巴斯德研究所最新研究:法国疫情非中国输入引发

c
colormdy
楼主 (北美华人网)
4月28日,巴斯德研究所发布新闻公告,该所已完成“法国输入性与早期传播病毒的朔源分析”相关研究,研究结果于近日以预发表发布在bioRxiv.org网站。 根据该研究,法国暴发的新冠肺炎疫情并不是由1月份来自中国的输入病例引起的,也并非来自意大利,而是来自一种在当地传播的来源不明毒株。该研究由法国国家呼吸道感染病毒参考中心主任西尔维·范·德维尔和巴斯德研究所RNA病毒进化基因组学负责人埃蒂安·西蒙·洛里埃共同牵头。 根据巴斯德研究所提供的新闻稿,继去年12月武汉市出现新冠肺炎疾病后,法国于1月10日开始病毒监测,由巴斯德研究所和法国呼吸病毒研究所(NRC)负责启动密切关注流程。 法国于1月24日发现首例新冠病毒感染者,这也是欧洲首例新冠肺炎患者,另有其他两例中国输入性病人也很快被检测和收治。法国政府迅速采取措施,追踪了这些患者的密切接触者,阻止了病毒的进一步传播。1月份的中国输入病例没有在法国引发局部传播,显示出法国采取预防病毒扩散系列措施的有效性。 法国采集的新冠病毒样本均储存在国家呼吸病毒研究所,巴斯德研究所RNA病毒进化基因研究组对97份法国病毒样本进行了基因测序与比对。 样本主要为鼻咽拭子和痰液,采样时间为1月24日至3月24日。法国该阶段确诊病例22302人,死亡1100人,疫情主要流行于法国北部。 全部样本均采自于有临床症状的确诊患者,同时将籍贯、旅行史、发病时间、病毒载量和采样部位纳入基因比对内容。另有3份来自阿尔及利亚病毒样本。 法国3月疫情主要地区分布图 法国新冠肺炎样本单核酸多态性发生部位比较图 根据欧洲精准医疗平台首席科学家鞠丽雅对该溯源研究的解读,图中显示: 1、取自法国东南部并有意大利旅行史的病毒株(GE1583,B2340)与法国北部的不同,但和意大利北部流行株类似,而且没有在法国流行; 2、法国首例武汉患者(IDF0372),其单核酸多态性 G22661T是独有的,与法国的所有病毒基因不同; 3、法国北部地区的代表性病毒基因为 GE1973 (东大地区), IDF2849(大巴黎地区) 和 N2223 (诺曼底地区); 4、有欧洲旅行史的代表基因为 IDF2792; 5、3份取自阿尔及利亚的病毒株与法国北部流行株同源。 巴斯德研究所将法国检测的样本序列与全球共享流感数据倡议组织(GISAID)发布的338份新冠肺炎病毒序列进行比对和溯源分析,并建立病毒进化树图谱。 对比研究表明,法国流行的新冠病毒和1月发现的中国输入感染病毒并非来自同一毒株,两种病毒来自同一个“祖先”,但属于不同的分支。导致法国本地疫情的主流分支,和来自中国和意大利的输入病例都不相同。 法国现今流行的病毒样本中,最早一个样本是2月19日从一名患者身上采集的,该患者没有国内外旅行史,也没有和海外归国的旅行者接触过。该患者于2月25日去世,随后法国出现大规模疫情潮。 来自不同地区病毒进化树 鞠丽雅对科技日报记者表示,从图中可以看到: 来自亚太地区(包括湖北武汉)的病毒株与法国病毒株没有关联; 来自美国病毒株与法国的关联不大; 法国北部流行病毒株(不同地区有不同彩色)均出自于同一原始株。 用通俗的话来解释,法国新冠病毒是一个历史久远的大家族,和中国武汉的病例相隔甚远。 综合上述结果,巴斯德研究团队提出,由于最有代表性的基因型的最早病例并没有旅行史,意味着早在2月份欧洲疫情爆发之前,已经有病毒在法国和欧洲其他国家“悄然”流行,且大部分是轻症或无症状,因而长时间未被发现。这项工作为法国病毒溯源提供了线索,并强调在无症状病例大量存在的情况下,遏制病毒传播面临挑战。 巴斯德研究所指出,许多国家的病毒取样工作仍然不完全,因此无法精确估算出法国新冠病毒的来源或输入时间。 蒂安·西蒙·洛里埃指出,“根据我们的首次观察,法国流行的新冠病毒感染与无症状病例有关。对不同地区的新冠病毒进行测序很重要,以便能更好地了解法国新冠病毒的流行轨迹。”
c
colormdy
结合隔壁帖子:法国科学家重测发现去年12月的肺炎病人是新冠 越来越扑朔迷离了。。。
v
vvdd
啊?!!有英文版吗?
s
sunfic
不要人为的瞎解释 “法国新冠病毒是一个历史久远的大家族,和中国武汉的病例相隔甚远。” 明显是有误导性的结论 如果这个研究结论可靠的话,这个只能说明法国新冠病毒是由比海鲜市场还早的病毒源带来的 这个病毒源应该是法国和武汉海鲜市场共同的祖先 那么这个祖先的病毒源在哪里呢?有意思的地方来了,整个中国,最早的一批病毒基因序列就只有海鲜市场的,再早的?中国政府没有查或者查了没公布,再晚点的?武汉没有除了海鲜市场相关的基因序列 那么也就是说,如果这个研究结论可靠的话,武汉市早就存在社区传播病毒,而且传播的时间和范围都比想象中的要早,甚至有很多都已经传播到海外。海鲜市场只是一个爆发点,不是原始社区传播点 那么中国政府为什么不去查武汉的0号病人 首例病例并将其基因序列上传呢? 如果你说查不到,那也好,把武汉早期除了海鲜市场接触史的病例也调查一下发布一下好不好?为啥这些都没有?
a
apple2april
这锅还真准备往法国头上甩了?
c
colormdy
要管3721
蓝金黄了全世界呀!锅还是得厉害国背,甩不掉的。
大青椒
可能跟葡萄酒一样,各国都有自产的牌子。
c
colormdy
这是法国巴斯德自己发表的论文,你知道巴斯德在传染病研究领域的地位么?
这锅还真准备往法国头上甩了? apple2april 发表于 5/3/2020 10:05:00 PM
T
Threebears
回复 1楼colormdy的帖子

