Three mutations allowed SARS-CoV-2 to evade the polyclonal antibody response of a highly neutralizing COVID-19 convalescent plasma https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.28.424451v1.full.pdf Summary: Three mutations allowed SARS-CoV-2 to evade the polyclonal antibody response of a highly neutralizing COVID-19 convalescent plasma. In conclusion, we have shown that the authentic SARS-CoV-2 virus, if constantly pressured, has the ability to escape even a potent polyclonal serum targeting multiple neutralizing epitopes. These results are remarkable because while escape mutants can be easily isolated when viruses are incubated with single monoclonal antibodies, usually a combination of two mAbs is sufficient to eliminate the evolution of escape variants and because SARS-CoV-2 shows a very low estimated evolutionary rate of mutation as this virus encodes a proofreading exoribonuclease machinery. The recent isolation of SARS-CoV-2 variants in the United Kingdom and South Africa with deletions in or near the NTD loops shows that what we describe here can occur in the human population. The ability of the virus to adapt to the host immune system was also observed in clinical settings where an immunocompromised COVID-19 patient, after 154 days of infection, presented different variants of the virus including the E484K substitution (25). Therefore, we should be prepared to deal with virus variants that may be selected by the immunity acquired from infection or vaccination. 链接来源 https://www.reddit.com/r/Coronavirus/comments/kppuju/three_mutations_allowed_sarscov2_to_evade_the/
Three mutations allowed SARS-CoV-2 to evade the polyclonal antibody response of a highly neutralizing COVID-19 convalescent plasma https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.28.424451v1.full.pdf Summary: Three mutations allowed SARS-CoV-2 to evade the polyclonal antibody response of a highly neutralizing COVID-19 convalescent plasma. In conclusion, we have shown that the authentic SARS-CoV-2 virus, if constantly pressured, has the ability to escape even a potent polyclonal serum targeting multiple neutralizing epitopes. These results are remarkable because while escape mutants can be easily isolated when viruses are incubated with single monoclonal antibodies, usually a combination of two mAbs is sufficient to eliminate the evolution of escape variants and because SARS-CoV-2 shows a very low estimated evolutionary rate of mutation as this virus encodes a proofreading exoribonuclease machinery. The recent isolation of SARS-CoV-2 variants in the United Kingdom and South Africa with deletions in or near the NTD loops shows that what we describe here can occur in the human population. The ability of the virus to adapt to the host immune system was also observed in clinical settings where an immunocompromised COVID-19 patient, after 154 days of infection, presented different variants of the virus including the E484K substitution (25). Therefore, we should be prepared to deal with virus variants that may be selected by the immunity acquired from infection or vaccination.
Therefore, we should be prepared to deal with virus variants that may be selected by the immunity acquired from infection or vaccination 这是啥意思，不是有提到vaccination么
Has happened once with small pox, and it took us forty years to accomplish. I think Sars2 is going to have its way with us for decades. Pretty alarming reality for cruise ships and movie theaters.. doesn't sound like we're getting back to "normal" after all. We're never going back to normal (masks for the rest of our lives, mark my words) and continuing to lie to the general population about this reality is only going to make it harder for them to accept.
我觉得是。。。如果疫苗打过去之后中和抗体滴度很低，然后再去接触病毒的话就是在养蛊。。。 我看Florian Krammer的twitter上是这么说的： If we want to generate difficult viral escape mutants in the lab (e.g. for epitope mapping), we subject the virus to low antibody pressure and then slowly move up. A little bit like after one vaccine dose. I think it would be good to give the second dose as soon as possible.
