目前都还比较preliminary, 但是感觉是好消息，继续敲木头 Gupta Lab 的研究认为omicron有可能不擅长生成合胞体 （左图）。 关于合胞体：新冠刺突会把几个细胞黏在一起形成多核合胞体 (见右图）。如果免疫细胞去追杀新冠，反而会被憋死在里面。这个合胞体的机制有可能和之后的肺损伤和免疫风暴相关。 Omicron Spike protein induces relatively poor cell-cell fusion compared to WT and Delta. We expressed spike in cells stably expressing split GFP, so that Green signal could be measured over time upon cell-cell fusion and syncitia formation. The difference is significant. What does this all mean? Efficient infection of lung cells could correlate with severity of lung disease. Syncitia or fused cells are often seen in respiratory tissues taken following severe disease. Delta was very good at both, in contrast to Omicron. Further work is needed 港大研究omicron更擅长支气管（感染速度增加70倍）但是对肺的感染力降低 （10倍） https://www.med.hku.hk/en/news/press/20211215-omicron-sars-cov-2-infection
如果一个支气管里都是病毒的人在身边，那确实只有N95能防感染。 CDC data showed the most common symptoms so far are cough, fatigue, congestion and a runny nose. vitd120 发表于 2021-12-18 12:49
The top five symptoms reported in the ZOE app were: runny nose headache fatigue (either mild or severe) sneezing sore throat UK report: Many of those infected have reported having a scratchy throat as opposed to a sore throat. SA Patients presentations Blocked or runny nose Headache Tiredness Scratchy or sore throat Body aches
The top five symptoms reported in the ZOE app were: runny nose headache fatigue (either mild or severe) sneezing sore throat vitd120 发表于 2021-12-18 19:12
继续搬运，这个是osu团队的： https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.16.472934v1 Additionally, the Omicron spike exhibits reduced receptor binding, cell-cell fusion, S1 subunit shedding, but increased cell-to-cell transmission, and homology modeling indicates a more stable closed S structure. [ 感觉是细胞间传染力加强，但是毒性减小了，对ace2的结合能力也降低】 Unexpectedly, we found that Omicron drastically increased the efficiency of cell-to-cell transmission, with 4.8-fold higher levels than D614G and other variants, despite comparable levels of cell-free infection (Fig. 1b), reduced ACE2 binding (Fig. 2c), and reduced cell-cell fusion (Fig. 2e).
We found that Omicron S, similar to that of Alpha, exhibited a reduced furin processing into S1 compared to D614G and Beta; consistent with prior reports , the Delta variant showed increased furin cleavage in the spike [S的furin不太容易被切开成S1了，跟delta相反。有可能是由于furtin沟里的mutation造成】 Notably, substantially less S1 was detectable in purified Omicron pseudotyped virus 之前好像在哪个youtube上看人猜测切开的S1比合在一起的S1/S2糟糕。 以下绿图是显示各种不同spike造成的cell-cell fusion 【合胞体】, 看起来delta和beta比较厉害，omicron比较轻 We observed a marked reduction in the size of syncytia induced by Omicron S compared to other variants, especially by Delta and Beta
继续搬运，这个是osu团队的： https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.16.472934v1 Additionally, the Omicron spike exhibits reduced receptor binding, cell-cell fusion, S1 subunit shedding, but increased cell-to-cell transmission, and homology modeling indicates a more stable closed S structure. [ 感觉是细胞间传染力加强，但是毒性减小了，对ace2的结合能力也降低】 Unexpectedly, we found that Omicron drastically increased the efficiency of cell-to-cell transmission, with 4.8-fold higher levels than D614G and other variants, despite comparable levels of cell-free infection (Fig. 1b), reduced ACE2 binding (Fig. 2c), and reduced cell-cell fusion (Fig. 2e).
We found that Omicron S, similar to that of Alpha, exhibited a reduced furin processing into S1 compared to D614G and Beta; consistent with prior reports , the Delta variant showed increased furin cleavage in the spike [S的furin不太容易被切开成S1了，跟delta相反。有可能是由于furtin沟里的mutation造成】 Notably, substantially less S1 was detectable in purified Omicron pseudotyped virus 之前好像在哪个youtube上看人猜测切开的S1比合在一起的S1/S2糟糕。 以下绿图是显示各种不同spike造成的cell-cell fusion 【合胞体】, 看起来delta和beta比较厉害，omicron比较轻 We observed a marked reduction in the size of syncytia induced by Omicron S compared to other variants, especially by Delta and Beta
细胞间传播加剧是个坏消息，因为抗体无法抑制细胞间传播，只有靠细胞免疫了. "Substantially less S1 was detectable in purified Omicron pseudotyped virus",这个其实和弗林酶切点位效率降低是一致的.RBD和抗体结合后,病毒误以为已经和细胞结合,就开始下一步的弗林酶切反应,切掉S1,这个病毒颗粒也就废掉了. 这个路径据推测是新冠能对疫苗反应的重要原因,毕竟sarbecoronavirous里新冠是唯一有疫苗的. 失去切掉S1的能力,有可能会回到别的sarbecoronavirous没有疫苗的绝望境地.
