今天nature medicine上的paper,请大牛们来解读

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shoppingisfun
几天前的吧? 就是说这个病毒吧,和已知序列都对不上。 而且变异得不尴不尬,还不是大杀器。 结论就是不是人工的,人工的比这要精致。
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lilacxxt
Scripps 非常牛的美国研究所。自然选择结果,ACE2允许了另一种结合方式。这病毒太牛了。
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minqidev
因为该病毒有强烈的自然选择特征,而且序列从未出现过。

相当于说,现在全世界的电脑在dos的时代,你突然捡到了一张来自未来的FIFA2020的游戏碟,但你根本玩不了,dos时代没有可以玩这个游戏的电脑,不管是硬件还是软件。

人现有知识是5000个病毒,但这个病毒100万个病毒,随机自然选择出的。
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qqzjqqzj
几天前的吧?
就是说这个病毒吧,和已知序列都对不上。
而且变异得不尴不尬,还不是大杀器。
结论就是不是人工的,人工的比这要精致。
shoppingisfun 发表于 3/18/2020 10:26:05 PM

还不是大杀器?
人工的可以更杀器?
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minqidev

还不是大杀器?
人工的可以更杀器?

qqzjqqzj 发表于 3/18/2020 10:37:47 PM

大杀器是埃博拉
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calicali
(i) natural selection in an animal host before zoonotic transfer; and (ii) natural selection in humans following zoonotic transfer. 两种可能的来源。 不是人工合成,那么 zoonotic transfer是怎么发生的?
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lilacxxt

还不是大杀器?
人工的可以更杀器?

qqzjqqzj 发表于 3/18/2020 10:37:47 PM

一线医生都说这个病毒致死率没有SARS高,如果没有医疗挤兑,成活率很高的。二月中到武汉重症支援的医生说icu死亡率大概在百分之十几,这是医疗资源逐渐上来以后,早期武汉很惨的。
这个
该用户帖子内容已被屏蔽
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cliu706
无论结果是什么,希望科学家能还原真相。
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shoppingisfun

还不是大杀器?
人工的可以更杀器?

qqzjqqzj 发表于 3/18/2020 10:37:47 PM

是啊,他们模拟了3.0版本,ace2结合性更高。
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taipalengle
也就是说现在只能去蝙蝠或者其他动物身上去分离,如果能找到和人体一样的序列就能说明来源于动物的自然选择?
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shoppingisfun
也就是说现在只能去蝙蝠或者其他动物身上去分离,如果能找到和人体一样的序列就能说明来源于动物的自然选择?
taipalengle 发表于 3/18/2020 10:49:04 PM


把武汉液氮里冻的毒株都测个序就可以了,只怕已经全毁了。
那个rg13t,那前面12株序列呢。
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lilacxxt

意大利北部医疗资源也很充足,但哪里死亡率蛮高的,虽然死亡的大部分是年长者……

这个 发表于 3/18/2020 10:46:15 PM

短期之类大量病人涌进医院,再好的医疗系统也无法承受。意大利有院内感染,自从那之后越发不可收拾了。武汉其实一样,封城非常仓促,老百姓害怕朝医院跑,形成院内感染,没床收治,要不是后面想出方舱隔离,又有全国支援,现在肯定尸横遍野。就算如此,早期也非常惨烈。
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minqidev

意大利北部医疗资源也很充足,但哪里死亡率蛮高的,虽然死亡的大部分是年长者……

这个 发表于 3/18/2020 10:46:15 PM

SARS 15%还是青壮年,你怕不?
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buzhidao2000

意大利北部医疗资源也很充足,但哪里死亡率蛮高的,虽然死亡的大部分是年长者……

这个 发表于 3/18/2020 10:46:15 PM


意大利确实吓人,怎么这么高。以前也没觉得意大利人口老龄化这么厉害,再说人口老龄化的日本不也还好嘛。
确实这病的死亡率没那么吓人,主要是前期武汉的惨相(华人上又大大宣扬了两个月),再加上意大利的情况,把人吓住了。
在过一阵,患者痊愈的多了,大家可能会有点信心。
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EdwardVIII
还不是大杀器?
人工的可以更杀器?

qqzjqqzj 发表于 3/18/2020 10:37:47 PM

作者說沒有達到最優化,人工的應該達到最優化。但這個不成立,因爲有可能製造者不知道最優化應該是什麽樣的,或者認爲最優化的就是這個樣子。
提大提大
读文献的帖子WM和LYD都比较少啊 四楼讲的有点意思
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lilacxxt

读文献的帖子WM和LYD都比较少啊

四楼讲的有点意思
提大提大 发表于 3/18/2020 11:09:29 PM

scripps 又不是野鸡研究所,算是美国最牛之一了。nature medicine又不是野鸡杂志,数顶刊之一了。真正学术大家都不感兴趣。
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Jimatssf
因为该病毒有强烈的自然选择特征,而且序列从未出现过。

相当于说,现在全世界的电脑在dos的时代,你突然捡到了一张来自未来的FIFA2020的游戏碟,但你根本玩不了,dos时代没有可以玩这个游戏的电脑,不管是硬件还是软件。

