药学分子动力学的未来(在制药领域)?

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microsat
楼主 (北美华人网)
请问分子(原子)的动力学建模,类似颜宁搞的东西,这个目前在制药行业有前景吗?
请问怎么能用动力学结构模型,来得出这个分子,对某种疾病有用呢?
有一种声音:这个分子动力学(chemoinfo, structural biology),除了发论文,其实没多大用处,药厂不用这玩意研发新药。请问这是对的吗?
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Batgirl
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药厂不是靠建模筛药的,找工作个人认为路很窄
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microsat
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药厂不是靠建模筛药的,找工作个人认为路很窄
Batgirl 发表于 2023-01-26 12:30

也就是你倾向于这玩意好看不中用。
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singlemummy
请问分子(原子)的动力学建模,类似颜宁搞的东西,这个目前在制药行业有前景吗?
请问怎么能用动力学结构模型,来得出这个分子,对某种疾病有用呢?
有一种声音:这个分子动力学(chemoinfo, structural biology),除了发论文,其实没多大用处,药厂不用这玩意研发新药。请问这是对的吗?
microsat 发表于 2023-01-26 12:24

这个方向要么走学术道路,要么转码
基本上没有可能进制药业
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microsat
这个方向要么走学术道路,要么转码
基本上没有可能进制药业
singlemummy 发表于 2023-01-26 12:31

请问哪些数据分析 能进 制药业?
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xiangzhi
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要去制药业工作去学美国药学院的药学专业,但是没有一家长春藤大学有药学院。颜宁以前在普林斯顿大学做的东西和制药应用还差很远。
单身男
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moecular dynamics可以被淘汰了 现在的AI不用知道任何基本原理,只要数据多,就可以推测出从最好的分子模型 现在药厂在淘汰strutural biology,因为neural network只要有数据,不需要任何structural biology原理 彻底把这行给替代了

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kinston
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要去制药业工作去学美国药学院的药学专业,但是没有一家长春藤大学有药学院。颜宁以前在普林斯顿大学做的东西和制药应用还差很远。
xiangzhi 发表于 2023-01-26 12:35

现在药企大部分职位都和药学专业没啥关系。
生物、化学、统计学背景的都比药学背景的多。
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flipping
去考个PK建模的证, 争取转成clinical PK 方向。
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microsat
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moecular dynamics可以被淘汰了 现在的AI不用知道任何基本原理,只要数据多,就可以推测出从最好的分子模型 现在药厂在淘汰strutural biology,因为neural network只要有数据,不需要任何structural biology原理 彻底把这行给替代了


单身男 发表于 2023-01-26 12:45

有道理。
请问用NN或者DL,来预测什么?是分子的结构吗?
先不谈准确率(在testing set里面)。
请问这个预测的意思是什么?也就是,这个预测的结构能辅助制药吗?
玉骨遥
看到好几个外行的评论,笑而不语。
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wantU
我以前读书的时候搞过PKPD模型 但是最后还是顺手拿了一个统计学位 事实证明还是统实用
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pinponlinzie
LZ, check out a company called "Schrodinger."
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microsat
LZ, check out a company called "Schrodinger."
pinponlinzie 发表于 2023-01-26 13:13

多谢! 为什么这些公司开出的DS offer一般都比较吓人,动则50万年薪。
而药厂,sd也达不到这么高的工资。
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microsat
看到好几个外行的评论,笑而不语。
玉骨遥 发表于 2023-01-26 13:09

如何能知道,哪些评论是外行,哪些评论是内行呢?
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pinponlinzie
多谢! 为什么这些公司开出的DS offer一般都比较吓人,动则50万年薪。
而药厂,sd也达不到这么高的工资。
microsat 发表于 2023-01-26 13:46

薛定谔的DS offer 能有50万? 层主是不是看错了啊?还是你是说其他公司?
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Hershel
薛定谔的DS offer 能有50万? 层主是不是看错了啊?还是你是说其他公司?

pinponlinzie 发表于 2023-01-26 14:13

层主是不是把401k 理解成40.1万块了
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minibombay1
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moecular dynamics可以被淘汰了 现在的AI不用知道任何基本原理,只要数据多,就可以推测出从最好的分子模型 现在药厂在淘汰strutural biology,因为neural network只要有数据,不需要任何structural biology原理 彻底把这行给替代了


单身男 发表于 2023-01-26 12:45

关键词, 有数据。
问题现在很多target 没数据,还是需要structural biology 和计算去提供一些数据的。
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mechanic8
请问分子(原子)的动力学建模,类似颜宁搞的东西,这个目前在制药行业有前景吗?
请问怎么能用动力学结构模型,来得出这个分子,对某种疾病有用呢?
有一种声音:这个分子动力学(chemoinfo, structural biology),除了发论文,其实没多大用处,药厂不用这玩意研发新药。请问这是对的吗?
microsat 发表于 2023-01-26 12:24

structural biology 一般是指高清蛋白质的三级和四级构像 这个就是有点空中楼阁 AI现在已经基本上可以解析了 所以说前途不看好 但是 pharmcodynamics 药动学是研究普通化学分子的 一级结构及其isomers 譬如磺胺药 因为有个S=O就使其 抗菌效果变得温和 也没有shock response 副作用 这个一直是有用的。Pharmcodynamics is NOT structural biology.

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mechanic8
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要去制药业工作去学美国药学院的药学专业,但是没有一家长春藤大学有药学院。颜宁以前在普林斯顿大学做的东西和制药应用还差很远。
xiangzhi 发表于 2023-01-26 12:35

structural biology is NOT pharmacodynamics.
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mekey
不是很清楚,不过感觉得到现在大药厂都在推digitalization,research那边能不能用分子动力学筛选药物呢?比如选好一个靶点,通过分子动力学模拟出最佳蛋白sequence或者定向设计蛋白结构? CMC这边的话,分子动力学能否用于stability预测或者in silico formulation selection?楼主你研究这一块应该更清楚应用吧。 我自己在CMC 感觉大药厂还是很喜欢做一些模拟的。
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tuzituzi
虽然对制药未必有用,但是对于risk analysis有一些用处的,可以看看EPA 的工作机会