这个是真是假呀

刚刚，浙江省疾控中心宣布，利用阿里达摩院AI算法，首次将原本数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时！

我们成功从死神手里抢回了宝贵的时间！要知道，新型冠状病毒是有史以来基因组序列最长的病毒之一，全长29847bp，更可怕的是它随时可能发生变异！传统局部检测早已不大适用，此次浙江采用的全基因组检测技术，能有效防止病毒变异产生的漏检。达摩院科学家更针对性研发多个AI算法比对模型，大大提升了检测效率，为后续疫苗与药物研发打下坚实基础！

不是299bp吗？

O(n^2) ---> O(nlogn) ---> O(logn)

O(n^2) ---> O(nlogn) ---> O(logn)
zlltt 发表于 2/1/2020 5:55:21 PM

这么牛的算法？

回复 1楼guess的帖子 看看最后药物疫苗是谁家的就知道了

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看看最后药物疫苗是谁家的就知道了

Batgirl 发表于 2/1/2020 6:00:10 PM

什么情况？

感觉有点忽悠外行的成分啊，29k的genome也就是病毒里面比较大，人的genome 可是3billion bp. 这个病毒reference genome已经有了，测序以后alignment 然后contig assembly 都有现成的软件可以用， 不太computational intensive. 如果只是检测有没有这个病毒应该不难的，不过如果要reconstruct quasi species 的话就比较challenging。 我也是胡说一下，很多年没分析过病毒序列了。。

从12月底八人暴 肺炎， 到一直掩盖到一月20号，
从“可防可控” 到 “ 湖北封十多城”，
从 没有问题 到 募捐口罩。
我觉得中国的科技医疗水平绝对 没问题， 主要问题是没有正常点的政府。

感觉有点忽悠外行的成分啊，29k的genome也就是病毒里面比较大，人的genome 可是3billion bp. 这个病毒reference genome已经有了，测序以后alignment 然后contig assembly 都有现成的软件可以用， 不太computational intensive. 如果只是检测有没有这个病毒应该不难的，不过如果要reconstruct quasi species 的话就比较challenging。 我也是胡说一下，很多年没分析过病毒序列了。。
appleapp 发表于 2/1/2020 6:09:37 PM

WGS也用不了太久 就是花费会比较贵

测序什么的不是建库，上机才是最耗时的吗。