图片来源：摄图网
4月8号，国际知名学术期刊《美国科学院院报》发表了一篇题为《冠状病毒基因组谱系分析》（《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》）的研究报告（以下简称新冠病毒变种报告）。这份新冠病毒变种报告分析了从病患身上取得的前160份完整病毒基因组，得出新冠病毒通过突变产生的不同病毒谱系：全球的新冠病毒已经变异为A、B、C三种类型。
其中较为原始的毒株A型与在蝙蝠身上发现的毒株最接近，而A型更常出现在美国和澳洲感染者身上，在武汉更常见的是从A型突变的B型毒株。另外，由B型变异而来的C型主要出现在欧洲。
“由此是否说明新冠病毒起源于美国？”这样的猜测在社交媒体平台甚嚣尘上，上述研究的第一作者，剑桥大学遗传学家彼得•福斯特（Peter Forster）教授只得不断解释，“目前仍无法就病毒的起源地给出一个明确的答案。”
春节前，最初发现的新冠肺炎病例被指与武汉华南海鲜批发市场有关，当地政府很快将其关闭。随着疫情在武汉当地快速传播，该市场随即被曝出长期存在非法售卖野生动物的现象。
然而，《柳叶刀》随后刊发的一篇研究指出，第一位被诊断出感染新冠肺炎的病例与华南海鲜市场“没有关联”。“病毒猎手”利普金3月在接受媒体访谈时也表示，“在武汉华南海鲜市场内发生的是二次传播，很可能这种病毒在早些时候就已经开始扩散了。”
当新冠病毒开始在驶向日本横滨港的钻石公主号上被发现，在韩国大邱集会的人群中被发现，在意大利、西班牙、英国、美国，甚至全球被发现后，研究者得以从数量众多的感染病例中提取到更多的新冠病毒基因组。
至此，大众关于新冠病毒最初出现的时间和地点出现了诸多猜测，每一份证明新冠病毒在当地早于去年12月已出现的研究，都将“病毒起源地”的讨论推至白热化。
谁是零号病人？谁是中间宿主？哪里才是新冠病毒的起源地？关于“新冠病毒起源”的这三大疑问萦绕在所有人脑中。为此，《每日经济新闻》记者（以下简称NBD）专访了新冠病毒变种报告第一作者彼得•福斯特（Peter Forster）教授，听听作者讲述这一研究的意义究竟何在。
病毒起源说含三层意义
NBD：您和团队发表的这篇关于新冠病毒基因组的分析引发了有关病毒起源地的讨论，请问团队起初着手这项研究，目的是要揭开新冠病毒的什么“未知之谜”？
彼得•福斯特教授：早在2月份的时候，我们就开始起草研究手稿。而引发出的一些争议并非我们开展此研究的目的。在这样一场大流行病中，全球应该一齐行动。
团队做这项研究的一个关键目标是鉴定新冠病毒基因组的原始版（ancestral virus genome），以及重建临近疫情爆发时，突变和病毒变体的进化树。我们希望这项基础研究能被用于应用科学，例如，当我们理解了病毒究竟是变得更强又或是更弱了，这有助于解释临床反应上的差异。
NBD：在之前的一则媒体访谈中，您提到目前仍无法就病毒的起源地给出一个明确的答案。关于新冠病毒究竟起源哪里，如今还无法解答这一问题的难点在哪里？
彼得•福斯特教授：“起源”有几层含义。
1、宿主种类。目前推测新冠病毒的自然宿主可能是蝙蝠，或许和穿山甲有关，而关于新冠病毒的宿主研究已经有研究小组在开展。
2、“起源”还可以指人类身上传播的新冠病毒基因组的原始版，这正是我们在《美国科学院院报》发表这篇研究的重点。我们已经确定了A型新冠病毒是原始类型。
如果我们有更多的蝙蝠冠状病毒基因组，以及更多的在2019年12月前从感染者样本中分离出的新冠病毒基因组，那么就这一层意义的“起源”，还可能得到进一步精确。
3、“起源”的第三个含义是地理上的。我们发现，一些A型新冠病毒出现在武汉及周边地区感染者的身上，但并不是所有最原始的A型新冠病毒都来自该地区，这一证据仅说明武汉及周边地区存在早期传播。
NBD：在这份研究报告中，您的团队发现，在武汉、中国乃至东亚地区被更多发现的是A型新冠病毒的变异版，即B型新冠病毒。而A型病毒，则被更多地发现于美国和澳大利亚的病例中，其中早期的美国病例有在武汉居住旅行的历史。
上述研究结果无法直接定论病毒的起源地，我们该如何进一步理解这一结果？说明了什么？出现上述结果的原因，仅仅是有关病毒与当地人免疫系统之间的作用吗？
彼得•福斯特教授：在我看来，这（与当地人的免疫系统有关）是一种可能性，应当使用临床数据进行调查以最终解释。如果中国和其他国家的研究者能够利用我们有关病毒变种的这份研究结果，辅之以他们的临床数据，看看不同的病毒类型是否与病人不同的临床特征（潜伏期、恢复时间、死亡率、病程等）相关，那将会很有用。
