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最新回复:2020年4月1日 6点51分 PT
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M
MaldiniAC
大约 4 年
楼主 (未名空间)
想用image J 分析图片的荧光强度,比如我的实验有一团细胞(球体)带了荧光,而由于treatment,这团细胞变得分散了,因此要比较的对象的面积不一样,这种情况下,你
们在image J里用wand tool来选定要分析的区域,还是用别的。我同事教我用wand,但遇到细胞分散不成团的情况下,我点击我想分析的地方,wand都不出现,点来点去,没有那个黄圈,因此没法选,没法分析,怎么办?谢谢
M
MaldiniAC
大约 4 年
2 楼
我琢磨了一下,我这种情况,是不是应该用 freehand selections
【 在 MaldiniAC (小马哥) 的大作中提到: 】
: 想用image J 分析图片的荧光强度,比如我的实验有一团细胞(球体)带了荧光,而由于
: treatment,这团细胞变得分散了,因此要比较的对象的面积不一样,这种情况下,你
: 们在image J里用wand tool来选定要分析的区域,还是用别的。我同事教我用wand,但
: 遇到细胞分散不成团的情况下,我点击我想分析的地方,wand都不出现,点来点去,没
: 有那个黄圈,因此没法选,没法分析,怎么办?谢谢
s
shanggj
大约 4 年
3 楼
If they are few cells, you can use freehand selection to draw outlines
manually.
if they are many cells, you need first set the threshold, then use wand
tool to select region above the threhosld.
if they are way too many cells, you need to set the threshold, they use "
Analyze" -> "Analyze Particles" to get the ROI selections automatically.
check the manual for details
https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/index.html
also it is "ImageJ", not "image J"
【 在 MaldiniAC (小马哥) 的大作中提到: 】
: 想用image J 分析图片的荧光强度,比如我的实验有一团细胞(球体)带了荧光,而由于
: treatment,这团细胞变得分散了,因此要比较的对象的面积不一样,这种情况下,你
: 们在image J里用wand tool来选定要分析的区域,还是用别的。我同事教我用wand,但
: 遇到细胞分散不成团的情况下,我点击我想分析的地方,wand都不出现,点来点去,没
: 有那个黄圈,因此没法选,没法分析,怎么办?谢谢
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想用image J 分析图片的荧光强度,比如我的实验有一团细胞(球体)带了荧光,而由于treatment,这团细胞变得分散了,因此要比较的对象的面积不一样,这种情况下,你
们在image J里用wand tool来选定要分析的区域,还是用别的。我同事教我用wand,但遇到细胞分散不成团的情况下,我点击我想分析的地方,wand都不出现,点来点去,没有那个黄圈,因此没法选,没法分析,怎么办?谢谢
我琢磨了一下,我这种情况,是不是应该用 freehand selections
【 在 MaldiniAC (小马哥) 的大作中提到: 】
: 想用image J 分析图片的荧光强度,比如我的实验有一团细胞(球体)带了荧光,而由于
: treatment,这团细胞变得分散了,因此要比较的对象的面积不一样,这种情况下,你
: 们在image J里用wand tool来选定要分析的区域,还是用别的。我同事教我用wand,但
: 遇到细胞分散不成团的情况下,我点击我想分析的地方,wand都不出现,点来点去,没
: 有那个黄圈,因此没法选,没法分析,怎么办?谢谢
If they are few cells, you can use freehand selection to draw outlines
manually.
if they are many cells, you need first set the threshold, then use wand
tool to select region above the threhosld.
if they are way too many cells, you need to set the threshold, they use "
Analyze" -> "Analyze Particles" to get the ROI selections automatically.
check the manual for details https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/index.html
also it is "ImageJ", not "image J"
【 在 MaldiniAC (小马哥) 的大作中提到: 】
: 想用image J 分析图片的荧光强度,比如我的实验有一团细胞(球体)带了荧光,而由于
: treatment,这团细胞变得分散了,因此要比较的对象的面积不一样,这种情况下,你
: 们在image J里用wand tool来选定要分析的区域,还是用别的。我同事教我用wand,但
: 遇到细胞分散不成团的情况下,我点击我想分析的地方,wand都不出现,点来点去,没
: 有那个黄圈,因此没法选,没法分析,怎么办?谢谢