人现有知识是5000个病毒,但这个病毒100万个病毒,随机自然选择出的。


有没有可能是人为加快了自然选择 按理和人亲和,要上百万次变异并且被人类基因试解锁才可以。蝙蝠又不是猫狗,哪里有机会这样变异?
山地时间
文章讨论了细胞培养逐渐传代积累突变的可能性,但是可能性很低。一种可能,动物传播,找到这种动物比较重要,因为如果找不到,有可能卷土重来。第二种可能性,早期动物传播,但是对人体影响不大,但是因为在人类中不断积累突变,导致形成了极优解,如果是这种情况,就不用担心从动物再次传播到人的可能。蝙蝠里面的病毒没有那个提高结合亲和力的突变,穿山甲的突变倒是比较相似,但是穿山甲的也没有那个polybasic cleavage sites。
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Seeking668
鼓吹是自然的结果,那就是中国人吃蝙蝠呗,中国人是罪魁祸首 但病毒出现的时间,地点,人物都绝对完美,不觉得病毒有这么高智商,在中国中心,春节前夕自己出现了~
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erniuth
preprint出来很久了啊,这是正式发表了 就看结论就好了,不是人工的
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aoiqa
scripps 又不是野鸡研究所,算是美国最牛之一了。nature medicine又不是野鸡杂志,数顶刊之一了。真正学术大家都不感兴趣。

lilacxxt 发表于 3/18/2020 11:19:05 PM


这年头能静下心来看个paper的人都不多了。
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minqidev

有没有可能是人为加快了自然选择
按理和人亲和,要上百万次变异并且被人类基因试解锁才可以。蝙蝠又不是猫狗,哪里有机会这样变异?

Jimatssf 发表于 3/18/2020 11:32:01 PM


我认识的一些 做哮喘的教授,觉得是中国的环境特殊,瞎聊天的时候提到了。
中国有独一无二的地沟油;
中国有独一无二的抗生素滥用坏境,不管是人还是动物;
中国有独一无二的比较单一人种环境;
中国有独一无二的人口;
中国有独一无二的春运;中国还有独一无二的野生动物市场,能让非洲的穿山甲和北美的蝙蝠做邻居。
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xinlaide
外行看个热闹:以前的病毒(如sars)是怎么找到中间宿主的?对比以前的病毒,为什么新冠在找到中间宿主这个问题上这么难解决?
圆高高
因为没有中间宿主。 啊不,中间宿主是石正丽
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Seraphy82
记得以前有人提过周鹏的研究说,蝙蝠身上的病毒本来不容易感染人类,但几千种病毒在一起就有自然重组的可能性,重组后的病毒就可能容易感染别的生物。p3、p4研究所里面的蝙蝠那么多,携带着各种病毒,有没有可能给病毒重组提供更多的机会? 病毒有可能是天然的,但是是怎么传播给人类的?这是关键问题。
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sandbay
可以研究出是不是人工合成的,但很难拍出人工诱导进化,directed evolution, 在诱发突变的环境用selective pressure来选择想要的特性的病毒,可以把长期进化odds很低的strain很短时间内培养出来。
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minren
结论很明确:
"SARS-CoV-2不可能通过实验室操作相关的SARS-CoV样冠状病毒而出现。"
"证据表明,SARS-CoV-2不是故意操纵的病毒。"

It is improbable that SARS-CoV-2 emerged through laboratory manipulation of a related SARS-CoV-like coronavirus.
The evidence shows that SARS-CoV-2 is not a purposefully manipulated virus.
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Lavender_tutu
“We must therefore examine the possibility of an inadvertent laboratory release of SARS-CoV-2.” 文中还有上面这句⬆️。这是很明确的指出了可能的实验室疏忽性泄露。和之前huaren上推理出来的的一模一样!
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CleverBeaver
可以研究出是不是人工合成的,但很难拍出人工诱导进化,directed evolution, 在诱发突变的环境用selective pressure来选择想要的特性的病毒,可以把长期进化odds很低的strain很短时间内培养出来。
sandbay 发表于 3/19/2020 5:03:12 AM

就是这么个道理
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minren
“We must therefore examine the possibility of an inadvertent laboratory release of SARS-CoV-2.”
文中还有上面这句⬆️。这是很明确的指出了可能的实验室疏忽性泄露。和之前huaren上推理出来的的一模一样!
Lavender_tutu 发表于 3/19/2020 6:07:05 AM


