西雅图的第二例很可能是第一例间接传播的!间隔六周

每天都
楼主 (北美华人网)
第二例的序列和第一例非常像,非常可能西雅图从第一例开始已经传播了六周了,twitter link如下。Seattle Flu Study不到一天时间测序了第二例,原本可以更早就开始track病毒在西雅图的传播,但是因为中间这六周CDC都在忙着吃屎,耽误了时机。

https://twitter.com/trvrb/status/1233970271318503426

非常推荐自己去看这个twitter和下面各路专家的回复。这两例完全是独立传播的chance在1-2%。
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sssccc
不是第一例接触的人都隔离了么?
每天都
不是第一例接触的人都隔离了么?
sssccc 发表于 3/1/2020 12:12:13 AM

CDC不让测,所以之前的protocol就是monitor,比如跟第一例一起飞回西雅图的航班上的人,或者第一例有其他接触的人,就是打电话每天问问发烧了没,14天没发烧就不管了,无症状感染者都漏了呀
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Cherylshere
这个tweet很有意思,很informative。 不过我说个难听的,如果这两个是有关联的,就更证明CDC所谓的surveillance或者self monitoring system是多么无能了。
每天都
这个tweet很有意思,很informative。

不过我说个难听的,如果这两个是有关联的,就更证明CDC所谓的surveillance或者self monitoring system是多么无能了。
Cherylshere 发表于 3/1/2020 12:19:40 AM

mm你这话说的一点都不难听,很文明啊
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patx2449
西雅图医疗资源也算西北地区最好的了,还有很多私立的研究所,gates基金会,各大公司的headquarter都在这里。要钱有钱,要技术有技术,砸就砸在CDC的对病人处理的protocol和试剂盒上了。
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chengcheng
这个tweet很有意思,很informative。

不过我说个难听的,如果这两个是有关联的,就更证明CDC所谓的surveillance或者self monitoring system是多么无能了。
Cherylshere 发表于 3/1/2020 12:19:40 AM [/url]


CDC假如一开始什么都不管,让各个州自己看着办,都一定会比现在这个状态好多了。各州不是没有能力和人力去排查,控制和追踪,完全是被CDC 挡住了。

特别希望老川能继续加大力度,缩小政府。
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zxtoca
所以就像有个id说的,CDC哪里是控制disaster,纯粹是在create disaster
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cloverain
第二例的序列和第一例非常像,非常可能西雅图从第一例开始已经传播了六周了,twitter link如下。Seattle Flu Study不到一天时间测序了第二例,原本可以更早就开始track病毒在西雅图的传播,但是因为中间这六周CDC都在忙着吃屎,耽误了时机。

https://twitter.com/trvrb/status/1233970271318503426

非常推荐自己去看这个twitter和下面各路专家的回复。这两例完全是独立传播的chance在1-2%。

每天都 发表于 3/1/2020 12:05:55 AM

多谢总结,居然查病毒的基因还有这种用途,长见识了。
每天都

多谢总结,居然查病毒的基因还有这种用途,长见识了。

cloverain 发表于 3/1/2020 12:30:22 AM

我觉得想要知道中国的真正数据,最后还是要看病毒的序列,共匪是瞒不住的
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oceanmist
如果真的在西雅图传了6周,太可怕了。相当于裸奔了6周,不知道感染了多少人
每天都
如果真的在西雅图传了6周,太可怕了。相当于裸奔了6周,不知道感染了多少人
oceanmist 发表于 3/1/2020 12:42:02 AM

这个不要自己瞎猜,我看这个thread里马上有人用R0估了个好几千,Trevor Bedford回复说expectation是大概几百例current infections in Washington state
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isabel
好贴要顶
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riveroam
所以就像有个id说的,CDC哪里是控制disaster,纯粹是在create disaster
zxtoca 发表于 3/1/2020 12:29:59 AM

CDC起到了党中央的作用
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silk
记得第一例回来以后还是上了几天班的
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Cherylshere

