新手问一个问题:如果NgAgo是真的,它对比cripr强在什么地方?

l
love2000
楼主 (未名空间)
我也相信韩春雨是个骗子,但有点好奇的是为什么NgAgo刚刚出来的时候这么轰动,都
说它比crispr强一代,是第五代的基因编辑工具,要强于crispr,那么,如果NgAgo是
真的,它到底强在什么地方?就听人说好像knock in效率会强一些,其它不知道了
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PBSNPR
2 楼
现在问这种问题是不是。。。。。

【 在 love2000 (爱情) 的大作中提到: 】
我也相信韩春雨是个骗子,但有点好奇的是为什么NgAgo刚刚出来的时候这么轰动,都
说它比crispr强一代,是第五代的基因编辑工具,要强于crispr,那么,如果NgAgo是
真的,它到底强在什么地方?就听人说好像knock in效率会强一些,其它不知道了
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midwestPstD
3 楼
1。NgAgo比Cas9小,(887 aa:1168aa)。这个在病毒载体包装等上面有优势。
2。和Cas9结合的是RNA,NgAgo结合的是DNA。合成和操作,DNA稳定性好。
3。Cas9需要NGG这个PAM序列,而NgAgo不需要。也就是NgAgo可以切任何想切的地方。
Cas9有限制。
4。从韩的文章来看,NgAgo的off-target比Cas9机会小,因为:1,细胞里小DNA分子比小RNA少得多;2。NgAgo对guide上的mis-match的容忍度小。
P
PBSNPR
4 楼
你还真的顺着杆子往上爬了。

有NgAgo这种东西吗?

【 在 midwestPstD (中西部博士后) 的大作中提到: 】
1。NgAgo比Cas9小,(887 aa:1168aa)。这个在病毒载体包装等上面有优势。
2。和Cas9结合的是RNA,NgAgo结合的是DNA。合成和操作,DNA稳定性好。
3。Cas9需要NGG这个PAM序列,而NgAgo不需要。也就是NgAgo可以切任何想切的地方。
Cas9有限制。
4。从韩的文章来看,NgAgo的off-target比Cas9机会小,因为:1,细胞里小DNA分子比
小RNA少得多;2。NgAgo对guide上的mis-match的容忍度小。
g
goretex
5 楼
不是Ago之前有文章么,只是条件苛刻温度很高
【 在 PBSNPR (大刀王五) 的大作中提到: 】
你还真的顺着杆子往上爬了。
有NgAgo这种东西吗?
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thinkit
6 楼
nice ,thank you
【 在 midwestPstD (中西部博士后) 的大作中提到: 】
1。NgAgo比Cas9小,(887 aa:1168aa)。这个在病毒载体包装等上面有优势。
2。和Cas9结合的是RNA,NgAgo结合的是DNA。合成和操作,DNA稳定性好。
3。Cas9需要NGG这个PAM序列,而NgAgo不需要。也就是NgAgo可以切任何想切的地方。
Cas9有限制。
4。从韩的文章来看,NgAgo的off-target比Cas9机会小,因为:1,细胞里小DNA分子比
小RNA少得多;2。NgAgo对guide上的mis-match的容忍度小。
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love2000
7 楼
虽然说韩春雨很假,可NgAgo早就是被证明的切割基因的功能,只不过是高温下工作而已

【 在 PBSNPR (大刀王五) 的大作中提到: 】
你还真的顺着杆子往上爬了。
有NgAgo这种东西吗?
l
love2000
8 楼
非常感谢,分子生物学功底深厚

【 在 midwestPstD (中西部博士后) 的大作中提到: 】
1。NgAgo比Cas9小,(887 aa:1168aa)。这个在病毒载体包装等上面有优势。
2。和Cas9结合的是RNA,NgAgo结合的是DNA。合成和操作,DNA稳定性好。
3。Cas9需要NGG这个PAM序列,而NgAgo不需要。也就是NgAgo可以切任何想切的地方。
Cas9有限制。
4。从韩的文章来看,NgAgo的off-target比Cas9机会小,因为:1,细胞里小DNA分子比
小RNA少得多;2。NgAgo对guide上的mis-match的容忍度小。
c
coinbycoin
9 楼
【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
编者注 2016年12月15日