也有可能
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Rubicon5
作者指出这个病毒不是通过分子生物学手段制成的。但是要注意他们还提出了三个自然选择模式,其中第三种最有意思,即在实验室的细胞培养过程中通过长期传代变异而来。虽然文章作者基本否认了这一可能性,要注意他们的理由很有意思。第一,在自然界产生的情形更符合奥卡姆原则;第二,如果是在实验室经过传代产生,需要有一个序列上很接近的前体,但是这一前提从未被报道过。 大家如果脑洞大开相信这一病毒来源于人工制造,说实话这篇文章还是没有彻底推翻这一可能。也许某个邪恶科学家手中有这一病毒前体,意识到它大有前途,所以未发表出来,而是直接上马在细胞培养中做选择。 3. Selection during passage Basic research involving passage of bat SARS-CoV-like coronaviruses in cell culture and/or animal models has been ongoing for many years in biosafety level 2 laboratories across the world27, and there are documented instances of laboratory escapes of SARS-CoV28. We must therefore examine the possibility of an inadvertent laboratory release of SARS-CoV-2. In theory, it is possible that SARS-CoV-2 acquired RBD mutations (Fig. 1a) during adaptation to passage in cell culture, as has been observed in studies of SARS-CoV11. The finding of SARS-CoV-like coronaviruses from pangolins with nearly identical RBDs, however, provides a much stronger and more parsimonious explanation of how SARS-CoV-2 acquired these via recombination or mutation19. The acquisition of both the polybasic cleavage site and predicted O-linked glycans also argues against culture-based scenarios. New polybasic cleavage sites have been observed only after prolonged passage of low-pathogenicity avian influenza virus in vitro or in vivo17. Furthermore, a hypothetical generation of SARS-CoV-2 by cell culture or animal passage would have required prior isolation of a progenitor virus with very high genetic similarity, which has not been described. Subsequent generation of a polybasic cleavage site would have then required repeated passage in cell culture or animals with ACE2 receptors similar to those of humans, but such work has also not previously been described. Finally, the generation of the predicted O-linked glycans is also unlikely to have occurred due to cell-culture passage, as such features suggest the involvement of an immune system18.
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happlen
看完了,大概是说Sars2不可能是从已知的病毒(如Sars、RaTG13)人工改造成的,原因主要有两点: 1. Sars2跟人的ACE2受体结合很好,但几个结合关键点和Sars并不一样,也和最优解不一样。 (我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那么这几个关键点应该要么和原病毒一致,要么弄成理论计算最优解。结果都不是) 2. Sars2的spike蛋白分两段,这与其他和它接近的病毒一样。但是Sars2两段之间加了点别的小片段(有的有点用,有的不知道有什么用),这在其他同类病毒里都没有见过。 (我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那很难想象干这事的人为什么要拍脑袋瓜想到往里面加这些小片段) 还有一些辅助性的原因,比如说常见的会用来人工操作beta冠状病毒的技术手段没见到被用上,小片段在实验室细胞环境中很难通过诱导突变创造出来。 所以作者相信病毒是自然的,相信终结宿主是蝙蝠。但是认为病毒之所以最后弄到人身上,还和人体适应,是有两种可能(两种都是基于自然选择): 1. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某种和人类似的动物(如ACE2受体和人类似的某种哺乳动物)。开始这个病毒可能只是弱弱的结合这种动物,弱弱的在动物间传播。动物密度可能很高,所以这个病毒传播了很多次,在传播过程中不断地突变。在无数次突变尝试后,终于有次运气好突变成差不多现在Sars2这个样子,可以很好的结合ACE2受体了,可以传播地很棒了,也渐渐进化出小片段们了。然后人类和染了病的某只或某群动物接触,就得上新冠肺炎了,又把Sars2传染给其他人类。 2. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某个人类。这时候的神秘病毒还很弱小,只能弱弱的结合人的ACE2,弱弱的传播给别的人类,形不成什么症状也没有被人发现。然后弱小的神秘病毒在人际间传播了很多次,在传播过程中不断突变。终于某次病毒运气好,突变成Sars2,跟人类ACE2结合特好,小片段也有了,能让人患病让人死了传播力还贼好,市场竞争力可比他的兄弟们(突变成其他状态的弱小神秘病毒)强多了。于是Sars2很快传播开了,变成今天这个局面。
田先生
石正丽被揭5年前造出一种杂交冠状病毒,可感染人呼吸道 http://www.chinatft.org/index/news/newsshow/id/6934/cate_id/newsshow.html
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CleverBeaver
看完了,大概是说Sars2不可能是从已知的病毒(如Sars、RaTG13)人工改造成的,原因主要有两点:
1. Sars2跟人的ACE2受体结合很好,但几个结合关键点和Sars并不一样,也和最优解不一样。
(我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那么这几个关键点应该要么和原病毒一致,要么弄成理论计算最优解。结果都不是)
2. Sars2的spike蛋白分两段,这与其他和它接近的病毒一样。但是Sars2两段之间加了点别的小片段(有的有点用,有的不知道有什么用),这在其他同类病毒里都没有见过。
(我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那很难想象干这事的人为什么要拍脑袋瓜想到往里面加这些小片段)
还有一些辅助性的原因,比如说常见的会用来人工操作beta冠状病毒的技术手段没见到被用上,小片段在实验室细胞环境中很难通过诱导突变创造出来。
所以作者相信病毒是自然的,相信终结宿主是蝙蝠。但是认为病毒之所以最后弄到人身上,还和人体适应,是有两种可能(两种都是基于自然选择):
1. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某种和人类似的动物(如ACE2受体和人类似的某种哺乳动物)。开始这个病毒可能只是弱弱的结合这种动物,弱弱的在动物间传播。动物密度可能很高,所以这个病毒传播了很多次,在传播过程中不断地突变。在无数次突变尝试后,终于有次运气好突变成差不多现在Sars2这个样子,可以很好的结合ACE2受体了,可以传播地很棒了,也渐渐进化出小片段们了。然后人类和染了病的某只或某群动物接触,就得上新冠肺炎了,又把Sars2传染给其他人类。
2. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某个人类。这时候的神秘病毒还很弱小,只能弱弱的结合人的ACE2,弱弱的传播给别的人类,形不成什么症状也没有被人发现。然后弱小的神秘病毒在人际间传播了很多次,在传播过程中不断突变。终于某次病毒运气好,突变成Sars2,跟人类ACE2结合特好,小片段也有了,能让人患病让人死了传播力还贼好,市场竞争力可比他的兄弟们(突变成其他状态的弱小神秘病毒)强多了。于是Sars2很快传播开了,变成今天这个局面。
happlen 发表于 3/19/2020 6:27:13 AM

2其实符合一开始可防可控
但是如果是这样的话,tg应该有在人类这里进化过之前的序列

这也解释了为什么舌吻专家提出了非舌吻不会传播

可是,我不知道这病毒的进化速度有没有这么快,还是正好某些特定因素加在一起结果变这样了?

