r0没delta 高，说明会再被delta saturated place 大量传播。如果一个地区，还没被delta 蹂躏够多，还是delta 占主要。如果已经被delta 烧透，Omicron就会通过免疫逃逸再烧一遍。 这样比如印度，就又会爆发。是这样理解吗？？ AaaaMei 发表于 2021-12-03 01:49
病毒可能位于这个曲线上的任意一点。如果R0 高的话，比如为8，那么逃逸为40%。总之，如果曲线属实，比Delta的危害性大多了。 huawei6g 发表于 2021-12-03 01:54
这种一旦考验智商的帖子出现，版上就静悄悄的。好贴！ superplayer0304 发表于 2021-12-03 02:47
什么意思？免疫逃逸是针对疫苗？ 是说新病毒如果疫苗有用（不是免疫逃逸），肯定是高传染性（R0高）。 如果低传染性，疫苗就没用？ mylittle9 发表于 2021-12-03 02:56
实际情况大概率比Trevor Bedford发的这个图更凶险 Trevor Bedford发了一个群体免疫90%和一个85%的图，大概红移（上移）两根线，但是我们知道南非的疫苗完全接种率22%，Delta感染率不超过50%（很可能不超过40%），加起来70%就不错了 也就是说上面这个85%的图，曲线大概还要往上再红移6根线 也就是说免疫逃逸80%的情况下，传播率R0=8仍然显著超过Delta Tingno 发表于 2021-12-03 03:02
是这个意思。越红的越往右上角的那些曲线越危险。另外，如果免疫逃逸接近100%，其实可以直接叫这是一款新病毒了 huawei6g 发表于 2021-12-03 03:08
谢谢解释。 楼主这两个图哪里来的啊？这么吓人。 mylittle9 发表于 2021-12-03 03:18
有人也许没看明白，我帮解释下。他是以结果推因，从目前少的可怜的感染数据结果来推测感染的两个原因或病毒特性：即，到底是该病毒的“免疫逃逸”功能多呢还是‘传染性大’呢，这反映在图中虚线上的不确定性。 最近有过一篇涉及新变种“免疫逃逸”的文章，感觉免疫逃逸也许不超过25%，这样，图上看R值大到图外面去了，但 trevor bedford 图有可能误差大，实际R值可能会在8到10之间。正确判断这些，现在为时过早。 minren 发表于 2021-12-03 06:45
这个曲线是怎么得出来的？就是免疫逃逸和R0负相关，就不能是正相关或没关系？ minijing 发表于 2021-12-03 08:49
难道不是应该看是不是病毒性更凶险了吗？如果病毒性变得很弱，他怎么传播也不用在乎吧 nehz 发表于 2021-12-03 08:54
我也很好奇这个曲线是咋的出来的，delta逃逸能力这么差吗？ chopinor 发表于 2021-12-03 08:51
跟你们讲个笑话，我们同事聊天在讲说由于这两天大家都在恐慌性打第三针，CVS只有半夜有空位，于是这群人一窝蜂地半夜十二点去打了第三针。而我早半个月打不仅随便约而且CVS还送五块钱counpon 119ppp 发表于 2021-12-03 09:08
果然omicron吓得一堆人去打第三针了。。。问题到底多逃逸都还没啥数据 vitd120 发表于 2021-12-03 09:09
为什么omicron还没爆就得到了如此广泛的关注。而delta当时爆了之后才被关注？ momclub17 发表于 2021-12-03 09:05
delta好像不算逃逸，主要以病毒量大取胜。。 话说印度会不会又被omicron冲刷一遍 vitd120 发表于 2021-12-03 09:06
这图到底准不准呢？这么说吧原始毒株会在哪里，应该比delta弱多了吧 chopinor 发表于 2021-12-03 09:18
病情扩散数值是 免疫逃逸和传染力叠加造成的，两者不会负相关。曲线是根据过去变种病毒经验模拟的。 minren 发表于 2021-12-03 09:42