中国政府1月20日还说没有明确人传人,法国为什么一月初就开始测试了?现在越来越相信共产主义联盟的存在了
对了,法国的世界刑警组织主席孟宏伟先生,为什么突然被中共抓走?王健死了以后,法国警察局让孟宏伟随便做假证据。法国的刑警组织已经被彻底蓝金黄,学术圈呢?
h
honeymustard
等着看怎么再完美的甩回美国
菲菲菲
中国科学院上海巴斯德研究所传出来的消息吧
T
Threebears
回复 9楼colormdy的帖子 那你知道法国的世界刑警组织的地位吗?哈哈
c
colormdy
看不懂英文?
中国科学院上海巴斯德研究所传出来的消息吧 菲菲菲 发表于 5/3/2020 10:11:00 PM
s
sunfic
蓝金黄了全世界呀!锅还是得厉害国背,甩不掉的。
要管3721 发表于 5/3/2020 10:06:33 PM

应该不是
从合理的逻辑上讲 这是必然的结果 因为武汉的第一例有记载社区传播病例是在11月17日
这之后长达一个月时间没有封闭 肯定有去往国外的病例

中国上传的最早病例是华南海鲜市场那批 没有海鲜市场接触史是不测而且也不算为新冠病人的 都是1月1日前后的那批 中国于1月12日分享了这种新型冠状病毒的基因序列信息