有没有第三种可能,2其实不是在人体发生而是在猴子身上发生的?

因为有paper讲道老鼠的发病机理和我们不同

我还是持阴谋论,这些信息五毒所都知道,却从未提过,加上不让其他实验室提供病毒序列,还有就是无毒所事实上有传染病监控的项目(让人怀疑他们对于病毒在population的传染规模与探测其实很专业)
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camfis

SARS 15%还是青壮年,你怕不?

minqidev 发表于 3/18/2020 10:53:17 PM

15%青壮年是哪来的数据?全球死亡率不到10%,当然全靠厉害国不到7%的死亡率大力拉低了总的死亡率
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thetisea
几天前的吧?
就是说这个病毒吧,和已知序列都对不上。
而且变异得不尴不尬,还不是大杀器。
结论就是不是人工的,人工的比这要精致。
shoppingisfun 发表于 3/18/2020 10:26:05 PM

为什么不是人工水平不够?
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thetisea
无论结果是什么,希望科学家能还原真相。
cliu706 发表于 3/18/2020 10:47:26 PM

估计没办法还原真相
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happlen
你曲解了作者的意思。作者说是有实验室泄露的可能性,所以我们来研究研究,经研究发现不太可能是实验室泄露,而是自然演变。
“We must therefore examine the possibility of an inadvertent laboratory release of SARS-CoV-2.” 文中还有上面这句⬆️。这是很明确的指出了可能的实验室疏忽性泄露。和之前huaren上推理出来的的一模一样! Lavender_tutu 发表于 3/19/2020 6:07:00 AM
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shoppingisfun
回复 37楼CleverBeaver的帖子 “我还是持阴谋论,这些信息五毒所都知道,却从未提过,加上不让其他实验室提供病毒序列,还有就是无毒所事实上有传染病监控的项目(让人怀疑他们对于病毒在population的传染规模与探测其实很专业” 基本赞同你的看法。 病毒所自己的非典检测系统应该是整合在武汉卫建委之内,直报中央某部门,游离在中国CDC监测系统之外的,所以中国CDC看到微信转发的武汉非典大吃一惊,火速飞到武汉,而武汉卫建委极度不配合。而后来中国CDC也来了个大转弯,卫建委也扭扭捏捏说不人传人,明显压力来自更高层。 然而武汉卫建委探测到非典肺炎流行,此锅太大,对病毒所失去信任,火速交代上海测序。 这里有个细节,中国CDC说非典直报系统连云南都会偶尔报一两起,武汉在那期间一例没有。。。。。
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shoppingisfun

为什么不是人工水平不够?

