文 / 庄时利和神经科学硕士
核心提要：
1. 经历了第 5 波的最大疫情后，日本每日新增病例数断崖式下跌，从 9 月份日增近 2.8 万人，到 10 月 31 日仅 232 人，德尔塔病毒突然 " 神秘消退 "。
2. 日本国立遗传学研究所文章称，影响德尔塔病毒修复的变异酶发生了变化，病毒或趋于自然死亡。但从目前研究以及生物学的基本原理来看，事实并非如此，变异酶 nsp14 的突变不是日本疫情消退的主要原因。
3. 日本这轮疫情消退，主要还是因为其大规模接种疫苗时间比其他发达国家更晚，因此目前疫苗对日本人群保护力仍然处于巅峰状态。另外老年人群的高接种率（80~90 岁人群中有 94% 完成了全程接种），也是疫情曲线大规模回落的重要原因之一。
4. 对于疫情防控来说，疫苗和非药物干预措施（NPI）都很重要。日本专家也把疫情下降归功于导致感染扩大的因素消失、医疗危机改变人们的防疫对策、夜间出行人数减少、疫苗接种效果、天气影响这 5 大因素。但目前无法确定这些因素在疫情下降过程中的具体作用。
5. 随着疫苗保护力因时间推移而降低及各项社会管制措施放松，日本明年 2 月中旬仍可能经历下一波疫情高峰。与此同时，中国也要预防冬春新一轮病毒传播。
日本从 9 月份日增近 2.8 万人至 10 月 31 日的仅 200 多人，德尔塔病毒为何突然神秘消退，它去了哪里？
在经历了第 5 波有史以来最大的疫情后，日本的每日新增数量迅速回落。
10 月 31 日，日本新增感染人数 232 例，不到 8 月 21 日疫情最高峰时的 1/100，在 2 个月内的时间内，日本每日新增病例数断崖式下跌了。
从 2020 年 1 月中旬确诊第一例新冠病毒感染者，到 11 月 1 日，日本在这一场疫情中，共确诊了 172 万名感染者，死亡人数达到了 1.8 万人。
日本将近 2 年来的疫情，共分为 5 波，其中 7 月下旬开始的第 5 波感染力最大，感染人数和死亡人数达到了高峰。但进入 9 月中旬，原本一天感染者冲破 2.8 万人的日本，突然开始出现了大幅度跳水式下降。
导致日本第 5 波疫情的是德尔塔病毒，这个几乎给各国造成巨大麻烦的新冠变种病毒去哪里了？
即使在几个发达国家中，日本也是疫情下降最明显的国家，这背后的原因是什么？
日本国立遗传学研究所发表研究文章，宣称德尔塔病毒或趋于自然死亡？
首先我们先看互联网上最近热传的消息。
日本各大媒体报道说，日本国立遗传学研究所教授井之上逸朗在记者会上说，因为影响德尔塔病毒修复的变异酶发生了变化，病毒很可能就因此自然死亡。
具体来说，是一个叫 nsp14 的酶突变，导致病毒无法修复最终死亡。这是一个爆炸性的消息，如果属实，这将改变疫情的走向。这甚至意味着疫情即将结束。但事实真的如此吗？
这个消息目前在日本和中国的互联网传得非常多，然而我个人无法认同这个观点，从目前研究以及生物学的基本原理来看，nsp14 的突变并非日本疫情消退的主要原因。
先说说 nsp14 本身。
新冠病毒本身的结构往简单里说，就是核酸加上蛋白质外壳。而新冠病毒的蛋白质又分为结构蛋白（structure protein）和非结构蛋白（nonstructure protein，缩写就是 nsp）两部分。
结构蛋白就是我们听得比较多的 S 蛋白、N 蛋白等四种，它们是构成病毒颗粒所必须的蛋白质，而非结构蛋白有十几种，它们是病毒基因组编码的、在病毒复制过程中具有一定功能，但是不结合于病毒颗粒中的蛋白质。
