这篇文章的本意，也根本不是在论述病毒到底是起源于中国还是外国，而是说并非起源于华南海鲜市场。他是认为蝙蝠病毒RaTG13先感染了某个宿主，然后演化出了H38和H13；H38和H13再相互作用成H3，同时RaTG13也可能影响了H3，由H3演变出了H1（华南海鲜市场）。 这个和之前泄露论并不矛盾。现在和SARS2最接近的病毒是什么？RaTG13。RaTG13从哪来的？P4的石正丽从云南山洞蝙蝠身上采集上传的。RaTG13现在哪里有？云南蝙蝠洞和武汉P4实验室。 happlen 发表于 2/27/2020 12:40:00 AM
现在扩散的病例至少来自于3个途径。
新京报快讯（记者 李玉坤 张璐）科研人员最新研究成果显示，武汉华南海鲜市场不是新冠病毒的起源地，新冠病毒可能最早于去年11月中下旬就输入武汉，并开始人际传播，在华南海鲜市场加快了人际传播。现在扩散的病例至少来自于3个途径。新型冠状病毒在2月12日之前发生过2次明显的种群扩张（分别是12月8日和1月6日）。
论文分析93个新冠病毒完整基因组
中科院西双版纳热带植物园副研究员郁文彬等人1月19日在中科院科技论文预发布平台chinaxi提交了一篇名为Decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) using whole genomic data（基于全基因组数据解码新型冠状病毒进化和传播）的论文（1月21日重新提交）。
科研人员收集了全世界各领域共享到GISAID EpiFluTM数据库中覆盖了四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据（截至2月12日），通过全基因组数据解析，追溯传染源及扩散路径。
研究发现，收到的93个样本包含58种单倍型（可以理解为核酸链上决定同一性状的多个连锁基因构成的基因型），可以归纳为五组，包括3个古老超级传播者单倍型（H1,H3和H13）和2个新的超级传播者单倍型（H56和mv2）。其中，在中国样本中发现31个单倍型，在其他国家样本中发现31个单倍型。
单倍型演化关系显示，单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型，通过一个中间载体（mv1，可能是一个祖先单倍型，可能是来自中间宿主或者“零号病人”）与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联，并通过单倍型H3衍生出了单倍型H1。
郁文彬对媒体解释说，这是一种基于种群遗传学的分析方法。一种基因型不等于一个患者，一种新冠病毒单倍型携带者有可能是多人，甚至可能是上百人，比如H1单倍型就对应了19个样本，但是可以通过这个来溯源，因为某个单倍型患者意味着可能是来自同一个源传染。
华南市场的新型病毒是从其他地方传入的
研究发现，与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是H1及其衍生的单倍型H2，H8-H12，而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关。
H3 单倍型只有一个来自武汉的样本，与华南市场没有联系，而含有H3的其他样本则来自其他国家和地区。值得注意的是，华南市场的所有样本均具有 H1 单倍型或其衍生的单倍型（H2，H8-H12），这表明市场上短期内存在传播感染。华南市场中的新冠病毒可能是从其他地方传播的，或者至少华南市场没有病毒的原始来源。由于最早确定的受感染患者与市场没有联系，受感染的人很可能将新冠病毒传播给市场上的工人或卖家，然后迅速在市场上流通。拥挤的市场加速了病毒传播给买家，并于2019年12月上旬传播到整个城市，这与估计的人口扩张时间相对应。
根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断，也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。
柳叶刀1月24日在线发表的一项研究显示，首例新型冠状病毒肺炎确诊患者于去年12月1日发病，且无华南海鲜市场暴露史。当时这项研究分析了2019年12月16日至2020年1月2日期间在武汉市入院的首批41例确诊感染新型冠状病毒的病例。结果显示，首批41例确诊病例中，27例去过华南海鲜市场，14例没有华南海鲜市场暴露史。
广东的病毒可能有三个来源
为了能够细分来源，研究人员将58种单倍型分成了五组，分别是3个中心（古老超级传播者）单倍型（H1,H3和H13）和2个新的超级传播者单倍型（H56和mv2）。以此鉴别出广东的病毒可能有三个来源，重庆和台湾的病毒有两个来源。
其中，广东深圳一家人在早期就通过人传人进行了传播。有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国，他们的患者感染源至少有两个，尤其是美国包括了五个来源。非常值得关注的是H56这个超级传播者单倍型，它同时是澳大利亚、法国和美国，以及我国台湾患者的传染源。
单倍型H13和H38的病毒样品溯源发现分别是来自深圳的病患（广东首例）和美国华盛顿州的病患（美国首例）。他们的旅行记录表明应该都是2019年12月底至2020年1月初在武汉探亲期间被感染的。但现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型。