thetisea 发表于 3/19/2020 7:54:08 AM


这个病毒框架没有报道过,又有很多奇怪的小插入,小突变,不太可能从已知病毒改造成的。
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chris009
ACE2 亲和位点只是一个方面。polybasic cleavage site 这个序列也是新的。人体蛋白如furin认出这个,剪短以后才有效。据说,传染力就是由这个决定的。
B
Beau
埃博拉这种杀伤性太强的传播范围不可能广,总体威胁不大
大杀器是埃博拉 minqidev 发表于 3/18/2020 10:39:00 PM
B
Beau
细思极恐 如果这个病毒这么容易突变而且会越突变越强,那经过这次全球大传播会突变成啥样啊……
所以作者相信病毒是自然的,相信终结宿主是蝙蝠。但是认为病毒之所以最后弄到人身上,还和人体适应,是有两种可能(两种都是基于自然选择): 1. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某种和人类似的动物(如ACE2受体和人类似的某种哺乳动物)。开始这个病毒可能只是弱弱的结合这种动物,弱弱的在动物间传播。动物密度可能很高,所以这个病毒传播了很多次,在传播过程中不断地突变。在无数次突变尝试后,终于有次运气好突变成差不多现在Sars2这个样子,可以很好的结合ACE2受体了,可以传播地很棒了,也渐渐进化出小片段们了。然后人类和染了病的某只或某群动物接触,就得上新冠肺炎了,又把Sars2传染给其他人类。 2. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某个人类。这时候的神秘病毒还很弱小,只能弱弱的结合人的ACE2,弱弱的传播给别的人类,形不成什么症状也没有被人发现。然后弱小的神秘病毒在人际间传播了很多次,在传播过程中不断突变。终于某次病毒运气好,突变成Sars2,跟人类ACE2结合特好,小片段也有了,能让人患病让人死了传播力还贼好,市场竞争力可比他的兄弟们(突变成其他状态的弱小神秘病毒)强多了。于是Sars2很快传播开了,变成今天这个局面。 happlen 发表于 3/19/2020 6:27:00 AM
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hibiscusad
真相来了,2019年8月17日,美国特里克堡生物武器研究基地无故关闭,900余名雇员居家隔离候命(请网查);2019年8月底开始,流感全美流行,肺炎泛滥美国人却怪罪于电子烟,至今死亡已近两万人(请网查);2019年10月23日,世界防止生物武器可核查机制签约仪式在维也纳举行,美国是唯一拒绝在可核查条约上签字的国家(请网查);2019年10月27日,美军参加武汉军运会运动员驻地酒店距离华南海鲜市场直线距离300米,首批42名确诊病人均与入住酒店员工有关,期间,美军5名运动员发热住进武汉金银潭医院,当时的《南方周末》正面视角进行了报道(请网查),目前,美军声称5名发热美军已全部死亡,致使WHO查找源头线索中断(请网查);中国的病毒全部属于C代基因序列,而无A、B代序列,美国则找到了A-E五代病毒基因序列。美军从不参加军运会,此次却破天荒派出142名运动员参赛,却没有拿到一枚金牌,不排除提前策划临时参赛嫁祸于中国;当前,美国新冠状患者想要进行病毒检测,医院居然无权决定,必须提前向FBI报告,FBI同意后才能检测,否则违法,而FBI只同意医院检测从中国回来的患者,无中国接触史的不予检测(请网查),将医学技术行为控制于FBI,旨在掩盖美国病源,实施将美国病源嫁祸于中国的秘密战略。再次强调,WHO主席唐德赛冒天下之大不韪竟然说出:“世界应当感谢中国”是事出有因的。
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hibiscusad
昨天夜里“叮”的被一声微信惊醒,迷糊中看到是国内最好的朋友发的,前几天就给我说这病毒是美国产的。我说,这你也信。但过后我家里人也都这么说,应该国内大多数人都这么认为了。现在好友又给我发了这个。大家看看
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eriecase
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minnielam
文章排除实验室来源(就是板上很喜欢瞎扯的人造病毒来源),并且认为来源途径两种:(1)感染人之前在动物宿主发生自然选择: 就是类似SARS,有中介宿主,病毒在宿主间变异,适应人体并且感染;(2)在人群中传播时进行自然选择:SARS-CoV-2的多元切割可能从动物传到人,并通过人传人的过程中变异获得。依据是如果病毒在2019年11月底到12月初就出现的话,如果有发生足够的人际感染,那么变异可能是经由人传人过程获得。
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ggbreeze
这个病本身不那么可怕,可它是多米诺骨牌第一张,后续的连锁反应比较吓人
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Lemm
看完了,大概是说Sars2不可能是从已知的病毒(如Sars、RaTG13)人工改造成的,原因主要有两点:
1. Sars2跟人的ACE2受体结合很好,但几个结合关键点和Sars并不一样,也和最优解不一样。
(我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那么这几个关键点应该要么和原病毒一致,要么弄成理论计算最优解。结果都不是)
2. Sars2的spike蛋白分两段,这与其他和它接近的病毒一样。但是Sars2两段之间加了点别的小片段(有的有点用,有的不知道有什么用),这在其他同类病毒里都没有见过。
(我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那很难想象干这事的人为什么要拍脑袋瓜想到往里面加这些小片段)
还有一些辅助性的原因,比如说常见的会用来人工操作beta冠状病毒的技术手段没见到被用上,小片段在实验室细胞环境中很难通过诱导突变创造出来。
所以作者相信病毒是自然的,相信终结宿主是蝙蝠。但是认为病毒之所以最后弄到人身上,还和人体适应,是有两种可能(两种都是基于自然选择):
1. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某种和人类似的动物(如ACE2受体和人类似的某种哺乳动物)。开始这个病毒可能只是弱弱的结合这种动物,弱弱的在动物间传播。动物密度可能很高,所以这个病毒传播了很多次,在传播过程中不断地突变。在无数次突变尝试后,终于有次运气好突变成差不多现在Sars2这个样子,可以很好的结合ACE2受体了,可以传播地很棒了,也渐渐进化出小片段们了。然后人类和染了病的某只或某群动物接触,就得上新冠肺炎了,又把Sars2传染给其他人类。
2. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某个人类。这时候的神秘病毒还很弱小,只能弱弱的结合人的ACE2,弱弱的传播给别的人类,形不成什么症状也没有被人发现。然后弱小的神秘病毒在人际间传播了很多次,在传播过程中不断突变。终于某次病毒运气好,突变成Sars2,跟人类ACE2结合特好,小片段也有了,能让人患病让人死了传播力还贼好,市场竞争力可比他的兄弟们(突变成其他状态的弱小神秘病毒)强多了。于是Sars2很快传播开了,变成今天这个局面。
happlen 发表于 3/19/2020 6:27:13 AM

这只说明了病毒不是实验室造。一点都没法否认,是不是武毒所的蝙蝠传给了他们做实验的猪,在猪中流传变异,最后传给人。也没办法否认是不是武毒所的蝙蝠传给了人,在人中流传变异。武毒所想撇清关系,麻烦抓个武汉蝙蝠来,看看和云南蝙蝠区别大不大。
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PT8964
https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9?from=singlemessage

SD的包子 发表于 3/18/2020 10:20:44 PM

这些人又不是做生物武器的,相当于外行。
那个赵建奎编辑的婴儿是不是只有几个编码突变?是不是就可以说都是自然的,没有人工干预?
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Lemm
武毒所那么多人没一个得病,一是消息得到早,防范好。二是搞不好都得过‘弱弱’版本有免疫了。从来不信病毒本身是他们造,说句损的,他们还没这能力和野心,敢捅这样的篓子。管理疏忽那是绝对可能。
景的童话

这只说明了病毒不是实验室造。一点都没法否认,是不是武毒所的蝙蝠传给了他们做实验的猪,在猪中流传变异,最后传给人。也没办法否认是不是武毒所的蝙蝠传给了人,在人中流传变异。武毒所想撇清关系,麻烦抓个武汉蝙蝠来,看看和云南蝙蝠区别大不大。

Lemm 发表于 3/19/2020 10:40:41 AM


蝙蝠只有武毒所有吗?大自然中没有吗?
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Lemm


蝙蝠只有武毒所有吗?大自然中没有吗?