这个不要自己瞎猜,我看这个thread里马上有人用R0估了个好几千,Trevor Bedford回复说expectation是大概几百例current infections in Washington state

每天都 发表于 3/1/2020 12:46:06 AM

我也看到这条回复,但是觉得有些乐观。几百例这一假设的前提是1月份这例是WA唯一的首发病人。接下去WA应该会加大力度检测,多sequence几个出来应该能看出来有没有别的传染源头了。
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officialaccount

我觉得想要知道中国的真正数据,最后还是要看病毒的序列,共匪是瞒不住的

每天都 发表于 3/1/2020 12:32:19 AM

数量还是可瞒
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justinhowe
第一例是亚麻码农,第二例是那个高中学生,查查看那个高中学生有没有亚麻的社会关系,自己父母同学父母有亚麻工作的没
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hemonc

我也看到这条回复,但是觉得有些乐观。几百例这一假设的前提是1月份这例是WA唯一的首发病人。接下去WA应该会加大力度检测,多sequence几个出来应该能看出来有没有别的传染源头了。

Cherylshere 发表于 3/1/2020 12:54:44 AM
h
hemonc
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cysky
小声说以下一下, WA第一例是码农, 但不是amazon的
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erniuth
这位讲的还是比较好懂的 nextstrain也可以去看看,根据测序结果画的进化树还是可以回答很多问题的
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snowfire
不懂就问,确诊的接触者不就是应该要隔离?难道要每个人都测一遍? 那些接触者这么久了是都没发病吧?不然会给测吧?那如果是被接触者传染了,这个接触者也是无症状携带者吧?碰上这种事算是运气差没办法了。 CDC是该骂,但是这个例子感觉怪不到CDC头上啊。
每天都

数量还是可瞒

officialaccount 发表于 3/1/2020 12:57:27 AM

population size可以通过virus sequence diversity估计的,当然最后得到的range会比较大
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junjunzi
回复 23楼snowfire的帖子 好像中日韩都是密切接触者也都测一遍,而且就算这样测一遍还会有假阴性
每天都
不懂就问,确诊的接触者不就是应该要隔离?难道要每个人都测一遍?
那些接触者这么久了是都没发病吧?不然会给测吧?那如果是被接触者传染了,这个接触者也是无症状携带者吧?碰上这种事算是运气差没办法了。
CDC是该骂,但是这个例子感觉怪不到CDC头上啊。

snowfire 发表于 3/1/2020 1:11:23 AM


这个Seattle Flu Study就是在机场学校等等很多公共场合放kiosk,感兴趣的有感冒症状的就去sign up,然后给你寄kit,你取点swab或者吐口痰,drop下sample,就测序你是否有和有哪种flu,实时track flu evolution and epidemiology。用这个系统track COVID-19,你不觉得非常make sense吗?当时的计划就是从机场取样,从进入Seattle的人群中取sample啊,CDC不允许测COVID-19,hold了很久才松口呗。你去看看这个twitter其他贴子,有更早的介绍Seattle Flu Study。

CDC自己incompetent就自己默默吃屎好了,跑出来给各州直播吃屎,不让competent的人做事,你觉得该不该怪呢?
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xijuren
只怪第一例太早就从国内传染上了,1/19, 国内都还没开始防备,更不用说美国了!一个多月了,这下西雅图 那边完了,肯定已经传播开了,第二个武汉的节奏。

后来回美国的人因为有国内的宣传,好歹自己会小心点在家隔离的,当然也有不自觉的,就会遭到周围华人大妈的愤怒举报。我有个朋友,24号赶紧从北京改机票逃回来了,完了回来都自觉在家隔离两周,虽然那时候川普没要求。

而且因为23号后武汉的人就出不来了,理论上回美国的人也没那么多感染的了。
a
ajisenramen
我家乡国内非疫区,武汉人在封城前逃离到我家乡的, 除了自驾的,几乎全都被统计出来了,包括逃离者的姓名,航班/车次号,日期及现落脚住所,美国这方面对比之下真的太第三世界了!
每天都
只怪第一例太早就从国内传染上了,1/21, 国内都还没开始防备,更不用说美国了!一个多月了,这下西雅图 那边完了,肯定已经传播开了,第二个武汉的节奏。