NBD：研究中提到新冠病毒在中国以外的地区变异速度更快，这是为何？
彼得•福斯特教授：一种可能的解释是，病毒需要适应不同的人群，他们具有不同的免疫系统和不同的等位基因。或者，也许病毒的变异与不同临床结果（之间的关联）是微弱的，仅仅反映了不同水平的温度、湿度、紫外线辐射或其他环境因素的影响。
基因组谱系分析可加速对感染源的搜寻
NBD：您和其他学者目前还完成了一项涉及1001个病毒基因样本的分析，发现新冠病毒最初感染人类的时间大致在2019年9月13日至2019年12月7日这个区间。为何9月中旬至12月初没有大批感染者去医院？是因为那时候的感染者都是无症状感染者吗？
彼得•福斯特教授：这是一种可能性（无症状感染者居多）。另一种可能是，在指数增长之初，数字（被感染的人数）很低，并没有引起太多关注。
NBD：您和团队在新冠病毒变种报告中提到，研究结果可以帮助识别无记录的新冠肺炎感染源，然后进行隔离，以遏制该疾病在世界范围内进一步传播。具体而言，请问这份研究能如何帮助识别无记录的感染源？
彼得•福斯特教授：以意大利的初期感染为例。意大利的1号病人是一名38岁的意大利人，该感染者认为自己可能是从一位去过武汉的朋友那里感染的。然而，对其朋友进行的几次新冠病毒测试，结果都呈阴性。当地在寻找传染源的过程中，时间流逝，很快新冠肺炎开始在意大利传播。
据我们的基因网络，意大利最早的感染案例或可追溯至1月27日被通报感染的一名德国患者，另一名初期的意大利感染病例则与“新加坡感染群”有关。
基因组谱系分析加速了对感染源的搜寻，从而保证有效的隔离。当各国解除封锁后，以及需要追踪和隔离来源不明的零星疫情时，这一应用程序可能很快就会变得重要起来。
NBD：在新冠病毒变种报告中，最后就其用途写道，可以在评估新冠病毒感染后的临床结果上发挥作用，还能在治疗方案设计和疫苗研发上有所建树。这份研究报告将加速目前如火如荼的疫苗研发进程吗？
彼得•福斯特教授：这是我们目前正在考虑的事情，我们是否能够作为一个跨学科团队来做出贡献，这将取决于合作者和资金。
图片来源：摄图网
4月8号，国际知名学术期刊《美国科学院院报》发表了一篇题为《冠状病毒基因组谱系分析》（《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》）的研究报告（以下简称新冠病毒变种报告）。这份新冠病毒变种报告分析了从病患身上取得的前160份完整病毒基因组，得出新冠病毒通过突变产生的不同病毒谱系：全球的新冠病毒已经变异为A、B、C三种类型。
其中较为原始的毒株A型与在蝙蝠身上发现的毒株最接近，而A型更常出现在美国和澳洲感染者身上，在武汉更常见的是从A型突变的B型毒株。另外，由B型变异而来的C型主要出现在欧洲。
“由此是否说明新冠病毒起源于美国？”这样的猜测在社交媒体平台甚嚣尘上，上述研究的第一作者，剑桥大学遗传学家彼得•福斯特（Peter Forster）教授只得不断解释，“目前仍无法就病毒的起源地给出一个明确的答案。”
春节前，最初发现的新冠肺炎病例被指与武汉华南海鲜批发市场有关，当地政府很快将其关闭。随着疫情在武汉当地快速传播，该市场随即被曝出长期存在非法售卖野生动物的现象。
然而，《柳叶刀》随后刊发的一篇研究指出，第一位被诊断出感染新冠肺炎的病例与华南海鲜市场“没有关联”。“病毒猎手”利普金3月在接受媒体访谈时也表示，“在武汉华南海鲜市场内发生的是二次传播，很可能这种病毒在早些时候就已经开始扩散了。”
当新冠病毒开始在驶向日本横滨港的钻石公主号上被发现，在韩国大邱集会的人群中被发现，在意大利、西班牙、英国、美国，甚至全球被发现后，研究者得以从数量众多的感染病例中提取到更多的新冠病毒基因组。
至此，大众关于新冠病毒最初出现的时间和地点出现了诸多猜测，每一份证明新冠病毒在当地早于去年12月已出现的研究，都将“病毒起源地”的讨论推至白热化。
谁是零号病人？谁是中间宿主？哪里才是新冠病毒的起源地？关于“新冠病毒起源”的这三大疑问萦绕在所有人脑中。为此，《每日经济新闻》记者（以下简称NBD）专访了新冠病毒变种报告第一作者彼得•福斯特（Peter Forster）教授，听听作者讲述这一研究的意义究竟何在。
病毒起源说含三层意义