景的童话 发表于 3/19/2020 10:47:16 AM

所以要看到底是从云南蝙蝠来的还是武汉蝙蝠来的呀。
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oioi
我觉得病毒本身是他们研究SARS或者啥的用的,是自然的,然后拿这些自然的病毒培养啊 改造一点点啊,玩儿啊,作啊,研究啊,然后这病毒泄露了,这也可以算自然的啊,人工的也不是说完全凭空造一个出来。
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chali1234

这些人又不是做生物武器的,相当于外行。
那个赵建奎编辑的婴儿是不是只有几个编码突变?是不是就可以说都是自然的,没有人工干预?

PT8964 发表于 3/19/2020 10:43:45 AM


你才是外行,CRISPR一般都用于成段的基因剪辑,只突变几个编码十分困难,单个位点的变异都是细胞培育选择性突变。
那个基因剪辑双胞胎是用CRISPR减掉32个碱基,防止HIV病毒的结合,这个基因测序一下就能看出来是人工编辑的结果。Lulu的基因检测结果少了15个碱基。
P
PT8964


你才是外行,CRISPR一般都用于成段的基因剪辑,只突变几个编码十分困难,单个位点的变异都是细胞培育选择性突变。
那个基因剪辑双胞胎是用CRISPR减掉32个碱基,防止HIV病毒的结合,这个基因测序一下就能看出来是人工编辑的结果。Lulu的基因检测结果少了15个碱基。

chali1234 发表于 3/19/2020 11:14:02 AM


看你就是外行。难道只有crisper可用吗?做生物武器的工具你都知道吗?30年前就可以用酵母人工拼接大基因,最近瑞典人也用酵母做出了武汉病毒。
还有细胞内病毒重组,转基因小鼠进化。2014年北卡大学和五毒所合作的文章是怎么做人工病毒的?

cripser不一定要来做病毒,但是我告诉你可以用来只编辑几个编码,你知道的太old了,有点跟不上了
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q2w3e4r5
1. 如果已经在动物中大规模传播,为什么到现在还没找出来中间动物是什么?能够大规模应该是很常见的动物啊?科学家们这么久都找不到? 2. 如果是弱小病毒传给人类,多次演化中成为现在的形态,那什么样的人有可能接触这个原始的弱小病毒?这个病毒是天然的还是人工的?如果是天然的什么概率可以偶尔接触(比如生吃深山老林里的蝙蝠)就能开启人类ACEII受体?
看完了,大概是说Sars2不可能是从已知的病毒(如Sars、RaTG13)人工改造成的,原因主要有两点: 1. Sars2跟人的ACE2受体结合很好,但几个结合关键点和Sars并不一样,也和最优解不一样。 (我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那么这几个关键点应该要么和原病毒一致,要么弄成理论计算最优解。结果都不是) 2. Sars2的spike蛋白分两段,这与其他和它接近的病毒一样。但是Sars2两段之间加了点别的小片段(有的有点用,有的不知道有什么用),这在其他同类病毒里都没有见过。 (我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那很难想象干这事的人为什么要拍脑袋瓜想到往里面加这些小片段) 还有一些辅助性的原因,比如说常见的会用来人工操作beta冠状病毒的技术手段没见到被用上,小片段在实验室细胞环境中很难通过诱导突变创造出来。 所以作者相信病毒是自然的,相信终结宿主是蝙蝠。但是认为病毒之所以最后弄到人身上,还和人体适应,是有两种可能(两种都是基于自然选择): 1. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某种和人类似的动物(如ACE2受体和人类似的某种哺乳动物)。开始这个病毒可能只是弱弱的结合这种动物,弱弱的在动物间传播。动物密度可能很高,所以这个病毒传播了很多次,在传播过程中不断地突变。在无数次突变尝试后,终于有次运气好突变成差不多现在Sars2这个样子,可以很好的结合ACE2受体了,可以传播地很棒了,也渐渐进化出小片段们了。然后人类和染了病的某只或某群动物接触,就得上新冠肺炎了,又把Sars2传染给其他人类。 2. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某个人类。这时候的神秘病毒还很弱小,只能弱弱的结合人的ACE2,弱弱的传播给别的人类,形不成什么症状也没有被人发现。然后弱小的神秘病毒在人际间传播了很多次,在传播过程中不断突变。终于某次病毒运气好,突变成Sars2,跟人类ACE2结合特好,小片段也有了,能让人患病让人死了传播力还贼好,市场竞争力可比他的兄弟们(突变成其他状态的弱小神秘病毒)强多了。于是Sars2很快传播开了,变成今天这个局面。
happlen 发表于 3/19/2020 6:27:13 AM
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chali1234