又去看了看，这图不是相关性的问题，是组合问题，就是不同的免疫逃逸数值和不同的R0组合得出不同的 Rt。是吧？ minijing 发表于 2021-12-03 09:59
但是这个图没有提到第三个因素，就是致病性，因为如果真的像有些人希望的那样，致病性差，在哪根曲线都无所谓了，反正是大流感，甚至，R0越大越好，取代Delta，世界太平 westlake 发表于 2021-12-03 08:28
对呀，逃逸也好，R0高也罢，如果重症率低，也没什么可怕的 baobao557 发表于 2021-12-03 10:47
这个图就是纯扯淡 野生猫熊 发表于 2021-12-03 10:32
突刺蛋白那么多变异， 感觉不是好东西。 这个变异和其他的变异差距太大了， 简直就是新的病毒了。 不会是个空气传播的hiv吧 cannie 发表于 2021-12-03 10:51
这东西神秘的很 据说有三个可能的来源 1）人到动物再回到人 2）免疫系统障碍的病人长期不能彻底清除病毒 等于提供了筛选的好场所 3）培养皿反复人工筛选 到底是哪个 不好说 CleverBeaver 发表于 2021-12-03 12:52
有人说是老鼠。。。 vitd120 发表于 2021-12-03 12:59
按理说，免疫逃逸越多，现有的疫苗和自然感染获得的免疫力的保护作用就越低，应该传播率也是越高的对不对？为什么是负相关而不是正相关呢？ xiaoxuer 发表于 2021-12-03 10:37
但是我没看懂的是 85% or 90% population immunity 是什么意思，为什么85%的曲线高于90% welkin25 发表于 2021-12-03 13:30
omicron是不是年纪轻的容易感染，才引起了这么多关注？ calrose 发表于 2021-12-03 14:04
你说的对，我回去验算了一下，发现按他给的equation，85%的曲线应该是低于90%的 难道是这个大佬的图画错了 Tingno 发表于 2021-12-03 14:12
每一条曲线上的各个点的实际传染速度Rt是相等的，线的颜色越红Rt越高 实际传染速度Rt和免疫逃逸成正相关 实际传染速度Rt和病毒本身传染力R0成正相关 举个例子，假设这是 Rt=R0*escape 的关系吧 那么自然如果固定了Rt，R0和escape之间是负相关 welkin25 发表于 2021-12-03 13:29
赶紧约了第三针 stacych8008 发表于 2021-12-03 07:38
今天很多南非研究，Omicron再感染率是其他变种3倍的新闻，这是Omicron第一个研究报告 而且还说，增加的是再感染者，而非新感染者 这个病毒估计发展出来ADE的能力了，否则没法解释再感染率超过新感染的 orangepi 发表于 2021-12-03 15:29
问题不是感染了o就不会感染delta，对delta有抗体也会得o。极端一点这可以看作是两种不同的病毒。就像不是得了流感就不得新冠一样。感染o的人里面有些是连booster都打过了。 普罗旺斯的淡紫 发表于 2021-12-03 09:21
r0的意思是没有任何干预，周围全是易感人群的环境下的传染数 rt是现实环境，即有防控措施，周围也并非全是易感人群，这种情况下一个病人能传染的人数
Rt3-3.5，意味着下面的r0和逃逸曲线需要上移2格
delta的rt是1.5
按一个月算，1.5的六次方是11.39，但是3的六次方变成了729，64倍的速度. 3. 5的6次方是1838，161倍的传播速度。
如果是新的血清型，那么现有疫苗无效，但是世界各国理论上还是可以锁国清零。如果不是新的，那么疫苗有效但是R0奇高，隔离清零已不可能。
何况还有老鼠在传播。
大家扣紧安全带，熬过这个冬天，你周围的人就都有抗体了