苏格兰： https://www.research.ed.ac.uk/en/publications/severity-of-omicron-variant-of-concern-and-vaccine-effectiveness- There were 15 hospital admissions in those S gene negative giving an adjusted observed/expected ratio of 0.32 (95% CI 0.19, 0.52). 【住院下降68%，o从阳性开始15天内住院率为0.1%-0.2%】
Gupta Lab 的研究认为omicron有可能不擅长生成合胞体 （左图）。 关于合胞体：新冠刺突会把几个细胞黏在一起形成多核合胞体 (见右图）。如果免疫细胞去追杀新冠，反而会被憋死在里面。这个合胞体的机制有可能和之后的肺损伤和免疫风暴相关。
Omicron Spike protein induces relatively poor cell-cell fusion compared to WT and Delta. We expressed spike in cells stably expressing split GFP, so that Green signal could be measured over time upon cell-cell fusion and syncitia formation. The difference is significant.
What does this all mean? Efficient infection of lung cells could correlate with severity of lung disease. Syncitia or fused cells are often seen in respiratory tissues taken following severe disease. Delta was very good at both, in contrast to Omicron. Further work is needed
港大研究omicron更擅长支气管（感染速度增加70倍）但是对肺的感染力降低 （10倍）
再等等icu和死亡率的数据，现在数据还少
两回事，这个研究只看症状和住院率。南非的数据显示住院病人中ICU比例降低，尤其是上呼吸机的比例只有Delta的1/4。这才是楼主转的研究的意义。上呼吸机减少，死亡率就降低，住院感染率不低，但是能活下去。
南非平均年纪非常年轻，而且大多数人上一波都的得过了，数据对美国没有太多参考价值。
对，我的猜测是病人支气管都是病毒，就会不停咳嗽，加上传染性强得病的基数大，这一批住院的还是会挺多
但是中症（缺氧）是需要大幅感染肺细胞的，重症可能跟病毒从肺里继续跑到血里有关。如果omicron真的不擅长肺了，那中症和重症就会相应减少。目前这些还需要等数据，希望会是这样
按照你的张嘴就来的感人逻辑:美国老人第一波体弱的死一大半了，疫苗比例也高，有自然免疫也有一个多亿，数据应该比南非更好呀
这两组数据看着确实很乐观，过两周就知道是否又是空欢喜了。
合胞体是病毒逃脱体液免疫的一种方式，因为抗体免疫对细胞间的传播完全无效。Omicron实现了完全的体液免疫逃脱，就没必要像Delta那样还要保持合胞体免疫逃脱。至于合胞体是否触发了免疫风暴，这个争论很多。不少数据指向免疫风暴是抗体依赖增强效应引发的。
哎，过两周uk出数据了就知道啦，希望不是空欢喜啊
有不少人认为新冠的毒性主要来自于超级病原Y674QTQTNSPRRAR685，好消息是Omicron有两个变异N679K, P681H正好在这个超级病原上，这两个变异有可能会导致Omicron的毒性大减。 https://www.pnas.org/content/117/41/25254
希望这个cleavage是朝不致病的方向演化了！
这不是我张嘴来的，是各个媒体都在这么讲，我觉得有道理。你咬人太随意了。
是的，谨慎乐观，N95还是要带好
如果你的猜测是对的，唯一的对策就是人人都戴口罩。
如果一个支气管里都是病毒的人在身边，那确实只有N95能防感染。
CDC data showed the most common symptoms so far are cough, fatigue, congestion and a runny nose.