看你就是外行。难道只有crisper可用吗?做生物武器的工具你都知道吗?30年前就可以用酵母人工拼接大基因,最近瑞典人也用酵母做出了武汉病毒。
还有细胞内病毒重组,转基因小鼠进化。2014年北卡大学和五毒所合作的文章是怎么做人工病毒的?

cripser不一定要来做病毒,但是我告诉你可以用来只编辑几个编码,你知道的太old了,有点跟不上了

PT8964 发表于 3/19/2020 11:32:24 AM


内行你把工具说出来?连基因婴儿编辑了几个基因都不知道就出来装b
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q2w3e4r5
2020年3月9日,石正丽做客腾讯线上公益课堂称: 1.新型冠状病毒绝非人为制造; 2.华南海鲜市场的关闭确实给新冠病毒中间宿主的溯源带来了困难; 3.对于被质疑的蝙蝠中的冠状病毒是否可以直接感染人类的问题,石正丽表示其团队发现在与蝙蝠密切接触的人群里,检测到SARS冠状病毒的抗体,显示人类有被感染的痕迹,但这些人却没有任何临床症状。“这说明蝙蝠感染人的机会是有的,但概率较低,而且人体免疫系统能够清除病毒”; 4.她没有想到,新型蝙蝠SARS病毒就发生在2019年底,而且就在她生活的城市; 5.在其团队从蝙蝠提取出的12种冠状病毒中,SARS冠状病毒的传染性最强,其跨族群感染仍将是大概率事件,下一次新型冠状病毒仍有可能出现,应提前取做好预防;
1. 如果已经在动物中大规模传播,为什么到现在还没找出来中间动物是什么?能够大规模应该是很常见的动物啊?科学家们这么久都找不到? 2. 如果是弱小病毒传给人类,多次演化中成为现在的形态,那什么样的人有可能接触这个原始的弱小病毒?这个病毒是天然的还是人工的?如果是天然的什么概率可以偶尔接触(比如生吃深山老林里的蝙蝠)就能开启人类ACEII受体?

q2w3e4r5 发表于 3/19/2020 11:50:00 AM
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q2w3e4r5
同年11月9日,Baric实验室在《自然医学》杂志发表论文(石正丽为作者之一,主要提供SHC014刺突蛋白序列),将SARS与类似病毒SHC014刺突蛋白进行合成改造,该合成病毒可以利用与人类、果子狸,小鼠和蝙蝠直系同源ACE2细胞,在呼吸道原代细胞中有效复制增殖。文章称该合成病毒对呼吸道的感染比SARS弱,人传人潜在风险极大,老年动物更易感。 2018年4月5日,石正丽在《自然》杂志发表论文称在广东发生的猪瘟由SADS(猪急性腹泻综合征冠状病毒引起,与从广东菊头蝠样本所分离病毒的基因组序列一致性高达98%,与同为冠状病毒的SARS有可能重组;
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q2w3e4r5
这位做哮喘的教授是怎么解释正好出现在武汉的?是蝙蝠和病毒一到武汉就吸收了当地的灵气加速升级了嘛?


我认识的一些 做哮喘的教授,觉得是中国的环境特殊,瞎聊天的时候提到了。
中国有独一无二的地沟油;
中国有独一无二的抗生素滥用坏境,不管是人还是动物;
中国有独一无二的比较单一人种环境;
中国有独一无二的人口;
中国有独一无二的春运;中国还有独一无二的野生动物市场,能让非洲的穿山甲和北美的蝙蝠做邻居。

minqidev 发表于 3/19/2020 12:23:07 AM
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ninian
连猜带蒙的看完了,作者还是说需要找到具体的动物源 才能比较明白是怎么回事。所以一堆不同病毒的蝙蝠搞在一起互相撕杀最后产生一个新病毒也不是没可能,这也是自然演变的一种。还是觉得有人养蛊能讲得通。
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taipalengle
如果阴谋论的想,我说如果,一般制造病毒的人也不会傻到直接拼接改造病毒,也应该会通过再动物身上筛选并逐步诱导改造,不管诱导成啥样,只要毒力够就可以了,所以感觉还是不能排除阴谋论
提大提大
看完了,大概是说Sars2不可能是从已知的病毒(如Sars、RaTG13)人工改造成的,原因主要有两点:
1. Sars2跟人的ACE2受体结合很好,但几个结合关键点和Sars并不一样,也和最优解不一样。
(我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那么这几个关键点应该要么和原病毒一致,要么弄成理论计算最优解。结果都不是)
2. Sars2的spike蛋白分两段,这与其他和它接近的病毒一样。但是Sars2两段之间加了点别的小片段(有的有点用,有的不知道有什么用),这在其他同类病毒里都没有见过。
(我的理解,作者是想说,如果Sars2是从Sars、RaTG13之类的病毒改过去的,那很难想象干这事的人为什么要拍脑袋瓜想到往里面加这些小片段)
还有一些辅助性的原因,比如说常见的会用来人工操作beta冠状病毒的技术手段没见到被用上,小片段在实验室细胞环境中很难通过诱导突变创造出来。
所以作者相信病毒是自然的,相信终结宿主是蝙蝠。但是认为病毒之所以最后弄到人身上,还和人体适应,是有两种可能(两种都是基于自然选择):
1. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某种和人类似的动物(如ACE2受体和人类似的某种哺乳动物)。开始这个病毒可能只是弱弱的结合这种动物,弱弱的在动物间传播。动物密度可能很高,所以这个病毒传播了很多次,在传播过程中不断地突变。在无数次突变尝试后,终于有次运气好突变成差不多现在Sars2这个样子,可以很好的结合ACE2受体了,可以传播地很棒了,也渐渐进化出小片段们了。然后人类和染了病的某只或某群动物接触,就得上新冠肺炎了,又把Sars2传染给其他人类。
2. 开始有个人们尚未发现的神秘病毒,最初的宿主应该是蝙蝠,但是后来传给了某个人类。这时候的神秘病毒还很弱小,只能弱弱的结合人的ACE2,弱弱的传播给别的人类,形不成什么症状也没有被人发现。然后弱小的神秘病毒在人际间传播了很多次,在传播过程中不断突变。终于某次病毒运气好,突变成Sars2,跟人类ACE2结合特好,小片段也有了,能让人患病让人死了传播力还贼好,市场竞争力可比他的兄弟们(突变成其他状态的弱小神秘病毒)强多了。于是Sars2很快传播开了,变成今天这个局面。
happlen 发表于 3/19/2020 6:27:13 AM