那么问题来了 11月中旬到12月底这段时间 随着国际航班飞往世界各地的武汉居民,他们当中肯定也有感染者。而且当时没有任何的措施来隔离和识别这批人。这么算来 各个国家最早在12月初就有可能出现社区传染病例 而且这些病例的核酸基因序列样本及其珍贵,这是更接近0号病人的原始基因序列 而且这是你永远也没办法从中国官方渠道得到的基因序列
s
sunfic
“巴斯德研究所指出,许多国家的病毒取样工作仍然不完全,因此无法精确估算出法国新冠病毒的来源或输入时间。” 就差跪着求中国去调查0号病人了
Z
Zigzag123
中国不查0号病人也没有更早病人的样本,这个图怎么看都有问题吧
v
vvdd
多谢LZ英文链接,里边基本事实和中文版一致,不过少了鞠丽雅点评。 这要是被承认,中国当真一口大锅甩出去了。
h
honeymustard
厉害国有没有解释过为啥不查零号病人
s
sunfic
多谢LZ英文链接,里边基本事实和中文版一致,不过少了鞠丽雅点评。

这要是被承认,中国当真一口大锅甩出去了。
vvdd 发表于 5/3/2020 10:16:57 PM

这个怎么可能甩锅。。。 你当别人都是傻子吗?
p
password101
中国科学院上海巴斯德研究所 才是真正的作者吧
c
chenminer
安了。 However, “current sampling clearly prevents reliable inference for the timing of introduction in France,” making it impossible to go one step further and conclude that the virus existed in France even before it was discovered in China. 永远跳过中文翻译看原文。重要的事情说三遍。
v
vvdd
这可是原文哦,傻不傻随便你觉得。“If this were to be established it would have huge implications, and may feed into the propaganda war between China and the US.”
c
chenminer
英文虚拟语气,没看懂?
缺德舅舅
啊?!!有英文版吗?
vvdd 发表于 5/3/2020 9:58:54 PM

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.24.059576v2.full.pdf

Abstract

Following the emergence of coronavirus disease (COVID-19) in Wuhan, China in December2019, specific COVID-19 surveillance was launched in France on January 10, 2020. Two weekslater, the first three imported cases of COVID-19 into Europe were diagnosed in France. Wesequenced 97 severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) genomes fromsamples collected between January 24 and March 24, 2020 from infected patients in France.Phylogenetic analysis identified several early independent SARS-CoV-2 introductions withoutlocal transmission, highlighting the efficacy of the measures taken to prevent virus spread fromsymptomatic cases. In parallel, our genomic data reveals the later predominant circulation of amajor clade in many French regions, and implies local circulation of the virus in undocumentedinfections prior to the wave of COVID-19 cases. This study emphasizes the importance ofcontinuous and geographically broad genomic sequencing and calls for further efforts withinclusion of asymptomatic infections.
h
hanli
“巴斯德研究所指出,许多国家的病毒取样工作仍然不完全,因此无法精确估算出法国新冠病毒的来源或输入时间。”

就差跪着求中国去调查0号病人了
sunfic 发表于 5/3/2020 10:16:02 PM

However, “current sampling clearly prevents reliable inference for the timing of introduction in France,” making it impossible to go one step further and conclude that the virus existed in France even before it was discovered in China

这是英文。文章强调的是现在很难溯源找到零号病人,疫情在发现第一个病人前就在法国社区里传播了。
h
hanli
好好的文章让你们一翻译就变味了
q
qiuqiu456
这可是原文哦,傻不傻随便你觉得。“If this were to be established it would have huge implications, and may feed into the propaganda war between China and the US.”
vvdd 发表于 5/3/2020 10:21:20 PM