11月26日，挪威超120人在餐厅参加公司圣诞派对，其中1人数日后确诊感染奥密克戎。政府称，大部分参会者都接种了疫苗
本地时间12月5日，已经超过100人阳性
o已经变异到提交子毒株了Omicron+S:R346K，
占了现在全部Omicron的10%左右，
估算起源时间是11月11日到14日左右。
南非直接从日增2000飙到16000多例了。现在南非是夏天。
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12月4日
南非5岁以下阳性激增
Omicron在发展过程中经过了很长的没有被免疫灭掉的阶段，就是下图的长条long branch。可能的解释，比如hiv病人体内没有足够免疫。还有一个解释，就是跨物种传染了
FCS基序的3个突变里面还有两个和鼠类相关。
Q489H突变是新冠感染老鼠的关键。
高福在南方三个地区采集了八个种类接近三百只不同老鼠的咽拭子和肛拭子样本。35只老鼠的样本带有某种冠状病毒RNA。这35份阳性样本里面，34份是在某大型都市的客运车站和酒店采集到的。
病毒可能位于这个曲线上的任意一点。如果R0 高的话，比如为8，那么逃逸为40%。总之，如果曲线属实，比Delta的危害性大多了。
明白了，谢谢指点
Trevor Bedford发了一个群体免疫90%和一个85%的图，大概红移（上移）两根线，但是我们知道南非的疫苗完全接种率22%，Delta感染率不超过50%（很可能不超过40%），加起来70%就不错了
也就是说上面这个85%的图，曲线大概还要往上再红移6根线
也就是说免疫逃逸80%的情况下，传播率R0=8仍然显著超过Delta
------------------------------- 我回去验算了一下，发现按他给的equation，85%的曲线应该是低于90%的
难道是大佬给的两个图标反了？
如果是这样那就没啥好担心的了，R0 = 4的情况下，免疫逃逸大概是45%，看起来正常多了
这也不算考验智商吧，我能看懂啊(虽然没学生物)
是这个意思。越红的越往右上角的那些曲线越危险。另外，如果免疫逃逸接近100%，其实可以直接叫这是一款新病毒了
我来测下智商看理解了你说的没: 你是说Omicron的曲线可能不是主楼图里标识的，而是落入Rt=4.6 - 5.0的红色区域内?
谢谢解释。
楼主这两个图哪里来的啊？这么吓人。
这是考验专业，又不是川粉，不懂得尽瞎说。
Trevor Bedford的推啊
最近有过一篇涉及新变种“免疫逃逸”的文章，感觉免疫逃逸也许不超过25%，这样，图上看R值大到图外面去了，但 trevor bedford 图有可能误差大，实际R值可能会在8到10之间。正确判断这些，现在为时过早。
这个曲线是怎么得出来的？就是免疫逃逸和R0负相关，就不能是正相关或没关系？
我也很好奇这个曲线是咋的出来的，delta逃逸能力这么差吗？
因为目前没有足够数据看这个，所以只能先看传染性 但，总之，为我以后的老年人生活担忧 冲刷一遍病毒的话，过滤的还是老年人
delta好像不算逃逸，主要以病毒量大取胜。。
话说印度会不会又被omicron冲刷一遍
果然omicron吓得一堆人去打第三针了。。。问题到底多逃逸都还没啥数据
才几个病例，这图没说服力。太假
一共要打8针。慢慢来。疫苗推完成人推小孩，反复来。 只是宣传不到位，太马虎。
按剧本走。一周之内就新闻轰炸，尝试把大家吓死。
这图到底准不准呢？这么说吧原始毒株会在哪里，应该比delta弱多了吧
疫苗本来就是针对原始株做的，肯定不逃逸.
The Delta variant is now replacing all other SARS-CoV-2 variants. We found a mean R0 of 5.08, which is much higher than the R0 of the ancestral strain of 2.79.
