回复。请问下thermal proteome profilling和一般的proteomics有什
么区别吗？

【 在 goretex (GORE-TEX) 的大作中提到: 】
: 做proteomics的说两句：
: 1. generally，我个人感觉proteomics现在market还不错。
: 2. genenrally，如果有一些上下游的skill就不错，比如sample prep，到数据分析
: 3. 但是，学校里做的东西，绝大多数throughput都比较低，在公司里基本没什么用
: 4. thermal profiling这几年做了一大堆，我们自己in-house也develop了一个，
: specifically在这个技术上我不觉得会非常hot。
: 5. RNA seq我不懂，不评论

没什么区别。
【 在 wrs1024 () 的大作中提到: 】
: 您好，谢谢您的回复。请问下thermal proteome profilling和一般的proteomics有什
: 么区别吗？

谢谢您的回复呢。请问做proteomics去工业界的话，论文重要吗？至少有一篇一作
paper才好找工作吗？还是会技术就会好找工作？

【 在 higness (higness) 的大作中提到: 】
: 工业界的话 必须质谱仪 做的越分析化学越好找工作 进组的话天天蹲着仪器玩，会修
: 会保养 你毕业就会有工作。
: single-cell RNA-seq 那一票一票的CNS 我觉得这泡沫越早破越好 数数细胞就发CNS让
: 我太不开心了 和 羡慕嫉妒了

谢谢您的回复呢。请问做proteomics去工业界的话，论文重要吗？至少有一篇一作
paper才好找工作吗？还是会技术就会好找工作？

【 在 higness (higness) 的大作中提到: 】
: 工业界的话 必须质谱仪 做的越分析化学越好找工作 进组的话天天蹲着仪器玩，会修
: 会保养 你毕业就会有工作。
: single-cell RNA-seq 那一票一票的CNS 我觉得这泡沫越早破越好 数数细胞就发CNS让
: 我太不开心了 和 羡慕嫉妒了

谢谢您的回复呢。请问做proteomics去工业界的话，论文重要吗？至少有一篇一作
paper才好找工作吗？还是会上下游skill，market就不错？

【 在 goretex (GORE-TEX) 的大作中提到: 】
: 做proteomics的说两句：
: 1. generally，我个人感觉proteomics现在market还不错。
: 2. genenrally，如果有一些上下游的skill就不错，比如sample prep，到数据分析
: 3. 但是，学校里做的东西，绝大多数throughput都比较低，在公司里基本没什么用
: 4. thermal profiling这几年做了一大堆，我们自己in-house也develop了一个，
: specifically在这个技术上我不觉得会非常hot。
: 5. RNA seq我不懂，不评论

我觉得RNA-seq更有用。工业界做RNA-seq的应该比proteomics的更多吧。另外，临床数据，找疾病的biomarkers工业界也是比较重要的问题。