我觉得是。。。如果疫苗打过去之后中和抗体滴度很低，然后再去接触病毒的话就是在养蛊。。。 我看Florian Krammer的twitter上是这么说的： If we want to generate difficult viral escape mutants in the lab (e.g. for epitope mapping), we subject the virus to low antibody pressure and then slowly move up. A little bit like after one vaccine dose. I think it would be good to give the second dose as soon as possible. little_racoon 发表于 2021-01-03 20:43
我觉得是。。。如果疫苗打过去之后中和抗体滴度很低，然后再去接触病毒的话就是在养蛊。。。 我看Florian Krammer的twitter上是这么说的： If we want to generate difficult viral escape mutants in the lab (e.g. for epitope mapping), we subject the virus to low antibody pressure and then slowly move up. A little bit like after one vaccine dose. I think it would be good to give the second dose as soon as possible. little_racoon 发表于 2021-01-03 20:43
打疫苗的人群普遍年纪偏大，没打疫苗的人群，年轻人和儿童更多，这点就可以降很多死亡率了。而且新冠传播空间被康复者和疫苗接种者挤压了，哪怕能慢慢把剩下那点儿人全传上，也会有一种自然而然的flatten the curve效果。死亡总数下降，医疗体系足以应对，每个患者享受的医疗资源更多，对死亡率也会有改善。整体效果应该会像大爆过的纽约那样，新冠长期在那儿慢慢传播，但是爆不起来了，死亡数平均分配，而非集中在同一时间一起死。
链接来源 https://www.reddit.com/r/Coronavirus/comments/kppuju/three_mutations_allowed_sarscov2_to_evade_the/
🔥 最新回帖
记得隐隐约约看过说9个月。现在开始打了，希望有更多数据
知道哪里来的，当然可以消灭病毒
单抗可以完全中和人体的病毒
可是再好用的药，你架不住有人一直投毒、投变异的病毒
说实在的，这次的新冠病毒是超越艾滋、超越埃博拉的大事件
因为中共将成为倒霉鬼和替罪羊
这就是为啥中共抵死不承认、甩锅美国、拼命的给中国老百姓洗脑是美国干的
可是你不敢甩到真正的幕后黑手上，幕后的暗势力盖了实验室，给了技术和钱
中共就是过去的晚清，中国人自己只有恨铁不成钢
一群不成器的贪蠢的饭桶给中国人往沟里带吧
没那么久吧，印象中说只能扛几个月。。。
听完你说的更悲观了……
🛋️ 沙发板凳
康复者血清，不是疫苗
Therefore, we should be prepared to deal with virus variants that may be selected by the immunity acquired from infection or vaccination
这是啥意思，不是有提到vaccination么
I think Sars2 is going to have its way with us for decades.
Pretty alarming reality for cruise ships and movie theaters.. doesn't sound like we're getting back to "normal" after all.
We're never going back to normal (masks for the rest of our lives, mark my words) and continuing to lie to the general population about this reality is only going to make it harder for them to accept.
Twitter上也有很多专家在讨论，这是一个实验室里人工弄出来的突变，可以大幅降低康复患者血清的中和作用，当然这个突变目前还没有在真实环境中观测到。
在实验室里做这种viral escape的突变毒株的做法是在低浓度的中和抗体环境下养病毒，然后慢慢提高抗体浓度，让能够逃脱抗体的突变快速获得进化优势。在现实中一些保护率低下的疫苗很有可能提供这种环境，所以很多人认为英国现在把所有疫苗第二针推到三个月后的做法非常危险，不能提供完全保护的疫苗有可能培养出能够逃脱疫苗的突变毒株，完全毁掉整个免疫计划。
这篇报道只是说明： 治疗性的 抗体估计对 变种病毒要无效了，
疫苗是另一码事儿，对于变种，现在应该好不知道，因为没有数据。。
原来如此，谢谢解读了
同意
英国的做法可以用无脑来评价
那是不是说低有效率的疫苗都有可能产生这种后果？比如国内的疫苗有效率如果很低的话，大面积接种后一旦放开国门，会不会导致这种后果？
勿喷，纯科学讨论。
是的，现在最重要的就是快速推广疫苗，把整个传染率压下去。突变是随机的，传染率越高积累的突变就越多。mRNA疫苗确实可以快速修改抗原，但是如果能够对抗疫苗的突变在疫苗推广以前就大范围传开了那就很麻烦了。
我觉得是。。。如果疫苗打过去之后中和抗体滴度很低，然后再去接触病毒的话就是在养蛊。。。
我看Florian Krammer的twitter上是这么说的： If we want to generate difficult viral escape mutants in the lab (e.g. for epitope mapping), we subject the virus to low antibody pressure and then slowly move up. A little bit like after one vaccine dose. I think it would be good to give the second dose as soon as possible.
