推荐几个常用的文献管理软件和文献追踪软件

liulin0809
楼主 (未名空间)
有朋友留言说经常被论文文献搞得头大,让我推荐几个常用的文献管理软件。所以,我今天就给大家推荐几个常用的文献管理软件,如果用的好,一定能够解决你的文献问题。

常用的文献管理软件大概首推EndNote了,但是除了 EndNote还有很多文献管理软件,
有的是公开源代码,有的是免费。国产的也有几个文献管理软件。

1、Endnote

EndNote的功能强大自不必说。强大到何种程度,几乎没有它不能解决的问题,即使某
些变态的极其复杂的引文和输出格式,也能轻松应对。

除此之外,EndNote的强大之处还在于其自定义特性,通过自定义EndNote的输出格式,滤件和连接论文件。

但是EndNote也有很多不足,比如分组只支持二级目录,EndNote也不支持标签。相比之下的Zotero这方面就强大的多,可以支持多级分类目录,还可以为文献打标签。

其实这也都不是事儿,最主要的是EndNote是商业软件,对于普通个人用户,太贵了。
不过EndNote厚道之处在于没有验证机制,只要有授权文件就能用,而且网上的授权文
件一找就能找到。最著名的应该是同济大学的授权文件了,真是造福了不少穷学生。

顺便说一句,以前的Reference Manager和ProCite这两个文献管理软件现在也被
EndNote收购了。

EndNote 相关资源

EndNote 官网http://www.endnote.com/

Output Styles 下载http://endnote.com/downloads/dla/styles.zip

Import filters 下载http://endnote.com/downloads/dla/filters.zip

Connection files 下载http://endnote.com/downloads/dla/connections.zip

Writing templates 下载http://endnote.com/downloads/dla/templates.zip

EndNote 中文帮助https://www.howsci.com/endnote/

2、Mendeley

Mendeley功能非常强大,总起来说Mendeley有以下特点。

免费,这个比较重要。

支持多平台。迄今Mendeley有网页版,Windows版,Mac版,Linux版,甚至还有iPhone
,iPad,iPod版。

支持Microsoft Word, LibreOffice, and LaTeX等软件。

支持PDF标记。可以直接在PDF文档中做相应的标记和注释,这样文章重点部分就可以重点突出了,下次再看时就知道重点和难点了。

支持从其它参考文献管理软件导入文献,现在支持EndNote, Papers 和 Zotero。

可以组织管理文献,通过文件夹的形式把文献分类,管理起来文献简单明了。

可以和同事们分享文献,甚至注释和标记也可以分享。这样大家协作起来更方便。

支持网络备份,而且多个平台之间支持同步。

支持PDF文件导入并自动提取文章信息,支持自动导入特定文件夹内的文献。

强大的搜索功能,可以搜索PDF全文。

强大的社区功能。这才是Mendeley的精髓所在。现在新兴的文献评价标准Altmetric参
考因素之一就包括Mendeley的社区功能,如利用Plum Metrics评价系统了解论文的关注度分享情况。

ResearchGate科研人员自己的FaceBook其中一项指标也包括Mendeley的社区。

Mendeley 相关资源

Mendeley 官网https://www.mendeley.com/dashboard/

Mendeley for Windowshttps://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/windows/instructions/

Mendeley for Mac OS X 10.6+https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/mac/instructions/

Mendeley Desktop for Linuxhttps://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/linux/

Mendeley for iPhone, iPod Touch and iPadhttps://itunes.apple.com/gb/app/mendeley-reference-manager/id380669300

3、Zotero

Zotero是一个开放源代码的文献管理软件。Zotero特色之处是可以作为浏览器插件进行使用。本地的Zotero的文献数据库还可以免费上传到Zotero的网络服务器上,并且不受空间大小限制。但是本地的Zotero的附件,在网络服务器上有大小限制,Zotero的网络服务器仅为每用户提供300M免费存储容量。

Zotero和EndNote也曾干过仗,2008年, 汤森路透起诉 Zotero 侵犯了EndNote的最终用户许可协议 (EULA),逆向工程了EndNote,提供了Zotero把EndNote私有的 .ens风格转换为Citation Style Language风格。

Zotero相比于EndNote,免费不用说,最大的特色是无限级的目录分类,一个目录下可
以分为多个子目录。这样管理起来文献就方便多了,而EndNote只支持二级目录。

Zotero还支持文献的标签功能。为每个文献自动打上标签,当然用户也可以自定义标签,这又增加了文献管理功能。

不过Zotero的插入引文和参考文献相比于EndNote来就弱了许多,支持的输出格式也相
对有效,只是支持几个大类的输出格式,并没有具体的杂志格式。可能我的理解有错误,但是至少现在我还没找到修改或者添加引文格式的方法。

Zotero相关资源

Zotero官网https://www.zotero.org

Zotero for Windowshttps://download.zotero.org/standalone/4.0.28/Zotero-4.0.28_setup.exe

Zotero for Chromehttps://chrome.google.com/webstore/detail/ekhagklcjbdpajgpjgmbionohlpdbjgc

Zotero for Firefoxhttps://download.zotero.org/extension/zotero-4.0.28.3.xpi

Zotero for Safarihttps://download.zotero.org/connector/safari/Zotero_Connector-4.0.21-1.
safariextz

4、JabRef

JabRef是一个开放源代码、处理BibTeX格式的文献管理软件,提供了简易操作的界面来编辑BibTeX档案。 功能包含从网络上的科学数据库汇入资料,以及整理和搜寻BibTeX
档案等。