后来回美国的人因为有国内的宣传,好歹自己会小心点在家隔离的,当然也有不自觉的,就会遭到周围华人大妈的愤怒举报。我有个朋友,24号赶紧从北京改机票逃回来了,完了回来都自觉在家隔离两周,虽然那时候川普没要求。

而且因为23号后武汉的人就出不来了,理论上回美国的人也没那么多感染的了。
xijuren 发表于 3/1/2020 1:19:54 AM

不是的,这个Seattle Flu Study是常年在的,1.17号之前,还叫Wuhan virus的时候,刚公布基因组就计划把这个加进去了,optimize技术花了一周。如果没有CDC早早开始monitor,无症状传染这些都可以非常早知道。
x
xijuren
那时候大部分人对这个没有任何防范意识吧,包括CDC。

我记得第一批撤侨,开始要降落三藩,地方拼命反对,后来改空军基地了。开始CDC说测测体温三天就放人了,后来也是群众意见太大才改成两周的。
第一批撤侨是一月二十九号,刚刚查了一下。

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不是的,这个Seattle Flu Study是常年在的,1.17号之前,还叫Wuhan virus的时候,刚公布基因组就计划把这个加进去了,optimize技术花了一周。如果没有CDC早早开始monitor,无症状传染这些都可以非常早知道。
郝爱国教授
p-value 只有0.03,所以也可能是巧合,现在已经有几万个病例了,出现这种巧合也可能 WA有若干个病例,再对其他的进行测序,就可以断定是否WA的疫情都来自于WA1了 记得当时看报道说WA1好像挺自觉的非常小心没有传染别人,到底是不是如此,马上就会揭晓了
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oceanmist
那时候大部分人对这个没有任何防范意识吧,包括CDC。

我记得第一批撤侨,开始要降落三藩,地方拼命反对,后来改空军基地了。开始CDC说测测体温三天就放人了,后来也是群众意见太大才改成两周的。
第一批撤侨是一月二十九号,刚刚查了一下。

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不是的,这个Seattle Flu Study是常年在的,1.17号之前,还叫Wuhan virus的时候,刚公布基因组就计划把这个加进去了,optimize技术花了一周。如果没有CDC早早开始monitor,无症状传染这些都可以非常早知道。

xijuren 发表于 3/1/2020 1:29:57 AM

cdc真的洗不白,那个时候论坛都知道14天潜伏期,cdc就测三天,这是故意制造问题。
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okura
只怪第一例太早就从国内传染上了,1/19, 国内都还没开始防备,更不用说美国了!一个多月了,这下西雅图 那边完了,肯定已经传播开了,第二个武汉的节奏。

后来回美国的人因为有国内的宣传,好歹自己会小心点在家隔离的,当然也有不自觉的,就会遭到周围华人大妈的愤怒举报。我有个朋友,24号赶紧从北京改机票逃回来了,完了回来都自觉在家隔离两周,虽然那时候川普没要求。

而且因为23号后武汉的人就出不来了,理论上回美国的人也没那么多感染的了。

日本更早 1月15日饭店店员被传染 1月19日穿给出租车司机 1月31号出租车司机的岳母就去世了 按照亚洲的速度早就爆发了 西雅图这么久才有爆发倒是证明在白人里面确实传染性不强
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ginnypotter
p-value 只有0.03,所以也可能是巧合,现在已经有几万个病例了,出现这种巧合也可能

WA有若干个病例,再对其他的进行测序,就可以断定是否WA的疫情都来自于WA1了

记得当时看报道说WA1好像挺自觉的非常小心没有传染别人,到底是不是如此,马上就会揭晓了
郝爱国教授 发表于 3/1/2020 1:35:22 AM


你看反了,他说的是巧合的可能性p value只有0.03……
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Cherylshere