唉，像以色列这种国家，才半个月已经12%的老百姓打上疫苗了，相信几个月就能全民疫苗，这种国家只要封锁好边境，应该能撑很长时间，最危险的就是疫苗铺的效率低下并且人口众多的国家，变异很可能在这些国家发生
所以有可能国内多少年都不会开国门。。。。就这么耗个十年八年的，甚至一辈子
基本就是这样。现在欧美基本情况就是养蛊。。。
当然不是一回事。疫苗无效会感染，感染重病。这里说的是有效疫苗的情况下。
对疫苗厂商应该可以算重大利好了，说明疫苗可能会需要每几年补打一次，把每年打流感疫苗变成每几年打新冠疫苗。以后可能不光会有COVID-19，还会有COVID-25，COVID-30，……，COVID-3000……
太吓人了
文章说了，低效率的半吊子疫苗甚至可能加速突变，那也不一定非要几年才突变了，总之未来的事情，不确定因素很大。唯一确定的是，很长时间都回不了2019年了，甚至有生之年都不可能了。流感没有新冠传染力这么强啊，死亡率比新冠也低
跟养蛊不养蛊没啥关系，这是病毒本身的特性决定的。新冠只是突变慢（和流感病毒相比），又不是不突变，只要它有足够的突变能力，那必然会慢慢进化。一个传播力这么好的病毒，不会因为人类开发出疫苗就消失。亲吻病的病毒都感染了全世界百分之九十几的人类了，照样还能继续存在。说起来的话，其实流感疫苗也是在逼迫流感病毒进行进化，尤其是流感疫苗的保护力比新冠疫苗差远了。但其实根本无所谓，跟着进化疫苗就完事儿了。
本质还是达尔文进化论，人类跟病毒一起进化，慢慢淘汰适应不了对方的族群，幸存下来的都是能搞定对方的族群。
流感没有新冠传播力强，是因为流感受到温度影响很大，到了夏天就要换个半球去过冬。你要是让流感可以像新冠这样一年四季都可以传播，其实流感传播性并不会比新冠差。新冠虽然传播力比流感好，但突变慢，而且传播力好就更容易局部形成饱和。经过几年的驯化，新冠未见得会比流感强多少。
那未来能成功的国家要么是 1）像新西兰，澳大利亚这样病毒没怎么传播的国家，只要保证长期封锁，疫苗慢慢全民打上，问题不大 2） 像以色列这种人口少，效率高的国家，短时间把疫苗全民推广。每来一次新疫苗，就短时间内全民推广一次，同时封锁好边境
未来很可能失败的国家 1）南美非洲印度这些人口众多，病毒已经传播深重，疫苗普及低下的国家，很可能被这病毒的变种一遍又一遍的虐
看不清不确定的国家 1） 中国，毕竟人口众多，新冠每变异一次，就14亿人打一次疫苗的可能性大么？好在病毒没怎么全民传播，可以长期封锁下去。但是一开打开国门，很有可能变成失败的国家 2） 美国，病毒传播深重，人口众多，但是科学技术发达，很可能第一个研发出变种疫苗，如果疫苗普及效率高，赢面很大，如果疫苗铺的慢，可能变成失败的国家
其他欧洲，加拿大，英国，日韩这些也不太确定，我比较质疑EU 的效率就是了
请问是因为人体会对已经打过的腺病毒载体产生免疫而不能补打吗？
新西兰澳大利亚必然要敞开国门让病毒进来，因为新冠与人类共存的时间可能会是以几十年计甚至百年记，没有国家能闭关锁国那么久。只要不想死的人可以打上疫苗让自己不死，针对新冠的药物研发跟上，新冠的死亡率下降到现在的几分之一，人们就根本无所谓了。就跟现在的流感一样，年年传染几亿人，年年全球死几十万人，但人们根本无所谓，谁也不会因为不想让几十万人死就改变自己的生活方式。人类早已过了可以把新冠kick out的窗口期，现在要做的就是调整自己的心态，像接受流感死亡一样接受新冠死亡。
是啊，腺病毒载体用过一次，人类对载体有了抗体，再补打就没什么用了。重新研究新的载体，怕是得重新做实验，很不划算。