- 如果 love2000 (爱情) @mitbbs 符合以下指南描述的条件

跟帖格式指南:【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
第一类实例记录http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32035279.html

- 此贴
“新手问一个问题:如果NgAgo是真的,它对比cripr强在什么地方?”http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32055697.html

暂作为第一类实例收录于
【记录历史】谁重复验证了NgAgo?http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32034437.html

- 此前第一类实例发布人有: “火锅哥”, “晚饭哥”

第一类“重复” 验证实验信息:匿名或无记名,网络、论坛发布
- 成功重复、拓展验证韩春雨NgAgo实验
- 包含无任何实验细节描述,无发布方城市,国家等细节的信息发布
- 不包含以韩春雨名义单方发布的信息

信息简述:
- 发布方: love2000 (爱情) @mitbbs
- 发布时间:2016年12月15日
- 发布平台:mitbbs biology
- 发布方国家:未知
- 发布方城市:未知
- 发布方研究机构:未知
- 实验室PI:未知
- NgAgo的来源:未知
- 应用验证实验结果:

"虽然说韩春雨很假,可NgAgo早就是被证明的切割基因的功能,只不过是高温下工作而已"

- 应用验证实验详细信息:未知
- 实验数据发表状态:未知
- 实验数据发表的科研杂志:未知

编者注:

1. 据目前已发布的重复数据,以及从可查到发布人真实身份的声明及发表的文献来看:

NgAgo NBT文章中所有数据及结论,包括 NgAgo 的 in vitro DNA cleavage 功能,以
及 NgAgo 的 in vivo genome editing 功能, 都存在很大的可疑性

2. 至今为止,韩春雨以及他的论文合作者们,没有为他们的NgAgo NBT 论文中发表的
任何一个数据及结论提供原始数据, 也没有提供任何实验细节及数据来证明他们自己
可以重复其中任何一个实验

详见http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32034437.html

3. 关于NgAgo 的 in vitro DNA cleavage 功能 特别记录

信息来源:知识分子 (饶毅,鲁白,谢宇 主编)
link:http://wemedia.ifeng.com/282574491824201/wemedia.shtml

“知识分子在和许多科研人员联系过之后,公布了一些失败的实例信息;其中一则实例,在此特别记录: 据报导 Dr John van der Oost {注 2014自然杂志TtAgo文章通讯作者} 实验室
在体外尝试用NgAgo切割(DNA)片段和质粒,无法重复韩春雨发表的数据”

4. 关于NgAgo in vitro DNA cleavage 功能 实例记录- 第三类信息,第二例

- 实验数据发表的科研杂志:Protein & Cell
Linkhttps://link.springer.com/article/10.1007/s13238-016-0343-9

- 这篇PC文章包含大量实验数据,对于NgAgo NBT文章的重复性,有较全面的覆盖:
NBT NgAgo 文章中所有的数据及结论,都存在可疑性

- Fig 1,2,3a/b, 4, 5, supplementary fig4 以及其他相关supplementary fig 中的
相关结果, failed to replicate

- Fig 3c, 是否和NgAgo的自身功能相关,存有较大疑问

- Argonaute (Ago)protein family plays a central role in RNA silencing
processes (RNAi)

- Function of TtAgo was described as “DNA-guided DNA interference” in
a 2014 Nature paper, by lab of Dr John van der Oost

- 这篇PC文章成功验证了TtAgo 的in vitro DNA cleavage功能,
而NgAgo 却无法 cleave DNA in vitro

- The TtAgo paper has “inspired” the creation of the 2016 NgAgo NBT
article

【 在 love2000 (爱情) 的大作中提到: 】
虽然说韩春雨很假,可NgAgo早就是被证明的切割基因的功能,只不过是高温下工作
而已