nsp14 的全名叫做 "N 端 3 ’到 5 ’外切核酸酶（ExoNase），C 端 N7 甲基转移酶（N7-MTase）"，（可能有朋友看到这个名字已经晕了，可以直接跳到下一段），其 N 端结构域具有错误校正外切酶活性，主要在 RNA 复制和转录过程中进行校正，防止致死性突变（这个致死性指的是对病毒的致死性）的发生，而 C 端结构域负责给 mRNA 加帽。在病毒复制的过程中，nsp7、nsp8、nsp12 和 nsp14 四种非结构蛋白构成了 RdRp（RNA 依赖的 RNA 聚合酶），共同影响着病毒复制。而 nsp14 本身也可能出现突变，只不过并非所有突变都会导致 nsp14 的功能变化。
如果包括 nsp14 在内的复制酶发生重大突变，影响了病毒复制，那么变异病毒应当立即消失。然而，如果我们检测到大量携带突变 nsp14 的毒株，就表明这种变异病毒正在人群中广泛传播，并且在传播时病毒并不会死亡，而且能够保持感染能力。
这也就是说，"nsp14 的突变导致基因组上的变异不断累积，无法修复，最终导致病毒死亡 " 的假说，从病毒的进化和生存的角度来看是矛盾的，我们很难想象在众多不同的感染者中，这种 " 致命 " 的变异会同时或者在短时间内接连发生。
因为通常来说，对某个物种的致命突变出现时，这种突变不会在物种内扩散，而是迅速被淘汰，只有适应突变的生物才能活下去，自取灭亡的变异并不会同时大量出现，更不可能被我们大量检测到。
大规模接种疫苗相比各国较晚，可能是日本此波疫情消退的另一个原因？
那么，日本疫情消退的主要原因是什么呢？
其实并没有那么神秘。
先说说疫苗。
目前 77% 的日本民众至少接种一剂新冠疫苗，71% 完成全程接种，在老年人中疫苗接种率更高，80~90 岁人群中有 94% 完成了全程接种，即便在百岁老人中这个数字也有 86%。
这是疫情曲线大幅回落的重要原因之一。
然而，接种率并不能完全解释日本的疫情变化。
我们看看疫苗接种率和日本类似国家的情况。
- 西班牙，疫苗完全接种率 79%，每日新增 2000 例；
- 加拿大，疫苗完全接种率 74%，每日新增 2600 例；
- 意大利，疫苗完全接种率 72%，每日新增 4500 例；
- 英国，疫苗完全接种率 68%，每日新增 40000 例（这里没有多打一个零）。
所以日本的疫苗接种率，并不能完全解释它疫情的下降。但是，日本有一个比较特殊的地方，就是在这些发达国家里面，日本的大规模接种工作开展是比较晚的。
越来越多的研究表明，中和抗体水平会随着时间推移而下降，因此接种开始的越早，疫苗对人群的保护力就越低（不打加强针的情况下）；反之开始的越晚，保护力就越接近峰值。
因此目前疫苗对日本人群保护力仍然处于巅峰状态。在日本每 10 万人口中，未接种疫苗的感染者为 23.7 人，而完全接种后的感染者为 2 人。
这个数据是没有做分层（比如年龄、职业等）的，但如果直接计算有效率的话，我们可以发现疫苗在真实世界环境中的有效率高达 92%，这已经非常接近两个 mRNA 疫苗的 III 期临床试验数据，并且还是在德尔塔已成为日本主要毒株的情况。
日本政府组织专家研讨疫情下降原因，归功于这 5 大因素
虽然说在日本疫情大幅下降过程中，疫苗确实起到了很关键的作用。但是，对于疫情防控来说，疫苗和 NPI 都很重要。NPI 是非药物干预措施，例如勤洗手、戴口罩、保持社交距离，还有各种社会防控措施等。
日本厚生劳动省在 9 月底开了个会，专门讨论了疫情变化，与会专家认为，日本的疫情下降，可能归功于五点——
- 导致感染扩大的因素消失；
- 医疗危机改变人们的防疫对策；