希望真的如此。
我前两天买的byd挂耳朵的也失败了。。。不过买的其它几种还不错可以推荐
--感觉最保险的： 3m 9205 (有些人说1870也不错没买过）
--可以长时间带又比较保险的 (按透气性排）: 3m vflex (9105), blue 3d kf-94, dr puri (透气性比blue稍逊，注意别买到假货）
--如果一定要带surgical的, 室内需要加一个mask fitter...我觉得这俩月surgical可能不够
3m有没有挂耳式的？头戴式的根本戴不住，感觉头太圆两根线一会儿就都滑到脖子了
3M AFFM-5 是个挂耳的KN95. 我试了下觉得还不错吧，比一般的kn95强点。但是要最保险还是套头的
嗯，broad air pro其实真的不错，不介意那个管的可以带。小盒子边缘可以拿透明胶黏一下
这个终究不是长久之计 各种致病菌 很可能在今后几十年接踵而来 至少生物克隆 RNAi Crispr 等技术魔盒已经打开 全世界有无数的 BSLIII IV实验室 每个都是充满了 超级Bug 一不小心 就会泄露出来 防不胜防
所以行善积德 强身健体是根本
杀人放火金腰带…… 死掉多少人都是坏人？
UK report: Many of those infected have reported having a scratchy throat as opposed to a sore throat.
SA Patients presentations Blocked or runny nose Headache Tiredness Scratchy or sore throat Body aches
这基本是感冒症状吧。。也没发烧
希望吧。。。但是感染的人会很多，虽然有可能MILD不知道医院会挤满不
扎个马尾，扎高一点，把上面那根线卡住
南非之前得过的和美国之前苗过的，区别在哪里呢？
好消息。变的花样太多把自己作死了
光活下去能说明什么？有没有长期病症？以后全民肺炎？每次说话前先咳嗽5分钟？
敲木头。 西班牙流感也是三年时间突变成毒性弱的病毒。 新冠明年就第三年了。
Still controversial. 丹麦数据
楼主贴的是生物学的机理层次的研究。你贴的这个是一个新闻报道引述的不知道发没发表的传染和就医数据分析。
另外，后者并不否定前者，没看出controversial在哪。
1918流感不是突变成毒性弱的消失了而是基本上能感染的都感染一遍了。应死尽死了，剩下的都是流感病毒杀不死的人了。流感病毒还有潜伏期短季节性这些特点，新冠完全不同。所以新冠没可能突然消失的。
对，拍老师让我们不要大意，继续焦虑。。。
不是， 西班牙流感是三年所有人都被传染过了， 不行的都淘汰掉了。 西班牙流感病毒一直传到现在， 我们都是祖先活下来的。
是的，我以前学微生物的时候老师就说没有一种病原体可以毁灭一个物种，能毁灭10-15%就已经是顶天了，就是因为基因的多样性，有的个体可以survive。只有转基因物种因为基因完全一样才会被团灭，比如夏威夷木瓜。或者爱尔兰马铃薯，虽然不是转基因，但来自于同一棵祖先。现在折腾来折腾去也就是让这些易感群体慢慢地死，不至于一个大peak消失大半。疫苗赶不上突变，没有有效药物，就只能像现在这样不停的打疫苗，时不时的lockdown，直到易感人群没有了，covid才真正变感冒了。期待有效药物吧，更能解决问题一些。
https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-omicron-daily-overview
拍老师说在鼻部细胞同时放上omicron和delta，结果delta竞争惨败
美国还一大半打了疫苗呢
没有，所以只能留长头发，扎马尾。这样就挂住了
Additionally, the Omicron spike exhibits reduced receptor binding, cell-cell fusion, S1 subunit shedding, but increased cell-to-cell transmission, and homology modeling indicates a more stable closed S structure. [ 感觉是细胞间传染力加强，但是毒性减小了，对ace2的结合能力也降低】
Unexpectedly, we found that Omicron drastically increased the efficiency of cell-to-cell transmission, with 4.8-fold higher levels than D614G and other variants, despite comparable levels of cell-free infection (Fig. 1b), reduced ACE2 binding (Fig. 2c), and reduced cell-cell fusion (Fig. 2e).
We found that Omicron S, similar to that of Alpha, exhibited a reduced furin processing into S1 compared to D614G and Beta; consistent with prior reports , the Delta variant showed increased furin cleavage in the spike [S的furin不太容易被切开成S1了，跟delta相反。有可能是由于furtin沟里的mutation造成】
Notably, substantially less S1 was detectable in purified Omicron pseudotyped virus 之前好像在哪个youtube上看人猜测切开的S1比合在一起的S1/S2糟糕。
以下绿图是显示各种不同spike造成的cell-cell fusion 【合胞体】, 看起来delta和beta比较厉害，omicron比较轻 We observed a marked reduction in the size of syncytia induced by Omicron S compared to other variants, especially by Delta and Beta
解说见 https://mp.weixin.qq.com/s/xq0K0CT2tx-9fraD0bmoYw
细胞间传播加剧是个坏消息，因为抗体无法抑制细胞间传播，只有靠细胞免疫了.