日本更早 1月15日饭店店员被传染 1月19日穿给出租车司机 1月31号出租车司机的岳母就去世了 按照亚洲的速度早就爆发了 西雅图这么久才有爆发倒是证明在白人里面确实传染性不强

okura 发表于 3/1/2020 1:37:19 AM


不能这么简单的下这个结论,这种传染病的传染速度和很多都有关系,包括生活方式(集中vs分散住)、人体本身的健康素质(除基因外的,常运动vs不常运动)、饮食结构、文化(带病上班vs不带病上班)、气候(温度、湿度),光是爆出来的数据这点就包括testing capacity、测控方式和数据透明度,没有一个baseline做数据比较的能得出的可信结果并不多。
另外可以看看伊朗的例子…

当然任何疾病有predisposition都很有可能,只是光靠时间来判断在不同人种间的区别是不够的
V
Viviennedd
有没有可能复阳性再次出现,居然和第一例linked,第一例的病例分析就是发病两周突然从轻症突然加重。新闻男女变换,还琢磨难道是变性人,大媒体不至于犯这种低级错误。 两周隔离期追踪检验肯定不够了。
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illia
p-value 只有0.03,所以也可能是巧合,现在已经有几万个病例了,出现这种巧合也可能

WA有若干个病例,再对其他的进行测序,就可以断定是否WA的疫情都来自于WA1了

记得当时看报道说WA1好像挺自觉的非常小心没有传染别人,到底是不是如此,马上就会揭晓了
郝爱国教授 发表于 3/1/2020 1:35:22 AM

统计学上p value是越小代表越确定的
小于0.05代表有统计差异
小于0.01代表有显著统计差异
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lilacxxt
这是基于一个位点的核酸突变而产生的结论。中国报道了好像59例,只有2例带这个突变位点,所以他得出的是2/59的结论。到底是不是看看后续报道吧。
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bluebeanice
回复 23楼snowfire的帖子 跟华州第一个确诊病人有接触的有十几个,他们都被医学观察了,但没有任何症状。可是他们是病毒携带者,检查也是阴性的。这40多天中,这些人接触了多少人,就可以知道已经很多人都是病毒携带者,只是都没有症状,直到传到这个中学生才出现症状。所以可以说,这个病毒对大多数人没有事情,所以大家不要过度紧张。
p
patx2449
回复 23楼snowfire的帖子

跟华州第一个确诊病人有接触的有十几个,他们都被医学观察了,但没有任何症状。可是他们是病毒携带者,检查也是阴性的。这40多天中,这些人接触了多少人,就可以知道已经很多人都是病毒携带者,只是都没有症状,直到传到这个中学生才出现症状。所以可以说,这个病毒对大多数人没有事情,所以大家不要过度紧张。
bluebeanice 发表于 3/1/2020 2:46:13 AM


就怕还有别的传染源,钟南山刚发的文章是一半确诊的都是无症状带菌者且传染性更强。最好赶快筛一下西雅图所有住院的重症患者, 从大致病程发展周期,目前重症阳性人数,可以反推大致感染人数。
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babyflynn
不是第一例接触的人都隔离了么?
sssccc 发表于 3/1/2020 12:12:13 AM

显然没隔离,波士顿发现的那例,一班班机网友家长,连电话都没接到过
郝爱国教授
回复 34楼ginnypotter的帖子 p-value的意义我是理解的。生物医学一般觉得5%以下就是统计显著了。 如果一件事情只有十几个病例,3%的p-value当然可以认为不会是巧合。 但是现在新冠的病例有几万个,3%的概率是巧合,就说明有几百上千的病例具有类似的基因序列完全是统计上的巧合而已
A
Abbots
这个tweet很有意思,很informative。

不过我说个难听的,如果这两个是有关联的,就更证明CDC所谓的surveillance或者self monitoring system是多么无能了。
Cherylshere 发表于 3/1/2020 12:19:40 AM