- 夜间出行人数减少；
- 疫苗接种效果；
- 天气影响。
我们展开说一下：
1. 导致感染扩大的因素消失：
日本 7 月至 8 月之所以出现了疫情高峰，除了奥运会以外，还遇到了暑假、连休以及盂兰盆节（日本传统节日），这些休假导致了人群流动活跃，病毒更易扩散。目前这些因素都消失了。
2. 医疗危机改变人们的防疫对策：
日本疫情最高峰期间，出现了一些地区医疗资源饱和甚至挤兑的情况，导致一些感染者无法入院，甚至一些重症患者在家中去世。这些医疗危机消息的传出，使得公众在防疫方面不得不变得更加配合——因为作死可能真的会死。
3. 夜间出行人数减少：
由于紧急事态宣布，东京都 8 月中旬至 9 月下旬夜晚闹市区的人群数量比 7 月上旬减少了 25%~40%。如果根据疫苗接种状况划分的话，未接种疫苗人群在夜晚闹市区的下降预计更是高到 70%。
4. 疫苗接种效果：
这个我们上面也有提到了，我们在重点看下日本中青年人接种比例的快速上升。以 40~49 岁人群为例，在 8 月 1 日时只有 11.4% 的人完全接种，而在 1 个半月后的 9 月 30 日，这个数字迅速上升至 58.9%
5. 天气影响：
最后一个因素就是天气了。目前这一点未获得确认，但是有专家猜测日本的疫情下降跟温度和降雨也有关系，在炎热的夏季人们的户外活动减少，大都待在有空调的房间内，这样在室内接触导致船舶的机会就更多了。
但目前仍然无法确定以上这些因素在疫情下降的过程中，分别究竟起到了多大作用，这还需要进一步的研究。
德尔塔病毒仍会卷土重来？日本下一波高峰可能会是明年 2 月中旬，中国也要预防冬春新一波感染
整体而言，日本的疫情下降，主要还是近期疫苗大规模接种以及 NPI 措施综合所致。但是，随着疫苗保护力随时间推移而降低以及各项社会管制措施的放松，新一波疫情高峰还是有可能会到来的。根据东大研究人员的测算，日本下一波高峰可能会是明年 2 月中旬。
这里可以作为参考的一个例子就是以色列。
以色列曾经是全世界疫苗接种率最高的国家，而在快速的疫苗接种下，疫情曲线也很快被压平了，每日新增从 2 月份最高的每日 11000 例下降至两位数，并且持续了数月时间。
然而，随着社会防控措施的放松以及疫苗保护力下降，以色列的疫情在 6 月底时死灰复燃，并且在 9 月 8 日飙升至每日 22000 例，而这新一波的巨浪消退，还是得益于以色列加强针的接种。
根据以色列卫生部发表在 Lancet 杂志上超过 100 万人的真实世界保护力研究，这些人 接种第二剂均超过 5 个月，在接种第三剂后，疫苗对于预防有症状感染的保护力达到了 91%，对于预防重症的保护力达到了 92%。
因此虽然日本目前疫情控制很好，但是接下来还是可能面临较大的防控压力，而这种局面不仅仅是日本会有，我们国家也同样要面对。
在 11 月的第一天，全国已有将近 500 多例新增感染，随着冬天的来临，我们仍然有巨大的防控压力，另外有很多民众已经很早接种完两剂疫苗，目前体内的抗体已经有了较大程度下降，可能不足以有效防护传播力非常强的德尔塔。
疫苗的接种率是一方面，而疫苗带来的实际保护力是同样重要的另一方面。因此，对高危人群（如老年人、免疫缺陷人群、医务人员等）和接种超过 6 个月人群进行加强接种的必要性越来越高。同时，随着呼吸道传染病高发季节的来临，继续严格做好个人防护措施同样重要。
各国的防控经验、教训，以及对疫苗、疫情的研究都是互相参考借鉴的，取长补短，尊重科学，动态调整防疫策略，这是我们在这场疫情中学到的最重要的东西。