拿着新闻的虚拟语气来断章取义?为何不敢贴出人家说“However”那段?楼主和从中国狗洞里钻出来的七毛们为何总删除或淡化英文新闻里的关键部分?
用删减、篡改、淡化过的中文假新闻骗骗墙内中国人也就算啦,还天真以为跑到国外能继续骗傻子?也不看看这个英文新闻是4月29日发表的,最早是在《中国南华早报》上发表了,有没有激起半点水花来?因为国外人都看得懂英文意思!倒可笑《人民日报》把删除篡改过的信息发布到墙内去啦!
s
stacych8008
我要看原文 中文的不算
v
vvdd
也多谢楼上的英文版本。 当时上海病毒所1月三号上传共享的基因系列,应该就是中国的最高水平了。也许武汉还有其他版本在流传,但是有记录的不指望还会有别的版本了。
r
rime
坐等厉害国的外交部来解释此信息。
缺德舅舅
看完了,很简单的paper。中心思想就是早期筛查漏人了,至少有一个人被漏掉未找到,造成一支在法国传的兴旺发达。
结合数据库的图总结了一下文章讨论内容,一看就懂。
绿色的点都是法国的病例。紫色蓝色代表中国/亚洲,红色橙色代表美国/美洲,黄色绿色代表欧洲。
楼主这标题起的坏坏的。
v
vvdd
多谢楼上更多解读。那意思是法国现在流行的是当初没被检测到的病毒种类? 不知道美国有类似研究吗,我猜更多是欧洲那边的。
缺德舅舅
多谢楼上更多解读。那意思是法国现在流行的是当初没被检测到的病毒种类?

不知道美国有类似研究吗,我猜更多是欧洲那边的。
vvdd 发表于 5/3/2020 11:18:50 PM

说明法国流行的主要动力,是当初漏了一个人或一家人。现在法国大概一大半的病人,都是这一个人或一家人的“后代”。
v
vvdd
OK从这个图来看,被漏诊的病毒那一枝,基本上没有在亚洲流传。当然还有可能性是病毒变异了。 细看了图一下,美国粗估70%从欧洲来,30%从亚洲来。
s
sillynut
一看这种没原文链接,直接翻译的就知道五毛粉红们嚼剩下的,这种低级手段还是不要在华人上尝试了。太流氓
缺德舅舅
多谢楼上更多解读。那意思是法国现在流行的是当初没被检测到的病毒种类?

不知道美国有类似研究吗,我猜更多是欧洲那边的。
vvdd 发表于 5/3/2020 11:18:50 PM


美国情况我可以帮分析一下。
东部主力与法国同源,可能都属于被漏掉的那个人或那家人的“后代”。

西雅图流行款直指相亲哥,基本都是他的“后代”。

东部还有很多病例应该是意大利输入传出来的“后代”。

美国除了与法国同源这一支,其他基本呈现百花齐放姿态,提示从各地多点输入。既符合美国各族大熔炉的背景,也说明筛查基本上千疮百孔形同虚设。

c
cidcnm
看完了,很简单的paper。中心思想就是早期筛查漏人了,至少有一个人被漏掉未找到,造成一支在法国传的兴旺发达。
结合数据库的图总结了一下文章讨论内容,一看就懂。
绿色的点都是法国的病例。紫色蓝色代表中国/亚洲,红色橙色代表美国/美洲,黄色绿色代表欧洲。
楼主这标题起的坏坏的。


缺德舅舅 发表于 5/3/2020 11:09:26 PM

这个图麻烦改一下吧,法国2019年12月已经有病例,你还需要琢磨下怎么自圆其说
缺德舅舅

这个图麻烦改一下吧,法国2019年12月已经有病例,你还需要琢磨下怎么自圆其说

cidcnm 发表于 5/3/2020 11:48:22 PM

不用改,这个就是这篇文章的结论。文章写来需要周期,当时法国已知最早的就是1月底的病人,12月那位不是这两天才发现的么。
而且也不矛盾啊,如果12月那家基因测序一下刚好就是法国流行款根源,拼图不是一下子就完整了吗?
s
sunfic
OK从这个图来看,被漏诊的病毒那一枝,基本上没有在亚洲流传。当然还有可能性是病毒变异了。

细看了图一下,美国粗估70%从欧洲来,30%从亚洲来。
vvdd 发表于 5/3/2020 11:29:09 PM

不是没有在亚洲流传 而是不属于武汉海鲜市场的那一枝
v
vvdd
像武汉这种情况,十二月底有百来个病例,一月三号基因系列出来,那会开始contact tracing,检测排除,会来得及吗?如果来不及的话,下回再有什么类似的新病毒,是不是一样没辙,需要走lock down的路?
v
vvdd
自问自答一下,韩国走的就是这个跟踪检测的方法,所以可行,但实际上武汉当时不太可能做到。 回楼上的某个问题,层主的图上欧亚病例颜色没有重叠,所以病毒种类不同。
马又甲