病情扩散数值是 免疫逃逸和传染力叠加造成的，两者不会负相关。曲线是根据过去变种病毒经验模拟的。
又去看了看，这图不是相关性的问题，是组合问题，就是不同的免疫逃逸数值和不同的R0组合得出不同的 Rt。是吧？
这个图是把不同的变异病毒画在一个图上，每一条曲线代表一种病毒。纵坐标代表免疫逃逸的百分比，就是疫苗有没有用。横坐标是R0，就是传播得快不快。每一条曲线都显示免疫逃逸越厉害，传播率越低。但是两者之间的变化对每一条曲线不同。就比如如果是直线，斜率是不同的。delta在最下面曲线的黑点上，因为它的R0是已知的。O病毒在黑色虚线上的任何一个点都有可能，现在还不知道。但是按照曲线走向，如果R0 低， 免疫逃逸就高，反之亦然。但是有人说按照非洲的数据，人群中原来已经有免疫力的人并没有像图中说的有85%，所以曲线还要上移几条，那样即使免疫逃逸80%，传播率还有8，那是非常危险的。我不是生物专业的，这是我的理解，不知道对不对。
大意是。数据少，远远推测，基本无价值。
对呀，逃逸也好，R0高也罢，如果重症率低，也没什么可怕的
突刺蛋白那么多变异， 感觉不是好东西。 这个变异和其他的变异差距太大了， 简直就是新的病毒了。 不会是个空气传播的hiv吧
是挺扯 什么时候可以告诉我们致病性多高呢
这东西神秘的很
据说有三个可能的来源 1）人到动物再回到人 2）免疫系统障碍的病人长期不能彻底清除病毒 等于提供了筛选的好场所 3）培养皿反复人工筛选
到底是哪个 不好说
有人说是老鼠。。。
嗯 不排除
我今天不能发帖了，明天聊聊老鼠这个事
每一条曲线上的各个点的实际传染速度Rt是相等的，线的颜色越红Rt越高
实际传染速度Rt和免疫逃逸成正相关 实际传染速度Rt和病毒本身传染力R0成正相关 举个例子，假设这是 Rt=R0*escape 的关系吧 那么自然如果固定了Rt，R0和escape之间是负相关
omicron是不是年纪轻的容易感染，才引起了这么多关注？
你说的对，我回去验算了一下，发现按他给的equation，85%的曲线应该是低于90%的
难道是这个大佬的图画错了
感觉是不少国家一夜之间都关门了 有点奇特
大佬说o是去年年中分裂出去的 和其他大佬的预测也不大一致
“先前的感染能对Delta变种产生保护，但对Omicron变种，好像并不是这么回事。”他们在报告中写道。“我们当前最迫切的任务是量化Omicron逃脱自然免疫和疫苗免疫的程度，及其相对于其它变异毒株的传播性和病症严重程度。”根据报告，这项研究是基于自南非卫生系统采集的2020年3月4日至2021年11月27日期间大约280万确诊新冠病例数据，他们在今年11月27日的至少90天前呈现测试结果阳性，表明感染的极大可能是Omicron变种之前出现的新冠病毒。从这约280万个人里，研究人员们找到了35670个潜在的重复感染病例。分析表明相比第一波疫情(2020年7月抵达峰值)，在Beta变种(2021年1月抵达峰值)和Delta变种(2021年7月抵达峰值)引起的两波疫情中，重复感染的风险其实并不高。相反，在Omicron变种带来的这波疫情里，重复感染的风险明显升高。
研究人员们在论文结论中指出，这些人口规模的研究证据表明Omicron变种与先前感染后的免疫逃逸相关。相比之下，Beta变种或Delta变种则没有展现出流行病学上的免疫逃逸相关。该论文作为预印本，目前还没有得到同行评议，因此其结论需要进一步的确认，但这一信息足够引起人们的警惕。
很多人关注是因为病毒一开始，n个国家断航的断航，关门的关门。
普通人会觉得大佬应该知道内幕这次才这么风行雷厉？
而且还说，增加的是再感染者，而非新感染者
这个病毒估计发展出来ADE的能力了，否则没法解释再感染率超过新感染的
是这意思。所以现在是根据有限的数据推算了一个Rt? 图里那条线就是南非omicron的Rt大概2.5的样子？
为了推广第三针吧
明白了。
打了疫苗会不会也有ADE？
不知道，南非接种率只有20%，现在其他数据还没出来
看着不乐观
这个就叫病急乱投医？
Re，如果症状轻微，不就是免费疫苗吗，把delta挤掉多好
有一小部分同学说新冠再这么变异下去 迟早变出本来面目 搞不好和sars一样毒
谁和你说的再感染比新感染多，source呢？ delta再感染率万分之几，3倍才多少，
埃，这么大规模的交叉感染下去，早晚养出个真毒王来。新冠最近的亲戚毕竟是SARS和MERS这个级别的，还都有ADE。
因为Jesse bloom的deep scanning之后现在spike protein，特别是RBD上面，哪一个氨基酸变成哪一个对免疫和传染力有什么样的影响，大家心里大概是有个数的。看看RBD上突变了多少就知道这个病毒有多危险了
delta那是印度测序太慢，发现不对劲的时候早就全球开花了