文 / 庄时利和神经科学硕士
核心提要：
1. 经历了第 5 波的最大疫情后，日本每日新增病例数断崖式下跌，从 9 月份日增近 2.8 万人，到 10 月 31 日仅 232 人，德尔塔病毒突然 " 神秘消退 "。
2. 日本国立遗传学研究所文章称，影响德尔塔病毒修复的变异酶发生了变化，病毒或趋于自然死亡。但从目前研究以及生物学的基本原理来看，事实并非如此，变异酶 nsp14 的突变不是日本疫情消退的主要原因。
3. 日本这轮疫情消退，主要还是因为其大规模接种疫苗时间比其他发达国家更晚，因此目前疫苗对日本人群保护力仍然处于巅峰状态。另外老年人群的高接种率（80~90 岁人群中有 94% 完成了全程接种），也是疫情曲线大规模回落的重要原因之一。
4. 对于疫情防控来说，疫苗和非药物干预措施（NPI）都很重要。日本专家也把疫情下降归功于导致感染扩大的因素消失、医疗危机改变人们的防疫对策、夜间出行人数减少、疫苗接种效果、天气影响这 5 大因素。但目前无法确定这些因素在疫情下降过程中的具体作用。
5. 随着疫苗保护力因时间推移而降低及各项社会管制措施放松，日本明年 2 月中旬仍可能经历下一波疫情高峰。与此同时，中国也要预防冬春新一轮病毒传播。
日本从 9 月份日增近 2.8 万人至 10 月 31 日的仅 200 多人，德尔塔病毒为何突然神秘消退，它去了哪里？
在经历了第 5 波有史以来最大的疫情后，日本的每日新增数量迅速回落。
10 月 31 日，日本新增感染人数 232 例，不到 8 月 21 日疫情最高峰时的 1/100，在 2 个月内的时间内，日本每日新增病例数断崖式下跌了。
从 2020 年 1 月中旬确诊第一例新冠病毒感染者，到 11 月 1 日，日本在这一场疫情中，共确诊了 172 万名感染者，死亡人数达到了 1.8 万人。
日本将近 2 年来的疫情，共分为 5 波，其中 7 月下旬开始的第 5 波感染力最大，感染人数和死亡人数达到了高峰。但进入 9 月中旬，原本一天感染者冲破 2.8 万人的日本，突然开始出现了大幅度跳水式下降。
导致日本第 5 波疫情的是德尔塔病毒，这个几乎给各国造成巨大麻烦的新冠变种病毒去哪里了？
即使在几个发达国家中，日本也是疫情下降最明显的国家，这背后的原因是什么？
日本国立遗传学研究所发表研究文章，宣称德尔塔病毒或趋于自然死亡？
首先我们先看互联网上最近热传的消息。
日本各大媒体报道说，日本国立遗传学研究所教授井之上逸朗在记者会上说，因为影响德尔塔病毒修复的变异酶发生了变化，病毒很可能就因此自然死亡。
具体来说，是一个叫 nsp14 的酶突变，导致病毒无法修复最终死亡。这是一个爆炸性的消息，如果属实，这将改变疫情的走向。这甚至意味着疫情即将结束。但事实真的如此吗？
这个消息目前在日本和中国的互联网传得非常多，然而我个人无法认同这个观点，从目前研究以及生物学的基本原理来看，nsp14 的突变并非日本疫情消退的主要原因。
先说说 nsp14 本身。
新冠病毒本身的结构往简单里说，就是核酸加上蛋白质外壳。而新冠病毒的蛋白质又分为结构蛋白（structure protein）和非结构蛋白（nonstructure protein，缩写就是 nsp）两部分。
结构蛋白就是我们听得比较多的 S 蛋白、N 蛋白等四种，它们是构成病毒颗粒所必须的蛋白质，而非结构蛋白有十几种，它们是病毒基因组编码的、在病毒复制过程中具有一定功能，但是不结合于病毒颗粒中的蛋白质。