NBD：您和团队发表的这篇关于新冠病毒基因组的分析引发了有关病毒起源地的讨论，请问团队起初着手这项研究，目的是要揭开新冠病毒的什么“未知之谜”？
彼得•福斯特教授：早在2月份的时候，我们就开始起草研究手稿。而引发出的一些争议并非我们开展此研究的目的。在这样一场大流行病中，全球应该一齐行动。
团队做这项研究的一个关键目标是鉴定新冠病毒基因组的原始版（ancestral virus genome），以及重建临近疫情爆发时，突变和病毒变体的进化树。我们希望这项基础研究能被用于应用科学，例如，当我们理解了病毒究竟是变得更强又或是更弱了，这有助于解释临床反应上的差异。
NBD：在之前的一则媒体访谈中，您提到目前仍无法就病毒的起源地给出一个明确的答案。关于新冠病毒究竟起源哪里，如今还无法解答这一问题的难点在哪里？
彼得•福斯特教授：“起源”有几层含义。
1、宿主种类。目前推测新冠病毒的自然宿主可能是蝙蝠，或许和穿山甲有关，而关于新冠病毒的宿主研究已经有研究小组在开展。
2、“起源”还可以指人类身上传播的新冠病毒基因组的原始版，这正是我们在《美国科学院院报》发表这篇研究的重点。我们已经确定了A型新冠病毒是原始类型。
如果我们有更多的蝙蝠冠状病毒基因组，以及更多的在2019年12月前从感染者样本中分离出的新冠病毒基因组，那么就这一层意义的“起源”，还可能得到进一步精确。
3、“起源”的第三个含义是地理上的。我们发现，一些A型新冠病毒出现在武汉及周边地区感染者的身上，但并不是所有最原始的A型新冠病毒都来自该地区，这一证据仅说明武汉及周边地区存在早期传播。
NBD：在这份研究报告中，您的团队发现，在武汉、中国乃至东亚地区被更多发现的是A型新冠病毒的变异版，即B型新冠病毒。而A型病毒，则被更多地发现于美国和澳大利亚的病例中，其中早期的美国病例有在武汉居住旅行的历史。
上述研究结果无法直接定论病毒的起源地，我们该如何进一步理解这一结果？说明了什么？出现上述结果的原因，仅仅是有关病毒与当地人免疫系统之间的作用吗？
彼得•福斯特教授：在我看来，这（与当地人的免疫系统有关）是一种可能性，应当使用临床数据进行调查以最终解释。如果中国和其他国家的研究者能够利用我们有关病毒变种的这份研究结果，辅之以他们的临床数据，看看不同的病毒类型是否与病人不同的临床特征（潜伏期、恢复时间、死亡率、病程等）相关，那将会很有用。
NBD：研究中提到新冠病毒在中国以外的地区变异速度更快，这是为何？
彼得•福斯特教授：一种可能的解释是，病毒需要适应不同的人群，他们具有不同的免疫系统和不同的等位基因。或者，也许病毒的变异与不同临床结果（之间的关联）是微弱的，仅仅反映了不同水平的温度、湿度、紫外线辐射或其他环境因素的影响。
基因组谱系分析可加速对感染源的搜寻
NBD：您和其他学者目前还完成了一项涉及1001个病毒基因样本的分析，发现新冠病毒最初感染人类的时间大致在2019年9月13日至2019年12月7日这个区间。为何9月中旬至12月初没有大批感染者去医院？是因为那时候的感染者都是无症状感染者吗？
彼得•福斯特教授：这是一种可能性（无症状感染者居多）。另一种可能是，在指数增长之初，数字（被感染的人数）很低，并没有引起太多关注。
NBD：您和团队在新冠病毒变种报告中提到，研究结果可以帮助识别无记录的新冠肺炎感染源，然后进行隔离，以遏制该疾病在世界范围内进一步传播。具体而言，请问这份研究能如何帮助识别无记录的感染源？
彼得•福斯特教授：以意大利的初期感染为例。意大利的1号病人是一名38岁的意大利人，该感染者认为自己可能是从一位去过武汉的朋友那里感染的。然而，对其朋友进行的几次新冠病毒测试，结果都呈阴性。当地在寻找传染源的过程中，时间流逝，很快新冠肺炎开始在意大利传播。
据我们的基因网络，意大利最早的感染案例或可追溯至1月27日被通报感染的一名德国患者，另一名初期的意大利感染病例则与“新加坡感染群”有关。
基因组谱系分析加速了对感染源的搜寻，从而保证有效的隔离。当各国解除封锁后，以及需要追踪和隔离来源不明的零星疫情时，这一应用程序可能很快就会变得重要起来。
NBD：在新冠病毒变种报告中，最后就其用途写道，可以在评估新冠病毒感染后的临床结果上发挥作用，还能在治疗方案设计和疫苗研发上有所建树。这份研究报告将加速目前如火如荼的疫苗研发进程吗？
彼得•福斯特教授：这是我们目前正在考虑的事情，我们是否能够作为一个跨学科团队来做出贡献，这将取决于合作者和资金。