泪奔!PNAS是在给小黄人洗刷冤屈么?

骑大马
楼主 (北美华人网)
Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes
https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117

MetroUK对PNAS的论文做出了解读
https://metro.co.uk/2020/04/10/coronavirus-mutated-three-distinct-strains-spread-across-world-12536852/

The findings are published in the journal Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

Variant A, most closely related to the virus found in both bats and pangolins, is described as the root of the outbreak by researchers.

Type B is derived from A, separated by two mutations, then C is in turn a ‘daughter’ of B, the study suggests.


The phylogenetic network methods used by researchers – which looks at evolutionary relationships among biological entities – allowed the visualisation of hundreds of evolutionary trees simultaneously in one simplegraph.

以蝙蝠和穿山甲提取的病毒为基点来分析,Type A是爆发的根源。中国流行的Type B是A的衍生,有两次变异,C是B的子代。
h
hcrab
昨天睿大妈发过了
骑大马
回复 2楼hcrab的帖子 结论是啥?
l
lulala
已经変成冏大妈的发过了。放风结束赶紧回去。
X
Xiaoxiaohai
Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes
https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117

MetroUK对PNAS的论文做出了解读
https://metro.co.uk/2020/04/10/coronavirus-mutated-three-distinct-strains-spread-across-world-12536852/

The findings are published in the journal Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

Variant A, most closely related to the virus found in both bats and pangolins, is described as the root of the outbreak by researchers.

Type B is derived from A, separated by two mutations, then C is in turn a ‘daughter’ of B, the study suggests.


The phylogenetic network methods used by researchers – which looks at evolutionary relationships among biological entities – allowed the visualisation of hundreds of evolutionary trees simultaneously in one simplegraph.

以蝙蝠和穿山甲提取的病毒为基点来分析,Type A是爆发的根源。中国流行的Type B是A的衍生,有两次变异,C是B的子代。

骑大马 发表于 4/11/2020 5:53:13 PM

环球时报都出来给睿大妈打脸,你就别再发一遍上赶着又被打脸了
c
chashaobao
回复 2楼hcrab的帖子

结论是啥?
骑大马 发表于 4/11/2020 5:56:03 PM


结论就是她英文不过关,也可能是其他知识不过关,总之她原文没有读懂
骑大马
回复 5楼Xiaoxiaohai的帖子 MetroUK的解读,又不是我的。
b
bonton
昨天读过这篇文章了,A那个小圆不也是黄色占大头么,为什么说给小黄人洗刷冤屈?
保持沉默
你是五毛
骑大马
回复 4楼lulala的帖子 怎么?
你们还非得把Chinese Virus做实了不可?
e
em4luv
这种时候建议LZ最好去读一下PNAS发表的原文,News通常断章取义。 论文里:There are two subclusters of A which are distinguished by the synonymous mutation T29095C. In the T-allele subcluster, four Chinese individuals (from the southern coastal Chinese province of Guangdong) carry the ancestral genome, while three Japanese and two American patients differ from it by a number of mutations. These American patients are reported to have had a history of residence in the presumed source of the outbreak in Wuhan. The C-allele subcluster sports relatively long mutational branches and includes five individuals from Wuhan, two of which are represented in the ancestral node, and eight other East Asians from China and adjacent countries. It is noteworthy that nearly half (15/33) of the types in this subcluster, however, are found outside East Asia, mainly in the United States and Australia. 给你翻译一下: A型有两个亚簇,由同义突变T29095C来区分。在T等位基因亚簇中,4名中国患者(来自中国南部沿海省份广东)携带始祖基因组,而3名日本患者和2名美国患者的基因组和来自中国的相比出现一些突变。这些美国患者曾有武汉旅行史。 A型中的C等位基因亚簇则具有相对较长的突变分支,包括来自武汉的5名患者(其中2个属于始祖基因组),以及另外8个来自中国和邻近国家、地区的东亚地区患者。值得注意的是,C等位基因亚簇中近一半(15/33)的类型是在东亚以外的地区发现的,主要在美国和澳大利亚。
回复5楼 Xiaoxiaohai 的帖子 MetroUK的解读,又不是我的。 骑大马 发表于 4/11/2020 6:03:00 PM
e
em4luv
这个问题版上已经讨论过好几遍了,贴个发表剑桥大学的文章的第一作者Peter Forster博士关于对他的论文的争论接受的采访: 他表示他已经对于中美在此事上的争议有所耳闻,也清楚病毒的来源目前是块“烫手的山芋”。他也在就病毒的来源问题进行研究,除了目前已经发布在PNAS上的这篇论文,他和其他学者们还已经完成了一个涉及1001个病毒基因样本的分析,只是该论文尚未发表,也没有经过同行评审。 但他表示,不论是哪篇论文,目前仍无法就病毒的来源地给出一个明确的答案。不过,他们研究中发现的证据显示,新冠病毒可能来自东亚,病毒最初感染人类的时间则大致在2019年9月13日至2019年12月7日这个区间。 至于为何A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现,而是由A型变异来的B型,Peter Forster博士的回应是,这可能是因为A型并不适应当地人的免疫系统,所以才变异成了B型,但也可能是因为当地更多的病例是由B型的感染者传染出去的,即遗传学上的“奠基者效应”(founder effect)。这也与他接受剑桥大学官方采访时所说的内容一致。 而对于A型为何更多出现在美国和澳大利亚,他则认为这有可能是因为A型更适应那里的人的免疫系统。但由于A型在武汉出现过,感染过一些武汉人,也感染过有武汉居住旅行史的美国人,他认为从现有证据来看美国的A型病毒有可能是从这个途径过去的。 最后,他表示他们的研究发现新冠病毒在中国境外变异速度很快。他还介绍说,他们之所以得出病毒最早出现在人身上传播的时间在2019年9月13日至2019年12月7日这个区间,是通过病毒在中国境内相对“缓慢”的变异速度推算出来的。
回复2楼 hcrab 的帖子 结论是啥? 骑大马 发表于 4/11/2020 5:56:00 PM