热传的剑桥新冠病毒溯源报告 都有哪些问题?

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Toutiao
最新回复:2020年4月15日 13点52分 PT
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较真背景调查

要点:

1、剑桥大学的一项新研究发现,在人类中最早出现的原始版本的新冠病毒虽然出现在武汉,但是并没有大规模流行,而是在美国和澳大利亚更常见。相反地,在武汉流行的新冠病毒是原始版本变异而来的另一类型。

2、但是,该研究受到了很多质疑。作者只选取了已公开的6000余个新冠病毒基因组序列中的160个作为研究对象,其中最古老类型的病毒在美国和澳大利亚流行的样本量只有15个,代表欧洲广泛传播的病毒类型样本量只有11个,这种小规模样本得出的结论非常值得商榷。

3、此外,该项研究的研究方法新,且研究进行的前提“蝙蝠冠状病毒BatCovRaTG13就是新冠病毒在动物中的祖先”还只是假设并不是既定事实,所以研究结论并不能令人信服。再加上四个作者中有三个来自同一家庭,第三作者凭借自身学术影响力推动研究的发表,该研究更是受到了不少人的质疑。

4、新冠病毒遗传进化分析研究只能提供病毒出现的先后顺序的假设,并不能百分之百揭示病毒的起源地的这个问题。想要真正找到起源地,必须找到病毒的中间宿主,以及在疾病爆发地找到疾病最初爆发时病毒感染人类的证据。

查证者:韩越丨剑桥大学病毒学博士后

一、剑桥大学的研究说明了什么?

4月8日,剑桥大学研究人员在美国国家科学院院刊(PNAS)上发表了最新的关于新冠病毒(SARS-CoV-2)的几个变种和传播路径的研究报告。报告首先将一种与新冠病毒的同源性高达96.2%的蝙蝠冠状病毒(即BatCovRaTG13病毒,由中科院武汉病毒所石正丽团队发现),设定为新冠病毒在动物中的祖先,然后以此为参考,对全球采集的160 个完整的新冠病毒全基因组构建了新冠病毒的基因组发育网络。按照进化关系,样本中的新冠病毒分为了A、B、C三个类型。其中A类型与蝙蝠身上提取的病毒最为相似,属于更早版本的新冠病毒,B类型演化自A,C类型演化自B。

令研究人员意外的是,作为最古老类型的A类型病毒,在武汉只有极少数案例,且包括一个在武汉生活的美国人,A类型病毒更多地是在美国和澳大利亚流行。B类型病毒则是在中国境内流行的主要类型,并且没有传播出东亚地区。C类型病毒主要在欧洲,香港,新加坡,韩国等地爆发,且没有在中国大陆出现。

总结起来,该研究的结论是:在人类中最早出现的原始版本的新冠病毒A,虽然出现在武汉,但是并没有大规模流行,而是在美国和澳大利亚更常见。相反地,在武汉流行的新冠病毒是原始版本变异而来的B类型。这样的结论一出,引起了网友们的广泛讨论:这是不是说明新冠病毒其实起源于美国?后来才输入武汉?

160个新冠病毒基因组的系统发育网络,图源自论文

其实早在二月份,中国科学院西双版纳热带植物园郁文彬团队就发布了类似的研究成果。研究者对全球收集的93个新冠病毒基因组进行了分析,并对病毒的传播途径作出了推测:武汉华南海鲜市场不是新冠病毒的起源地,新冠病毒可能最早于去年11月中下旬就输入武汉,并开始人际传播,在华南海鲜市场加快了人际传播。

二、剑桥的新研究——争议不小,缺陷不少

对于剑桥大学发表的最新研究,在外国学者中也引起了不少的讨论,爱丁堡大学的分子遗传进化学家和病毒学家Andrew Rambout就表示,剑桥大学的这份研究在内容、结论和发表途径上,都存在很多缺陷。

Andrew Rambout对于剑桥大学的最新研究成果表示质疑

那么具体的争议都有哪些呢?

1、 大多数学者认为研究中涵盖的样本量太小了,不足以支持上述的结论

剑桥大学和西双版纳植物园发表的研究中所用到的病毒基因组序列都来自禽流感病毒GISAID数据库。GISAID数据库最早是用来分享禽流感病毒序列的,目的是方便研究者可以及时监控全球禽流感病毒的突变情况。自2019年底新冠肺炎疫情爆发以来,GISAID多了一个新的用途:供以研究者于第一时间分享新冠病毒的基因序列。

截至北京时间4月12日,GISAID中已经上传了6370个新冠病毒基因组序列,而剑桥这项研究中,作者只选取了其中的160个病毒序列作为研究对象。全球目前新冠肺炎的确诊人数已经接近180万,用160个病毒基因组来推断新冠病毒的起源和传播过程,显然不能让人信服。比如文中提到的最古老的A类型病毒,在美国和澳大利亚流行的样本量只有15个;代表欧洲广泛传播的C类型病毒的样本量只有11个。基于这种小规模样本的结论,显然非常值得商榷。