WA1 发现后, CDC都做了哪些surveillance, 有隔离过与WA1 接触的人吗
A
Abbots

这位讲的还是比较好懂的
nextstrain也可以去看看,根据测序结果画的进化树还是可以回答很多问题的

erniuth 发表于 3/1/2020 1:11:14 AM

有链接吗
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qbly
序列很相似,为啥就是第一例间接传染的? 武汉病毒的dna序列 不都很相似嘛,没啥基因突变。 所有人都可以说是武汉某个零号病人间接传染的。
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lansenlin
非常 informative, CDC 这次太烂了
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flipping
西雅图医疗资源也算西北地区最好的了,还有很多私立的研究所,gates基金会,各大公司的headquarter都在这里。要钱有钱,要技术有技术,砸就砸在CDC的对病人处理的protocol和试剂盒上了。
patx2449 发表于 3/1/2020 12:25:04 AM

自己不能搞个protocol测 然后说是 presumptive not confirmed cases, 不就完了?然后按positive 追踪好了
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complicated
话说那些出院的人现在都恢复生活工作了?
c
complicated
我家乡国内非疫区,武汉人在封城前逃离到我家乡的, 除了自驾的,几乎全都被统计出来了,包括逃离者的姓名,航班/车次号,日期及现落脚住所,美国这方面对比之下真的太第三世界了!
ajisenramen 发表于 3/1/2020 1:21:43 AM

我老家看到湖北车牌就举报
R
Ruigwl
序列很相似,为啥就是第一例间接传染的? 武汉病毒的dna序列 不都很相似嘛,没啥基因突变。 所有人都可以说是武汉某个零号病人间接传染的。
qbly 发表于 3/1/2020 7:06:43 AM


因为这两个在某同一个位点上序列是一样的,而这个变异在其他59?个病毒序列中只发现两例。所以这两个变异独立来源的可能性远远小于第二例来自第一例的可能性。
c
cloudling
这样排下来,下一个就是北加了。
a
amd06


就怕还有别的传染源,钟南山刚发的文章是一半确诊的都是无症状带菌者且传染性更强。最好赶快筛一下西雅图所有住院的重症患者, 从大致病程发展周期,目前重症阳性人数,可以反推大致感染人数。

patx2449 发表于 3/1/2020 3:05:26 AM

在中国医疗资源严重紧张的情况下,没有症状会有医生管?老终这么说,和影射美国是起源一样,已沦为政治工具了,真可悲
小毛衣
确诊病例的密接者隔离14天后应该测一下是否带病毒,有人体内病毒复制慢,尤其是无症状带菌的,国内好像就是这样做的吧
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ca563

在中国医疗资源严重紧张的情况下,没有症状会有医生管?老终这么说,和影射美国是起源一样,已沦为政治工具了,真可悲

amd06 发表于 3/1/2020 9:03:28 AM

所以中国上方舱啊,就是怕这些无症状者在外面会传染别人
p
peanutqq
我也觉得,如果不加控制传播了六周,医院里应该能看到更多不明病毒性肺炎的人
回复23楼 snowfire 的帖子 跟华州第一个确诊病人有接触的有十几个,他们都被医学观察了,但没有任何症状。可是他们是病毒携带者,检查也是阴性的。这40多天中,这些人接触了多少人,就可以知道已经很多人都是病毒携带者,只是都没有症状,直到传到这个中学生才出现症状。所以可以说,这个病毒对大多数人没有事情,所以大家不要过度紧张。 bluebeanice 发表于 3/1/2020 2:46:00 AM
B
BaoMaoDou
股市真的扛不住了。。。。
M
MiniiCooper
正相反,P-value .03, 那就是说97%的probability
p-value 只有0.03,所以也可能是巧合,现在已经有几万个病例了,出现这种巧合也可能 WA有若干个病例,再对其他的进行测序,就可以断定是否WA的疫情都来自于WA1了 记得当时看报道说WA1好像挺自觉的非常小心没有传染别人,到底是不是如此,马上就会揭晓了 郝爱国教授 发表于 3/1/2020 1:35:00 AM
每天都
正相反,P-value .03, 那就是说97%的probability