拿着新闻的虚拟语气来断章取义?为何不敢贴出人家说“However”那段?楼主和从中国狗洞里钻出来的七毛们为何总删除或淡化英文新闻里的关键部分?
用删减、篡改、淡化过的中文假新闻骗骗墙内中国人也就算啦,还天真以为跑到国外能继续骗傻子?也不看看这个英文新闻是4月29日发表的,最早是在《中国南华早报》上发表了,有没有激起半点水花来?因为国外人都看得懂英文意思!倒可笑《人民日报》把删除篡改过的信息发布到墙内去啦!

qiuqiu456 发表于 5/3/2020 10:39:37 PM


👍👍
j
joely996
lz lz回来解释一下吧? However那段是咋回事?
m
mmjj123
不得罪全世界誓不罢休。请继续加速。
s
shoppingisfun
这事情吧, 世界各国就是穷举法, CCP不是死活不肯查源头嘛,好我们来查, 中国总有人员流出的吧,我们就查这些人。 法国这下不是查出来一家女主人没病,女主人工作的隔壁就是个寿司店,里面都是中国人不是, 那就调动手机tracing,gps的信号总不是用中国北斗的吧,不能像海鲜市场一样毁尸灭迹了吧。
s
susancoffee
不要人为的瞎解释 “法国新冠病毒是一个历史久远的大家族,和中国武汉的病例相隔甚远。” 明显是有误导性的结论 如果这个研究结论可靠的话,这个只能说明法国新冠病毒是由比海鲜市场还早的病毒源带来的 这个病毒源应该是法国和武汉海鲜市场共同的祖先 那么这个祖先的病毒源在哪里呢?有意思的地方来了,整个中国,最早的一批病毒基因序列就只有海鲜市场的,再早的?中国政府没有查或者查了没公布,再晚点的?武汉没有除了海鲜市场相关的基因序列 那么也就是说,如果这个研究结论可靠的话,武汉市早就存在社区传播病毒,而且传播的时间和范围都比想象中的要早,甚至有很多都已经传播到海外。海鲜市场只是一个爆发点,不是原始社区传播点 那么中国政府为什么不去查武汉的0号病人 首例病例并将其基因序列上传呢? 如果你说查不到,那也好,把武汉早期除了海鲜市场接触史的病例也调查一下发布一下好不好?为啥这些都没有?
sunfic 发表于 5/3/2020 10:05:15 PM
武汉测出来的基因序列1月初就已经跟全世界共享了。
C
Caffeine
中国上传的最早的病毒dna是12月底的了吧。都快两个月了,差远了。
t
tuer
这次就看中国能不能赖的掉了。赖掉了以后美国也失去最后制衡的机会了。中国起来是必然了。
s
susancoffee
厉害国有没有解释过为啥不查零号病人
honeymustard 发表于 5/3/2020 10:17:42 PM
因为查不到啊。刚开始传染的40个病例,就只有一半的人去过海鲜市场,还有一半的人没去过海鲜市场,跟另外一半的人也没有交集。你说这种情况,怎么判断0号病人。。。
s
susancoffee
安了。 However, “current sampling clearly prevents reliable inference for the timing of introduction in France,” making it impossible to go one step further and conclude that the virus existed in France even before it was discovered in China. 永远跳过中文翻译看原文。重要的事情说三遍。
chenminer 发表于 5/3/2020 10:21:18 PM
这就只是说目前的研究并不能得出结论中国爆发之前就在法国出现。但是也没有否认呀。 法国流行的病毒毒株跟中国不一样这一点是实打实确认了的
j
jbea
讨论这些有用吗?
S
StrawberrySC
唉……就是中国弄出来的。有意也好无意也罢,为什么天天想着要甩锅
王秋梦
等着吧,真相越来越近了,等着轮子们那张丑陋的脸被打的啪啪响吧