"Substantially less S1 was detectable in purified Omicron pseudotyped virus",这个其实和弗林酶切点位效率降低是一致的.RBD和抗体结合后,病毒误以为已经和细胞结合,就开始下一步的弗林酶切反应,切掉S1,这个病毒颗粒也就废掉了. 这个路径据推测是新冠能对疫苗反应的重要原因,毕竟sarbecoronavirous里新冠是唯一有疫苗的. 失去切掉S1的能力,有可能会回到别的sarbecoronavirous没有疫苗的绝望境地.
如果s1切不掉这个病毒是不是就没有这么毒了？感觉毒性很多来自这个furin沟
弗林酶切不掉的话，还有TMPRSS2接着可以切。萨斯之类的没有弗林酶切点，毒性更强。另外，游离的S1少只能说明被误切的S1少，RBD和细胞结合后，切S1的效率是否低还很难说。
如果furin沟残破了，TMPRSS2也许就不喜欢切了。。。
这个table难道在说，感染Omicron的病人比感染Delta的病人，更容易住院Hospitalisation，更容易进Intensive care treatment？而且这个比率高了3-4倍？
是我搞错了。
据说缺氧要中招7天后出现
嗯 同觉得现在说mild为时过早
“Gupta老师的发现其实暗示了一个可能性， 那就是，Omicron可能真的是刚刚从某种不适应正常人群传播的环境中蹦出来的， 以至于连侵入和合胞这种基操都不太娴熟~
但不管是侵入效率还是合胞效率， 都在随时经受强大的正向选择压， 在大规模传播的前提下， 轻轻松松就可以完成适应性演化。”
同意一下
yuri有个推 也说了synonymous mutations突然在o变种的子孙里面多了起来
没有啊，根据这个表，差不多啊，哪有3、4倍？
这个表里是1.5% vs. 1.2% (d vs. o), 不过数据还非常少
之前南非还说他们住院的有一批是其它原因住院，但是查出来感染了o
继续等数据。。。
主要是 只要传染性超强 在人口高密度地区就有机会接受高强度正向选择压力 最终结果弱还是强 看造化了
嗯 这个有点搞不懂 什么原理呢
能毁灭10-15%就已经是顶天了 北美chestnut应该就是一个反例吧
我错了。一边conference，一边灌水，搞错了。
求这个表的来源link
跪了 希望在美帝的6%不要成为新主流吧
很容易解释，疫苗本来就是诱发生产抗体和s蛋白同归于尽，浪费了巨量免疫资源，就是抵抗力反而下降了，如果剩余的抗体对未来要入侵的病毒有用，那还有点benefit，但是如果对O没用，那打疫苗就是纯属浪费免疫资源for nothing，对O抵抗力更差
丹麦的疫苗接种率是77.5%，omicron感染者中有83.1%是接种过起码两剂疫苗的，这只能说明两剂疫苗对于传播没有任何影响
这个比例是就全球范围内的同一物种说的，老师说的，我无从考证。比如爱尔兰的马铃薯死光了，也只是爱尔兰岛上的，全世界其他地方的马铃薯损失没有那么大。你说的北美chestnut不知在全球这个物种中占比如何？
据说 香蕉经历过一次全死 现在我们吃的香蕉是一个贵族自己院子里种着玩的
你很老吗。不是的话美国的数据对你有个卵参考价值
找到一个最新的报告 https://www.ssi.dk/-/media/cdn/files/covid19/omikron/statusrapport/rapport-omikronvarianten-20122021-9j51.pdf?la=da
可能留下来的真的是已经被流感基因筛选过一遍了
这么看得话目前住院率是 47 out of 2 万 in Demark？
住院 195, 死18， 跟基数比起来似乎还不错 （0.3% 和0.02%，数据有滞后）。 case两天翻一倍
There were 15 hospital admissions in those S gene negative giving an adjusted observed/expected ratio of 0.32 (95% CI 0.19, 0.52). 【住院下降68%，o从阳性开始15天内住院率为0.1%-0.2%】
https://www.pure.ed.ac.uk/ws/portalfiles/portal/245818096/Severity_of_Omicron_variant_of_concern_and_vaccine_effectiveness_against_symptomatic_disease.pdf