但是新冠真的比流感重啊，而且传染率高，现在也没有证据说新冠这些变种毒性变弱，就目前这种毒性，让大家像接受流感一样接受新冠，可能性真的不大。我健康的三十出头的朋友年年感冒一次，或者流感，家里待两三天就好了，也很难发展到肺炎程度，新冠让她得了肺炎，住院，吸氧，出院回家上个厕所都费力，前前后后一个月才恢复，从我身边个例来看，新冠是要比流感严重多的，流感不会演化成医疗挤兑，新冠太容易造成医疗挤兑了
赶在新冠变异前打没用，全球那么多人，肯定有人没打，或者打了无效，身体里变异传给其他人。
re，且还有别的后遗症和风险。。。
关键是，现在的新病毒，你得过了，仍然会得。其实即使是旧病毒，得过了，半年后仍然会得。半年来一次这东西，实在是一种人种筛选。
也不用太绝望，mRNA疫苗引起的除了抗体还有T细胞免疫呢，T细胞可以识别相近的抗原，比如针对普通冠状病毒的T细胞对新冠病毒也多少有点用，这样就算不能避免突变毒株感染，症状也会明显减轻的。现在最最重要的事情就是赶紧用疫苗把所有人过一遍。
有道理
那也是现在新冠刚出来。流感刚出来时，西班牙大流感死得人比今年新冠多多了，经过年复一年的驯化，现在不也就是普通流感了么？病毒会进化，人也会进化，医疗手段也会进化。你能想象5年之后10年之后，得了新冠的死亡率还会像现在这样高么？反正我没法想象。
我也是这样想多伦多的房子涨得多高啊，连带周边城市都涨了。这下房子该降了吧，反正不能自由流动了。
为什么都特别聚焦欧美打疫苗后果。全球都传遍了。作为去过垫底国家援助的，我很负责的说即使是国内量产低成本的疫苗全球免费推，都不可能覆盖多少。各种条件限制。人命价值比五块钱一剂低多了的地方有的是。我用高中生物知识猜猜也早知道会这么发展了唉。估计国际旅行强封锁会持续5/8年至少。
根据那个骗子kfk预测准了疫情造成的接近永久不能出门
却没有预测准美国选情……
hmm
病毒来源值得怀疑🤨
对的
利好PFE、BNTX、MRNA、NVAX。利坏JNJ、AZN。
是的，我妈说，如果我的小孩们到了结婚的年纪都出不了门，生活还是这样的话，也不要考虑结婚了
我想想也是的，这都什么日子过的
把需要出去浪的人过一遍才对
过完之后也要戴口罩
感染了之后再治疗都是帮助进化的推动者
azn的cd8是最强的一针出 只不过我不愿意打。
我不觉得第二针晚打有多大问题
疫苗本来就不可能覆盖多少，不过病毒自己就是天然的疫苗，疫苗覆盖不到的地方交给病毒来覆盖，几年后病毒传染空间依旧会下降。落后地区普遍人口结构非常年轻，病毒死亡率天然就很低，根本不会带来太大冲击。那些地方有的是比病毒更重要的事情需要关注，人先活过50岁再来谈新冠会怎么样吧，平均寿命三十多岁的地方，新冠存在与否几乎没区别了。
英国目前的做法的确是很危险，完全不符合疫苗的防护作用。很无脑。
不是第二针的问题，是几年后如果需要补打，腺病毒疫苗就傻眼了。
AZN的疫苗我觉得第二针可以拖一拖，Pfizer疫苗不应该这么胡整。英国现在的做法是把所有人的第二针都推迟到三个月。
也想回国，回不去呀。
低效率的半吊子疫苗才会有这种risk. 欧美如果坚持mRNA 的高效率疫苗就会杜绝这种情况。而某些国家打低效率的疫苗一旦变异病毒带入，才会出现这种情况。
没follow 英国为什么要这么做？
其实没区别，你不用半吊子疫苗，也会有别人用半吊子疫苗，还有人用病毒这种天然疫苗。只要新冠病毒自己有进化能力，外界的压力就会指引它进化的方向。
是的。所以有效率啥的都是其次考虑的因素了。接下来最重要的是找国际封锁下能维持的社会经济运转模式。
