zt知乎对美东白尾鹿感染新冠的评论

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yweili
楼主 (北美华人网)
https://www.zhihu.com/question/477163612/answer/2043717869
大家好,马上周末了,老夫来贩卖个特大号的焦虑吧。

一、 问题描述里那两个链接,都说白尾鹿抗体抽样阳性率40%。 这完全没有体现出问题的严重性。 咱看看美国农业部的报告啊[1] 在密歇根州,67%的小鹿鹿抗体阳性。 这可就奇了怪了。 67%阳性率是啥概念? 各位不妨参考一下这个答案: 印度人为什么没有所有都感染新冠病毒?160 赞同 · 25 评论回答 当初新加坡把30多万移工关在集体宿舍里面同吃同住半年养蛊,最终养出来的抗体阳性率也不过47%而已。 然后再也没法推高了。 所以你一群马鹿何德何能,凭啥有67%阳性率? 更何况,小鹿鹿们也没在集体宿舍里同吃同住, 正好相反,按照wiki的说法,小鹿鹿们的生活习性差不多是这样的:
白尾鹿分布于加拿大南部、美国大部和南美洲北部。每年11~12月交配,一雄多雌,妊娠期196~210天,每窝产仔1~2只(多时3~4只)。幼鹿随母鹿生活1~2年,8个月性成熟。善游泳,能游过 6~14千米的水域。有季节性迁徙习性。不喜结群。当大雪或食物缺乏时,在适宜栖息和食物丰富处聚集4~5只左右。以草、灌木、嫩枝、菌类、坚果、苔藓为食。
不喜结群,食物缺乏时聚集4~5只左右。 不喜结群,食物缺乏时聚集4~5只左右。 不喜结群,食物缺乏时聚集4~5只左右。 (重说三) 朋友们请告诉我,这样的生活习性,怎么可能搞出来67%的阳性率? 别说新冠了,就算派麻疹出马也不好使吧~

所以这67%的阳性率到底是咋回事?——盲猜两种可能性吧: 存在其他中间宿主发生了水源粪口传播 感觉以上随便哪种可能性都足以引发巨量的焦虑……

二、 咱沿着中间宿主和粪口传播的猜疑往下继续发散~ 说到动物感染新冠,白尾鹿其实只是个无关紧要的小问题…… 对美国,或者说对全世界而言,真正大条的是这个[2] 上周纽约城市大学和密苏里大学几位作者联合发了篇预印本, 话说为了监测纽约的新冠毒株变异情况,这几位作者连续几个月都在纽约周边14个污水处理厂采样。 结果一不留神就采到了惊天大瓜…… 简单来说就是,作者们用了一些我们不需要理解细节的黑科技, 可以测出污水样品中病毒残片刺突蛋白第412到579氨基酸位点的突变(RBD结构域就在这个范围),并且可以确认这些测出来突变点位是不是属于同一个RNA序列。 因此作者们可以通过突变点位的排列组合,进一步推算出污水样品中各个变异株的流行率(这里说流行率好像有点怪怪的…) 然后根据以上原理,作者们也真的在废水里测出了各种流行变异株,比如alpha、beta、gamma和delta等,并且跟纽约市感染者基因测序得到的流行率基本一致。 ——详见下图: 图有点糊,将就看看呗…… 如上图,左边是各个时间段感染者基因测序得到的各毒株流行率,右边是对应时间段污水测序得到的各毒株流行率。 不同色块代表不同毒株,详见右边注释框。 一切都挺正常对不对? 除了污水测序组里夹了一坨深蓝色块…… 那一坨代表污水中的不明毒株(unknown waste-water lineage)。 本来污水样品里边有不明毒株倒也挺正常,因为对污水采样约等于是全局抽样,而纽约市并没有给所有感染者做测序。 但作者们进一步发现了两个疑点: 随着纽约疫情好转,确诊人数日益减少,深蓝色部分所占份额却越来越多,并且从增加的比例来推论,这部分的绝对数量并不受纽约疫情曲线影响;深蓝色部分包含了四种闻所未闻的变异毒株: 各位你们看不懂图也没关系,你们不需要知道这四种变异株具体是啥。 你们只需要知道,现如今人类所有测序数据库的接近三百万条测序记录里面,完全找不到这四种,连依稀相似的都没有。

——焦虑警告,下面进入贩卖焦虑环节——

然后作者们进一步发现,这四个变异株唯一共同的突变点位——Q498——这货非常罕见。 截止7月26日,美国共有两个含有Q498H的测序记录。 宿主都是老鼠。 宿主都是老鼠。 宿主都是老鼠。

老夫可以再帮作者加点料啊~ 首先老夫搜了下GISAID,国内也有三个含有Q498H的测序记录, 宿主也全部是老鼠。 ——比如,请品鉴:

然后呢,前段时间华中农业大学金梅林老师在柳叶刀上发表了一个研究结果[3] Q498H突变是促进病毒感染老鼠的关键突变。 Q498H突变是促进病毒感染老鼠的关键突变。 Q498H突变是促进病毒感染老鼠的关键突变。

三、 所以啊,白尾鹿超高阳性率的蹊跷似乎就解释得通了。 如果美国存在啮齿动物类自然宿主的话,那么不管是作为中间宿主传播还是通过水源粪口传播,引起鹿群大量感染都不是没有可能。 而且,妈耶…… 这种时候还需要在意什么白尾鹿吗? 对于人类来说,还有什么比生活在纽约这种大城市,无视人类疫情涨跌,持续向污水厂贡献病毒碎片的老鼠更可怕??? 白尾鹿这种废柴,有必要的话直接全面扑杀就行。 纽约市的老鼠谁来扑杀看看? 说不定消灭新冠病毒都比灭鼠容易一点吧……

——焦虑警告又来了——

四、 作者们显然不想就此罢休。 他们还想继续制造焦虑。 他们把纽约污水厂发现的四种神秘毒株放在慢病毒载体上(顺便拿D614G毒株做对比组),分别用来跟表达了人ACE2、大鼠ACE2、小鼠ACE2以及不表达ACE2的293ft细胞系做感染实验。 结果如下: 看不懂图没关系,老夫口述一下——从左到右四组柱子分别代表没有ACE2的293ft细胞系(对照组,只有跨膜蛋白酶)、有人ACE2的细胞系、有小鼠ACE2的细胞系,以及有大鼠ACE2的细胞系。 各种不同颜色的柱子从左到右分别代表原始毒株(D614G)、alpha毒株(A570D+N501Y)、四种污水神秘毒株,以及作为对照的慢病毒载体(neg)。 柱子越高则代表对应毒株越易感。 试验结论—— 原始株(D614G)不能感染大鼠和小鼠;污水中的四种神秘毒株非常容易感染大鼠和小鼠;污水中的四种神秘毒株也非常容易感染人类。 怎么样,各位,有没有瑟瑟发抖?

五、 作者们丧心病狂了,焦虑感已经冲破了天际…… 他们继续拿污水里的四种神秘毒株针对BNT疫苗以及礼来/再生元单抗做了抗体中和实验。 ——请品鉴: 看不懂图没关系,老夫帮各位打个总结啊—— 四种神秘毒株里面有三种都表现出了满格的免疫逃逸能力。

六、 老夫最后再来补一刀吧。 作者们一开始不是说Q498H这个突变非常罕见,只有老鼠才有吗? 就在作者们截稿当天,遥远的大西洋对岸,西班牙加泰罗尼亚地区, 发现了一份带Q498H突变的人类测序结果: 并且可能各位已经猜到了,底子是delta。