nsp14 的全名叫做 "N 端 3 ’到 5 ’外切核酸酶（ExoNase），C 端 N7 甲基转移酶（N7-MTase）"，（可能有朋友看到这个名字已经晕了，可以直接跳到下一段），其 N 端结构域具有错误校正外切酶活性，主要在 RNA 复制和转录过程中进行校正，防止致死性突变（这个致死性指的是对病毒的致死性）的发生，而 C 端结构域负责给 mRNA 加帽。在病毒复制的过程中，nsp7、nsp8、nsp12 和 nsp14 四种非结构蛋白构成了 RdRp（RNA 依赖的 RNA 聚合酶），共同影响着病毒复制。而 nsp14 本身也可能出现突变，只不过并非所有突变都会导致 nsp14 的功能变化。
如果包括 nsp14 在内的复制酶发生重大突变，影响了病毒复制，那么变异病毒应当立即消失。然而，如果我们检测到大量携带突变 nsp14 的毒株，就表明这种变异病毒正在人群中广泛传播，并且在传播时病毒并不会死亡，而且能够保持感染能力。
这也就是说，"nsp14 的突变导致基因组上的变异不断累积，无法修复，最终导致病毒死亡 " 的假说，从病毒的进化和生存的角度来看是矛盾的，我们很难想象在众多不同的感染者中，这种 " 致命 " 的变异会同时或者在短时间内接连发生。
因为通常来说，对某个物种的致命突变出现时，这种突变不会在物种内扩散，而是迅速被淘汰，只有适应突变的生物才能活下去，自取灭亡的变异并不会同时大量出现，更不可能被我们大量检测到。
大规模接种疫苗相比各国较晚，可能是日本此波疫情消退的另一个原因？
那么，日本疫情消退的主要原因是什么呢？
其实并没有那么神秘。
先说说疫苗。
目前 77% 的日本民众至少接种一剂新冠疫苗，71% 完成全程接种，在老年人中疫苗接种率更高，80~90 岁人群中有 94% 完成了全程接种，即便在百岁老人中这个数字也有 86%。
这是疫情曲线大幅回落的重要原因之一。
然而，接种率并不能完全解释日本的疫情变化。
我们看看疫苗接种率和日本类似国家的情况。
- 西班牙，疫苗完全接种率 79%，每日新增 2000 例；
- 加拿大，疫苗完全接种率 74%，每日新增 2600 例；
- 意大利，疫苗完全接种率 72%，每日新增 4500 例；
- 英国，疫苗完全接种率 68%，每日新增 40000 例（这里没有多打一个零）。
所以日本的疫苗接种率，并不能完全解释它疫情的下降。但是，日本有一个比较特殊的地方，就是在这些发达国家里面，日本的大规模接种工作开展是比较晚的。
越来越多的研究表明，中和抗体水平会随着时间推移而下降，因此接种开始的越早，疫苗对人群的保护力就越低（不打加强针的情况下）；反之开始的越晚，保护力就越接近峰值。
因此目前疫苗对日本人群保护力仍然处于巅峰状态。在日本每 10 万人口中，未接种疫苗的感染者为 23.7 人，而完全接种后的感染者为 2 人。
这个数据是没有做分层（比如年龄、职业等）的，但如果直接计算有效率的话，我们可以发现疫苗在真实世界环境中的有效率高达 92%，这已经非常接近两个 mRNA 疫苗的 III 期临床试验数据，并且还是在德尔塔已成为日本主要毒株的情况。
日本政府组织专家研讨疫情下降原因，归功于这 5 大因素
虽然说在日本疫情大幅下降过程中，疫苗确实起到了很关键的作用。但是，对于疫情防控来说，疫苗和 NPI 都很重要。NPI 是非药物干预措施，例如勤洗手、戴口罩、保持社交距离，还有各种社会防控措施等。
日本厚生劳动省在 9 月底开了个会，专门讨论了疫情变化，与会专家认为，日本的疫情下降，可能归功于五点——
- 导致感染扩大的因素消失；