无所谓了， 这种选择性进化在自然界里本来就是小概率 打了anz/mrna/phz疫苗哪怕只有一针，都可以极大的降低病毒传播及病毒在体内的增殖时间。 boost往往只是防止记忆t/b细胞下降而已。
要担心，不如去担心非洲的HIV携带者。。
流感病毒变异不是小概率事件啊，流感疫苗年年打，年年变异，这个article就是说明这个的，新冠可能不是和流感一样年年变异，但是可能三年变异一次，或者五年变异一次，同时新冠又比流感传染率高，致死率高，又不可能像流感疫苗一样选择不打，大家自己扛过去，所以到时候全球60亿人要每隔三年或者五年重打一遍新新冠疫苗
欧美国家疫苗打得差不多了（40%左右的人群），就没啥继续封锁的必要性了。我预计下半年会全面恢复通航，个别国家想继续封锁那是个别国家的事，整体不会再封了。美国已经差不多有20%左右的人感染过了，再加上上半年疫苗能打个40%，够用了。更何况，高危老年人群体，愿意接受疫苗的肯定比普通民众更高。剩下的人哪怕半年因为新冠死个几万，也在医疗承受范围之内，无伤大雅，也就是double或triple普通流感的水平，完全不需要再封锁。
你哪里来的数据新冠变异比流感慢？新冠光从中国开始就变异了多少次了？英国几个月前的新冠种类现在已经只是一小部分了，新的已经成为主流了。中国那时的新冠品种都几乎绝迹了。
我说的变异是指变异到现有疫苗效果不明显的地步，目前的变异，疫苗效果都还算有用（官方是这么说的，事实也还没得到验证就是了），但是几年后就难说了
流感不是一种病毒，是一堆病毒。
很难想象新西兰对美国下半年通航。。。
新冠变异当然比流感慢，这还需要质疑吗？你看看nextstrain，新冠到现在才变了多少点儿？一个基因突变也叫突变，100个基因突变也叫突变，但是变一个基因和变100个基因能叫突变速度一样吗？新冠有自带的纠错机制，就因为这个，传统的抗病毒药物如利巴韦林对它无效，但也因为这个，所以它其实是一个突变很慢的病毒。流感一年的时间，突变到连名字都换了，新冠到现在还叫COVID-19呢，那点儿突变跟流感比差远了。
很专业，希望你说的能实现 :)
欧洲下半年跟美国通航总能想象吧。
新西兰这种国家和美国没法比的，美国是全世界流通的一个中转站，美国要是完全封锁，这个世界可能大半都不运转了。当然也希望美国能彻底封锁起来，感觉很难
其实麻疹病毒突变的很快， 估计每次复制突变一个碱基，远比新冠快
然而麻疹疫苗用的还是1960年的病毒株， 至今有效。
天坑专业不讲道理 o(╯□╰)o
封锁意义不大。里面也是一堆病毒，外面也是一堆病毒，封不封有什么区别？美国的抗疫策略，早就从抑制病毒扩张，转变为靠抗体率（病毒+疫苗）抗疫了。
说明不管麻疹疫苗怎么变，免疫系统都能认出它来。这种病毒和病毒区别还蛮大的，不同的病毒触发的免疫反应可能很不一样。
❤️
是的，还有个poliovirus也是这样。。。
同意，如果能做到入境美国要疫苗证明或者阴性证明就足够好了
你太搞笑了。浣熊mm回的帖子你都赞同了，那你跟我这个原帖较什么劲？她的回帖就是说如果国内疫苗效率低下的话就是在养蛊啊。
我没有特指国内疫苗，英国现在的做法我看twitter上很多专家也很担心。
不过理论上讲，灭活疫苗“左胳膊一针，右胳膊一针”，打完以后抗体低又没有多少T细胞免疫，一方面让病毒能够继续复制，另一方面体内有一点抗体所以突变株有进化优势，确实提供了个很好的viral escape的环境
我觉得你太乐观了，这种一半打了，一半没打，结果还多个国家通航，岂不是增加了病毒变异进化的可能。还不提相当一部分anti-vaccine的， 和打了就出去浪的。个人觉得疫苗和封锁都很重要。另外，剩下的人死了几万，无伤大雅。。。这口气