MiniiCooper 发表于 3/1/2020 11:58:28 AM


连p value都不知道是啥的能不能把嘴闭上?p value的意思是under the null,就是假设这俩独立,看到他们share这个mutation的概率是0.03,这个不是H0也不是H1的概率,是假设H0看到数据的概率。twitter上有回复给出了这俩事件独立的概率是0.01多一点,所以我原帖说的是1-2%
p
patx2449

在中国医疗资源严重紧张的情况下,没有症状会有医生管?老终这么说,和影射美国是起源一样,已沦为政治工具了,真可悲

amd06 发表于 3/1/2020 9:03:28 AM


你知道什么是密切接触者吗?很多都是无症状的,中国都给测了。控制无症状传播者的重要性大概你也不清楚吧。一天到晚只想政治工具,可惜病毒并不会给你讲政治的。
p
patx2449

自己不能搞个protocol测 然后说是 presumptive not confirmed cases, 不就完了?然后按positive 追踪好了

flipping 发表于 3/1/2020 8:00:49 AM


知道有的私立医院自己测了,用的未经批准的试剂盒,然后内部通知,防止医生护士感染,但是不能对社会公布,所以只能保护医护,但起不到防疫的作用。
m
mimimao
是哪的?
小声说以下一下, WA第一例是码农, 但不是amazon的 cysky 发表于 3/1/2020 1:10:00 AM
d
dugudugu
我家乡国内非疫区,武汉人在封城前逃离到我家乡的, 除了自驾的,几乎全都被统计出来了,包括逃离者的姓名,航班/车次号,日期及现落脚住所,美国这方面对比之下真的太第三世界了!
ajisenramen 发表于 3/1/2020 1:21:43 AM

国内有大数据啊,一查就查得到。这次除了湖北,其他地方都做得不错。中国还是强大了。
A
Acad
北加的几例 确诊病例还是自己在家隔离的呢,难道不怕传染给家人吗,
l
littlecold
还川老大呢 忙着给CDC站街呢 呵呵
m
mylittle9
p-value 只有0.03,所以也可能是巧合,现在已经有几万个病例了,出现这种巧合也可能

WA有若干个病例,再对其他的进行测序,就可以断定是否WA的疫情都来自于WA1了

记得当时看报道说WA1好像挺自觉的非常小心没有传染别人,到底是不是如此,马上就会揭晓了
郝爱国教授 发表于 3/1/2020 1:35:22 AM

你理解反了。
p Value是h null成立的概率。也就是两个基因序列独立发展的概率是3%
M
MiniiCooper
我觉得你根本没看懂我的回复,我和你说的是一个意思。我原本是回复那个层主的,她以为3%是巧合。我回复她说正相反,97%的概率reject the null, 就说这两个不独立啊。 动不动就让人闭嘴,你以为你是谁啊?
连p value都不知道是啥的能不能把嘴闭上?p value的意思是under the null,就是假设这俩独立,看到他们share这个mutation的概率是0.03,这个不是H0也不是H1的概率,是假设H0看到数据的概率。twitter上有回复给出了这俩事件独立的概率是0.01多一点,所以我原帖说的是1-2% 每天都 发表于 3/1/2020 12:34:00 PM
C
CleverBeaver
股市真的扛不住了。。。。
BaoMaoDou 发表于 3/1/2020 11:14:16 AM

futures已经很难看了
每天都
我觉得你根本没看懂我的回复,我和你说的是一个意思。我原本是回复那个层主的,她以为3%是巧合。我回复她说正相反,97%的概率reject the null, 就说这两个不独立啊。
动不动就让人闭嘴,你以为你是谁啊?

MiniiCooper 发表于 3/1/2020 7:31:18 PM

我也觉得你没看懂我的回复,我没有让你闭嘴,只是suggest你闭嘴。97%的概率reject the null还是错的,你理解错了什么是p value,你就去wiki一下,换个说法不会变成对的。
j
juliazry9
ddfdfdfdfdfdf dfdfd
d
dizia0220
CDC是猪党走狗,鉴定完毕!