- 医疗危机改变人们的防疫对策；
- 夜间出行人数减少；
- 疫苗接种效果；
- 天气影响。
我们展开说一下：
1. 导致感染扩大的因素消失：
日本 7 月至 8 月之所以出现了疫情高峰，除了奥运会以外，还遇到了暑假、连休以及盂兰盆节（日本传统节日），这些休假导致了人群流动活跃，病毒更易扩散。目前这些因素都消失了。
2. 医疗危机改变人们的防疫对策：
日本疫情最高峰期间，出现了一些地区医疗资源饱和甚至挤兑的情况，导致一些感染者无法入院，甚至一些重症患者在家中去世。这些医疗危机消息的传出，使得公众在防疫方面不得不变得更加配合——因为作死可能真的会死。
3. 夜间出行人数减少：
由于紧急事态宣布，东京都 8 月中旬至 9 月下旬夜晚闹市区的人群数量比 7 月上旬减少了 25%~40%。如果根据疫苗接种状况划分的话，未接种疫苗人群在夜晚闹市区的下降预计更是高到 70%。
4. 疫苗接种效果：
这个我们上面也有提到了，我们在重点看下日本中青年人接种比例的快速上升。以 40~49 岁人群为例，在 8 月 1 日时只有 11.4% 的人完全接种，而在 1 个半月后的 9 月 30 日，这个数字迅速上升至 58.9%
5. 天气影响：
最后一个因素就是天气了。目前这一点未获得确认，但是有专家猜测日本的疫情下降跟温度和降雨也有关系，在炎热的夏季人们的户外活动减少，大都待在有空调的房间内，这样在室内接触导致船舶的机会就更多了。
但目前仍然无法确定以上这些因素在疫情下降的过程中，分别究竟起到了多大作用，这还需要进一步的研究。
德尔塔病毒仍会卷土重来？日本下一波高峰可能会是明年 2 月中旬，中国也要预防冬春新一波感染
整体而言，日本的疫情下降，主要还是近期疫苗大规模接种以及 NPI 措施综合所致。但是，随着疫苗保护力随时间推移而降低以及各项社会管制措施的放松，新一波疫情高峰还是有可能会到来的。根据东大研究人员的测算，日本下一波高峰可能会是明年 2 月中旬。
这里可以作为参考的一个例子就是以色列。
以色列曾经是全世界疫苗接种率最高的国家，而在快速的疫苗接种下，疫情曲线也很快被压平了，每日新增从 2 月份最高的每日 11000 例下降至两位数，并且持续了数月时间。
然而，随着社会防控措施的放松以及疫苗保护力下降，以色列的疫情在 6 月底时死灰复燃，并且在 9 月 8 日飙升至每日 22000 例，而这新一波的巨浪消退，还是得益于以色列加强针的接种。
根据以色列卫生部发表在 Lancet 杂志上超过 100 万人的真实世界保护力研究，这些人 接种第二剂均超过 5 个月，在接种第三剂后，疫苗对于预防有症状感染的保护力达到了 91%，对于预防重症的保护力达到了 92%。
因此虽然日本目前疫情控制很好，但是接下来还是可能面临较大的防控压力，而这种局面不仅仅是日本会有，我们国家也同样要面对。
在 11 月的第一天，全国已有将近 500 多例新增感染，随着冬天的来临，我们仍然有巨大的防控压力，另外有很多民众已经很早接种完两剂疫苗，目前体内的抗体已经有了较大程度下降，可能不足以有效防护传播力非常强的德尔塔。
疫苗的接种率是一方面，而疫苗带来的实际保护力是同样重要的另一方面。因此，对高危人群（如老年人、免疫缺陷人群、医务人员等）和接种超过 6 个月人群进行加强接种的必要性越来越高。同时，随着呼吸道传染病高发季节的来临，继续严格做好个人防护措施同样重要。
各国的防控经验、教训，以及对疫苗、疫情的研究都是互相参考借鉴的，取长补短，尊重科学，动态调整防疫策略，这是我们在这场疫情中学到的最重要的东西。