瞎扯。国内的情况下，不要说疫苗低下80%，就是疫苗是1%，或者说直接打水，没有疫苗，个位数的人感染，怎么养？很有限的次数传播能养出啥来？
那我就看不懂了。covidvirus从很久之前就有了，目前这个是covid-19。为啥以前没有对covid的疫苗？今年才开始做疫苗？为啥专家又说疫苗以后会没用？
好像以前没有毒性和传播性这么高的冠状病毒，感冒也是冠状病毒，但是死亡率没这高，所以一直没人研发针对感冒的疫苗，因为没必要，萨斯冠状病毒倒是毒性高，但是传播性低，所以疫苗的研究不了了之，直到COVID-19横空出世，集毒性和传染性于一身。也算是冠状病毒的进化了，所以人类第一次要研发针对冠状病毒的疫苗
就算是都全部用疫苗，不用隔离，国内疫苗就算真的80%， 美国估计能有60%打就不错了，还差20%呢。没有隔离，就群免吧。打过的，也会失效，连得过的人都会再次感染，何况用疫苗假蛋白。社会上还有人在传播，感染只是个时间问题。
她说的挺专业的。按照美国的统计口径，每年的流感死亡也是几万，所以是降低到一个数量级就会重开了。 美国的疫情控制的不好是事情，但是统计口径不一样也是存在的。
没打疫苗的人得了新冠死亡率应该不会下降啊，现在死亡率多少，应该到时候还是多少啊，死亡总人数是应该下降了，但对没打疫苗的个体而言，即使疫苗普及了50%， 不代表得了新冠，就变成得了感冒了。总之打了疫苗不能掉以轻心，这篇文章，就是告诫大家疫苗普及要迅速全民普及，不能搞半吊子，以及第一针和第二针之间不能出去浪，否则病毒有加速变异的风险，搞得会和流感一样。那个人说的完全和这个文章警示的反而是背道而驰。她认为打了一半的人，国家之间就可以通航了，人们就可以放松警惕了，这不正好这article要说的相反么
很简单啊，因为以前的coronavirus对人体伤害不大，没必要研发疫苗。世界上病毒多了去了，哪能啥病毒都研发疫苗啊，威胁不大的病毒就随它去了，人体自有免疫系统来应对。
是的，你的想法可能是要彻底清零。她的意思是彻底清零，即使对流感都做不到。
我的意思不是彻底清零，是降低病毒变异导致疫苗失效的风险。
人肉免疫期时间短，而且产生的抗体远远达不到疫苗的浓度。 所以疫苗是近阶段的唯一出路。
抓住问一下，二次的间隔是不是超过了半年？
研发疫苗很费钱的，还不说大规模的人体试验，研发出来没地方用基本亏钱。 anyway，觉得你挺专业的，估计是专业人士。谢谢科普。
看完你的回复我笑了，这么简单的道理愣是没有几个人懂，你说好笑不好笑！
是的每个人都不一样，包括这篇文章里找到了十几个病人的血清， 每个人都不一样。。。 o(╯□╰)o
嗯，多谢澄清，放心一点点了。
打疫苗的人群普遍年纪偏大，没打疫苗的人群，年轻人和儿童更多，这点就可以降很多死亡率了。而且新冠传播空间被康复者和疫苗接种者挤压了，哪怕能慢慢把剩下那点儿人全传上，也会有一种自然而然的flatten the curve效果。死亡总数下降，医疗体系足以应对，每个患者享受的医疗资源更多，对死亡率也会有改善。整体效果应该会像大爆过的纽约那样，新冠长期在那儿慢慢传播，但是爆不起来了，死亡数平均分配，而非集中在同一时间一起死。
我不是，理科生偶尔看点科普文章，跟大家一样是半吊子。
这个她也讲了，流感一直在变异，疫苗一直在失效然后重新追赶。我觉得搞生物的又不是搞出来疫苗就放假回家了，他们也在不停的追踪和更新啊。 我的理解是生物科学又不是写程序，0是0，1是1。生物更多的是尝试去理解这个机制，然后进化我们的对策。