这个要顶,赞解毒!!!
有两个问题:1. 如果这样推测的话,那病毒演化的过程中是否需要两个条件,一是中间宿主足够多(这个穿山甲应该不满足,存量很少了啊);二是演化时间足够长(就是说这个病毒从蝙蝠最终到人已经走了N久N久)。

如果是第一个的话,是不是可能有其他宿主?尤其是人类养殖的? 这样样本够大。
如果是第二个的话,是不是现在还有很多类似的病毒可能存在与中间宿主身上,还没最终走到人类身上?

谢谢层主
山地时间
我看到那个高密度动物可能是中间宿主的时候第一个反应是老鼠,我就不信大城市里面干净到没有老鼠了。
N
Namama
读文献的帖子WM和LYD都比较少啊

四楼讲的有点意思
提大提大 发表于 3/18/2020 11:09:29 PM


读文献完成不了他们的KPI,拿钱发帖带节奏的一群人,怎么可能会去读文献
K
Kissohkiss
以观后效
麻辣肚丝
居然替石正丽辩护,收钱了
s
shoppingisfun
的确。 看样子是nature medicine 收钱了。 看文章讨论还有点意思, conclusion哪有这么斩钉截铁的。
g
gem

一线医生都说这个病毒致死率没有SARS高,如果没有医疗挤兑,成活率很高的。二月中到武汉重症支援的医生说icu死亡率大概在百分之十几,这是医疗资源逐渐上来以后,早期武汉很惨的。

lilacxxt 发表于 3/18/2020 10:43:47 PM

Re, 觉得如果不是很多重症扎堆,医生来不及救,真的不可怕。
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xinlaide


这个要顶,赞解毒!!!
有两个问题:1. 如果这样推测的话,那病毒演化的过程中是否需要两个条件,一是中间宿主足够多(这个穿山甲应该不满足,存量很少了啊);二是演化时间足够长(就是说这个病毒从蝙蝠最终到人已经走了N久N久)。

如果是第一个的话,是不是可能有其他宿主?尤其是人类养殖的? 这样样本够大。
如果是第二个的话,是不是现在还有很多类似的病毒可能存在与中间宿主身上,还没最终走到人类身上?

谢谢层主

提大提大 发表于 3/19/2020 12:33:10 PM


回答这个问题,我们需要从哪些方面思考?
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shoppingisfun

Re, 觉得如果不是很多重症扎堆,医生来不及救,真的不可怕。

gem 发表于 3/19/2020 7:51:52 PM


这个和sars差了近20年呢,sars放现在,呼吸机+神药+ecmo,死亡率也不会比这个高。
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yaya12345
文章讨论了细胞培养逐渐传代积累突变的可能性,但是可能性很低。一种可能,动物传播,找到这种动物比较重要,因为如果找不到,有可能卷土重来。第二种可能性,早期动物传播,但是对人体影响不大,但是因为在人类中不断积累突变,导致形成了极优解,如果是这种情况,就不用担心从动物再次传播到人的可能。蝙蝠里面的病毒没有那个提高结合亲和力的突变,穿山甲的突变倒是比较相似,但是穿山甲的也没有那个polybasic cleavage sites。
山地时间 发表于 3/18/2020 11:36:35 PM


热热热
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Sunny111
谢谢分享!多少科学家在研究,人的力量还是很有限
麻辣肚丝
再顶一下这个。一堆搞阴谋论的不知怎么想的。很多台湾人各个论坛到处乱跳宣扬P4卖了死猴子。
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Shinlg
回帖的除了俺全是牛人
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EdwardVIII
可以研究出是不是人工合成的,但很难拍出人工诱导进化,directed evolution, 在诱发突变的环境用selective pressure来选择想要的特性的病毒,可以把长期进化odds很低的strain很短时间内培养出来。
sandbay 发表于 3/19/2020 5:03:12 AM

説到點子上了。中國有個研究說穿山甲是中間宿主,因爲在穿山甲上發現了非常像的病毒。問他們這穿山甲哪來的,回答是別人給的。這説明很有可能有人在動物上做人工選擇。這種選擇出來的當然不是實驗室合成的。
d
diandian1119
是自然的,但是也不能从武汉所泄漏的可能呀!他们从云南的蝙蝠分离出病毒株,有经过改造或没有改造,然后泄漏