截止北京时间4月12日,GISAID中测序的新冠病毒基因组数量已经达到6370个

2、 剑桥大学的研究第二个值得商榷的地方是研究的方法和结论

研究中运用了单倍型网络(Haplotype network)的方法,分析了新冠病毒的基因的多态性。值得注意的是,单倍型网络在古生物演化中被广泛使用,比如用来分析人类起源,恐龙演化等问题。此次研究是第一次将单倍体网络的研究方法运用在了病毒的基因分析中,相应分析结果的准确性还需要进一步的验证。

研究中的理论假设也受到了很多质疑:在剑桥大学的研究中,研究人员将蝙蝠中已知与新冠病毒基因组相似性最高的冠状病毒(BatCovRaTG13病毒,相似度96.2%)设定为新冠病毒在动物中的祖先。也就是说作者假设,这株病毒就是新冠病毒在动物中的祖先,现在流行的新冠病毒都是这个BatCovRaTG13病毒的后代。打个比方,在剑桥大学的研究中,作者认定BatCovRaTG13是植物的根,现在流行于全球的新冠病毒是长在这个根上植物的茎和叶。虽然BatCovRaTG13和新冠病毒有96.2%的相似度,但是仍和现在的新冠病毒有1000多个碱基的不同,对于全基因组只是3万个碱基的新冠病毒来说,差异还是巨大的。所以并不能确定蝙蝠携带的冠状病毒BatCovRaTG13就是新冠病毒的直系祖先。在假设都值得商榷的情况下,研究结果自然也并不会让人信服。爱丁堡大学的Andrew Rambout教授更是直言,正是因为BatCovRaTG13这个假设上的错误,整个研究的结果也是完全错误的。

Andrew Rambout在twitter上表示,剑桥大学研究的假设是错误的

3、 很多人认为整个研究发表的过程也值得商榷

通过文章的作者列表可以看出,四个作者有三个作者都姓Forster,而且第一作者和第二作者是夫妻,第一作者和通讯作者是兄弟。虽然学术界将家人,夫妻的姓名放在同一篇文章里的现象并不少见,但是四个作者中有三个来自同一家庭的情景还是非常少见的。

而文章的第三作者,Colin Renfrew,其实是文章发表的主要推动者。Colin平时的主要研究方向是考古学,并不是病毒学,但却是院士级别的人物,在学术界非常有影响力。作为院士,除了常规向期刊投稿这一发表途径(submit),也可以利用自己的学术影响力主动向指定期刊投稿(contribute)。通常来讲,对于contribute文章的评审也不会像submit的文章那么严格。这次发表的研究,就是Colin利用自己的影响力,主动向PNAS期刊contribute的文章,文章的发表过程自然也受到了不少人的质疑。

剑桥大学研究的作者名单

最后想要提到的一点是,新冠病毒遗传进化分析这类的研究,只能提供病毒出现的先后顺序的假设,但是并不能百分之百揭示病毒的起源地的这个问题。想要真正揭开新冠病毒起源地的问题,必须回答两个关键问题:

1、 将新冠病毒传染给人类的中间宿主到底是什么?