JabRef的发布遵循GNU通用公共授权条款。软件则是用Java作编程,可以使用于各种操
作系统,如Windows、Linux、Mac OS X。

JabRef最初的版本发布于2003年11月29日。其名称JabRef代表着Java、Alver、Batada
、Reference。其中Alver 和Batada分别为Morten O. Alver 和 Nizar Batada,两位最初的开发者。

JabRef 相关资源

JabRef官网http://jabref.sourceforge.net/

JabRef最新稳定版下载http://sourceforge.net/projects/jabref/files/jabref/2.10/

5、NoteExpress

NoteExpress是一个国产文献管理软件,据说对中文文献和中文数据库的支持比EndNote好。在国内也有不少用户,不过这个软件是商业软件,学生版198,永久版需要 698 元。

但是有这钱我就用Zotero,因此对NoteExpress 一直不感冒。网上也有破解版的,但是也没有尝试过。顺便说一句,尽量不要使用破解版的软件。

NoteExpress相关资源

NoteExpress官网http://www.inoteexpress.com/

NoteExpress购买http://www.inoteexpress.com/CompanyWeb/cartstart.do

6、医学文献王

医学文献王是医脉通出品的一个文献管理软件。说起医脉通可能知道的人不是很多,但是要是说起《新编全医药大词典》那在几年前在医学科研人员和学生中那可真是无人不知,无人不晓啊。

医学文献王就是医脉通,不过以前叫金叶天盛。医学文献分为标准版和专业版两个版本,标准版具有软件的核心功能,只要是医脉通用户均可免费使用。专业版授权软件的全部功能,标准版输入激活码后即可激活为专业版,专业版 280 元。

医学文献王相关资源

医学文献王官网http://refer.medlive.cn/

标准版和专业版功能比较http://refer.medlive.cn/templates/major.tpl.php

暂且就先列举这些吧,虽然未难全部,但是也能供大家做个选择了。基本上这些就是主流的文献管理软件了,如果你能够用好其中一个,基本上就能够解决让人头疼的文献问题了。
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文献追踪小工具:Stork文献鸟
网址: http://www.storkapp.me/?ref=liulincn

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c
crispr2016
2 楼
实践证明,这几个软件实际跟垃圾桶没有任何差别。文献量一大,一样不能快速定位你需要的文献。
我一直使用word管理自己的文献,虽然看似笨拙,到后面文献量越来越大的时候,这种方法反而显得游刃有余。
c
calman
3 楼
自己不会搞卫生 说每家都是垃圾桶
人笨怪刀钝的典型

mendeley wins hands down over others

【 在 crispr2016 () 的大作中提到: 】
实践证明,这几个软件实际跟垃圾桶没有任何差别。文献量一大,一样不能快速定位你
需要的文献。
我一直使用word管理自己的文献,虽然看似笨拙,到后面文献量越来越大的时候,这种
方法反而显得游刃有余。
C
Charles
4 楼
Papers http://papersapp.com/mac/
c
crispr2016
5 楼
你估计从来没有使用word管理文献过,endnote和mendeley我都是用了一段时间的,是
经过比较多,word管理文献方法是从之前一位发文章发着玩的大牛那里学来的,前提是你要会玩word。

【 在 calman (两年之后) 的大作中提到: 】
自己不会搞卫生 说每家都是垃圾桶
人笨怪刀钝的典型
mendeley wins hands down over others
Hug
6 楼
我用的是endnote X7. Endnote是支持标签的啊。

在每一篇文献里都有Label选项,你可以输入自己定义的任何标签,endnote也支持用你输入的标签词来搜索文献,或者用你输入的标签词来给文献分组。
m
maxdna
7 楼
这些软件基本上都试过。现在主要用papers,用dropbox同步。
Endnote 在大学里还是主流,图书馆基本上都会买license.
Endnote写作还行,看文献管理pdf不是很好用。

superdonkey
8 楼
其实onenote很好用,PDF可以一个一个拖进去,也可以同步

Endnote只有写文章的时候才用
ilsh
9 楼
Stork很实用。对第一时间了解科研动态很有帮助。http://www.storkapp.me/?ref=liulincn
c
crispr2016
10 楼
第一时间了解科研动态不需要靠软件的

你自己所从事的方向,你有义务随时用pubmed或者google搜索进展

【 在 ilsh (big+bang) 的大作中提到: 】
Stork很实用。对第一时间了解科研动态很有帮助。
http://www.storkapp.me/?ref=liulincn
m
maxdna
11 楼
pubmed或者google难道不是软件?

【 在 crispr2016 () 的大作中提到: 】
第一时间了解科研动态不需要靠软件的
你自己所从事的方向,你有义务随时用pubmed或者google搜索进展
verdelite
12 楼
我用打印的,也很好用。我们领域小,就那么些lab,按照PI分文件夹,文件夹里面的
文件按照日期排序就都解决了。要找哪个文献,拉开柜子就全解决了。pdf存电脑里,
也是按照PI排序的。
liulin0809
15 楼
的确,pdf管理也可以用paperbox
【 在 maxdna (sunset heaven) 的大作中提到: 】
这些软件基本上都试过。现在主要用papers,用dropbox同步。
Endnote 在大学里还是主流,图书馆基本上都会买license.
Endnote写作还行,看文献管理pdf不是很好用。
liulin0809
16 楼
算是功能插件,这个不用纠结
【 在 maxdna (sunset heaven) 的大作中提到: 】
pubmed或者google难道不是软件?
m
maxdna
17 楼
插件也是软件一部分么,搞生物的不要拒绝新工具,思想开放点比较好。

【 在 liulin0809 (东方月初) 的大作中提到: 】
算是功能插件,这个不用纠结