2、 能否在疾病爆发地找到疾病最初爆发的时候病毒已经感染人类的证据(比如血清,人体组织标本等等)。

T
TRETY
1 楼
对样本的质疑很不专业。人家提供了取样方法。有本事就说出取样问题,说人家取样少算什么?多少算多?一亿个?
z
zymmailsr
2 楼
America virus
护国利刃
3 楼
它美爹都没发话质疑呢,狗就这么急着跳出来舔了?
h
hyz000
4 楼
病毒来源应该联合国派调查组去调查,随便的一篇论文说来源武汉实验室,美军传播都不科学和严谨,也不会被有学识人会认可的,那些只是假设.
观点与评论
5 楼
美国病毒世界第一。 狗粮=3毛被气得直满嘴喷粪, 傻眼!
贯军
6 楼
查什么查,查清楚了让吃裆中央屎的无毛阉狗怎么活?
w
whitecats
7 楼
"总结起来,该研究的结论是:在人类中最早出现的原始版本的新冠病毒A,虽然出现在武汉,但是并没有大规模流行,而是在美国和澳大利亚更常见。相反地,在武汉流行的新冠病毒是原始版本变异而来的B类型。这样的结论一出,引起了网友们的广泛讨论:这是不是说明新冠病毒其实起源于美国?后来才输入武汉?" 网友们脑残,明明是A在先,非要讨论为什么B在先?
乱世狗熊
8 楼
把P4實驗室建在中南海隔壁最安全😄不是開玩笑,只有建在那兒他們才會認真管理,反而不會出事兒。
s
ssmou
9 楼
头两点基本废话。科学研究总是基于假设的。不承认这个假设,大可以提出一个新的,然后推导出自己的结论。作者发表时间照顾到这个时间点以前尽可能多的样本;不然,都甭发文章了,等数据收集全了,黄花菜都凉了。
错错错错错
10 楼
查吧,越查越清楚
j
jimbon
11 楼
海鲜市场都拆了,最初的所有样本都销毁了,查也没用。现在就是靠这些人出来东扯一下西扯一下。
g
gjgig
12 楼
jimbon 你媽媽不但口交,還肛交,還獸交---我讓毛驢肏你媽. 管理員這個婊子養雜種,專門縱容毫無根據地造謠謾罵大陸, 6park 管理員. 你媽媽不但口交,還肛交,還獸交---我讓毛驢肏你媽. 你可以刪去我的帖子!你不斷地刪, 我不斷地送毛驢到你媽媽那裡肏你媽,那個萬人肏的下賤母豬.
g
gjgig
13 楼
乱世狗熊 你媽媽不但口交,還肛交,還獸交---我讓毛驢肏你媽. 管理員這個婊子養雜種,專門縱容毫無根據地造謠謾罵大陸, 6park 管理員. 你媽媽不但口交,還肛交,還獸交---我讓毛驢肏你媽. 你可以刪去我的帖子!你不斷地刪, 我不斷地送毛驢到你媽媽那裡肏你媽,那個萬人肏的下賤母豬.
g
gjgig
14 楼
贯军 你媽媽不但口交,還肛交,還獸交---我讓毛驢肏你媽.
J
Jagaa
15 楼
10楼,p4实验室在你家吧
乱世狗熊
16 楼
大家快来看看吧,最近五毛都疯掉了!!!
追风逐月
17 楼
你妈被人强奸不重要,你全家的女人被人强奸才重要。
e
execom
18 楼
新冠病毒应该是宠物传给人的,现在已经知道狗和老虎等哺乳动物可以感染新冠病毒,像美国的西方发达国家,用猫狗做为宠物已经有很长的历史了,猫狗出去野外活动的时候就有很大机会感染新冠病毒,然后,西方人和猫狗互舔,和西方人做爱,西方人应该早就被感染新冠病毒,可惜,他们的医疗资源不足,看病,治病又贵,所以流行自然疗法,健身,瑜伽。发烧感冒就当流感抗,所以历次病毒流行都是从美国等西方发达国家窜出,比如美国流出的艾滋病,N1H1,西班牙流感。如无例外,越来越多的证据表明这次的新冠病毒是从美国窜出来的。 川普为首的西方政客想把西方新冠病毒的损失推卸给中国,近来还利用华裔写手方婊为污蔑新冠病毒的中国起源推波助澜,借华人之手攻击中国政府甚至是海外华人。其手段是非常无耻卑劣的。 就算西方政府被误导了,那他们的科学家,医院,生化专家,情报机构,政府的相关人员在这几个月都做了些什么,他们的盟友都在干什么?不是说好了要互通情报的吗?都还没有换上华为的5g,监听就失灵啦? 他们为什么要西方民众不戴口罩,西方民众为什么都不听劝解,要聚会,要出门,反对戴口罩呢?中国医学专家早就有建议他们戴口罩,西方国家的不作为和西方民众的狂妄自大,特别是年轻人,他们要找死,能关中国的事吗? 还有现在中国有些城市已经立法禁止吃猫狗肉,这个完全的掩耳盗铃的做法,应该禁止动物和人混居,这些活生生的动物才是人类的过敏源和病毒的传染源。而不是禁吃猫狗肉,因为高温煮食,就能阻断病毒传染。韩国并没有因为疫情禁止吃猫狗肉。
霍顿
19 楼
操,剑桥作者本身都出来说了,是发源于中国
田丁
20 楼
请问,你是否生活在西方?“他们的医疗资源不足”的结论哪里来的。中国武汉,到疫情中期,全国支援,拥有的平均人口床位及ICU床位有没有欧美国家高?连政府调动的医疗队人数,有没有美国志愿参加的医护人员多?
明明88白白白
21 楼
我看病毒是从你嘴里窜出来的。
要紧的
22 楼
你的意思是说当年鼠疫是不是日本人制造的不重要?
g
givetome
23 楼
韩国并没有因为疫情禁止吃猫狗肉。
g
givetome
24 楼
回复20楼: 我看病毒是从你嘴里窜出来的。
p
peterwan
25 楼
军方化武实验室领先人类智商了,一旦领先永远领先,人类怎么死都不会明白
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wangguo0829
26 楼
呵呵了,这么快出来替你的美爹来洗白
追风逐月
27 楼
呵呵,美国现在很多医护人员都辞职不干了,说防护措施和设备不足,让他们上班就是叫他们去送死。 https://club.6parkbbs.com/life2/index.php?app=forum&act=threadview&tid=15424714 https://nypost.com/2020/04/07/cbs-clarifies-video-of-nurse-quitting-due-to-lack-of-coronavirus-masks/
w
w16982001
28 楼
剑桥大学还有什么脸面在学术界混?急功近利的浮躁心态!和中国的学术研究人员可以一拼!
渔阳汉子
29 楼
园子里的五毛狗为了区区几毛钱,丧尽天良、助纣为虐、颠倒黑白、造谣惑众,由于长期跪舔包子党的屎眼儿,弄的嘴巴太臭,整天什么“口交”、“肛交”、“兽交”,什么“你妈被奸”等等不一而足!水平之差太给包子党丢脸!
文歆
30 楼
搞政治阴谋的坏人说这报告是错的,但搞科学的人知道这个报告是对的